FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0744.ptfa, 573 aa vs ./tmplib.26680 library 1768444 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2217+/-0.00475; mu= 14.4951+/- 0.318 mean_var=106.5820+/-24.847, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 9 in 1/35 Lambda= 0.1242 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0600 ( 917 res) mbg03056a ( 917) 2250 414 2.5e-116 mFLJ00062 ( 852 res) mpm11169 ( 852) 1420 265 1.4e-71 >>mKIAA0600 ( 917 res) mbg03056a (917 aa) initn: 2239 init1: 2061 opt: 2250 Z-score: 2180.9 bits: 414.1 E(): 2.5e-116 Smith-Waterman score: 2250; 59.428% identity (62.589% ungapped) in 594 aa overlap (1-573:333-917) 10 20 mKIAA0 EQLKQPGSHLEEAEEEL---------QGDQ : .:: .: ::.:::: .: mKIAA0 QLVMQQQHQQFLEKQKQQQMQLGKILTKTGELSRQPTTHPEETEEELTEQQEALLGEGAL 310 320 330 340 350 360 30 40 50 60 70 mKIAA0 SMEDRAASKDNSARSD--SSACVEDTLGQVGAVKVKEEPVDS--DEDAQIQEMECGEQAA .. .......:.. : :. . ..::.: .: :: ...: : . mKIAA0 TIPREGSTESESTQEDLEEEEEEEEEEEEEDCIQVKDEDGESGPDEGPDLEESSAGYKKL 370 380 390 400 410 420 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 FMQQPPLLESSRARSLSVHQTLAAVGTDGLEKHGLLSRTHSSPAASMSPHPAADCPR--Q : . : . :.:.:. ...: : :.::.::::: : . .: : . mKIAA0 FADAQQL------QPLQVYQAPLSLAT---VPHQALGRTQSSPAAPGSMKSPTDQPTVVK 430 440 450 460 470 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 PSSATGIAYDPLMLKHQCICGSSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIQGRKASLE .::..:: .::::::.::.. .:::::::::::::::::::::.:::::.::::.:. mKIAA0 HLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLGKCERIRGRKATLD 480 490 500 510 520 530 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 EIQLVHSEHHSLLYGTSPLDGQKLDPRTLLGDDSRKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSS ::: ::::.:.::::::::. :::: . ::: :.:... :::::.::::::.:::.::: mKIAA0 EIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAMLPCGGIGVDSDTVWNEMHSS 540 550 560 570 580 590 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 GAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESAAMGFCFFNSVAITAKYLRDQ .:.::::::..::: :::.::::::::..::::::::::.::::::::::::::: :... mKIAA0 SAVRMAVGCLVELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQK 600 610 620 630 640 650 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 LNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEVGVGLGEGY :...:.:::: :.::::::::::: :::.:::::::::.::::::::::.::: : : :: mKIAA0 LSVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGY 660 670 680 690 700 710 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 NVNIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTVVMPVAREFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKV :::.:::::.:::.:::::: ::::::::.:.::.::.:::::::::.::: :::::.: mKIAA0 NVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAQEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSV 720 730 740 750 760 770 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 TAKCFGHLTKQLMTLANGRVALALEGGHDLTAICDASEACINALLGNEPGPLEEDALHQS ::.::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::..:::. : ::.: .:.:. mKIAA0 TARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQK 780 790 800 810 820 830 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 VNTNAAASLQKTIDIQSKYWKSIKMVAAARGGALPASQL--QEETETVSALASLTVDVEQ ..::.:.:.:.:.::::.:. .. ::. : .: .: .::.:::::.: :.: .:: mKIAA0 PSVNAVATLEKVIEIQSKHWSCVQRFAAGLGCSLREAQTGEKEEAETVSAMALLSVGAEQ 840 850 860 870 880 890 560 570 mKIAA0 PFA---QEDG-RTAGEPMEEEPAL : :: . : : ::::.:::: mKIAA0 AQAVATQEHSPRPAEEPMEQEPAL 900 910 >>mFLJ00062 ( 852 res) mpm11169 (852 aa) initn: 1438 init1: 1371 opt: 1420 Z-score: 1377.3 bits: 265.3 E(): 1.4e-71 Smith-Waterman score: 1433; 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