FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0704.ptfa, 824 aa vs ./tmplib.26680 library 1768193 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4273+/-0.00496; mu= 14.7148+/- 0.330 mean_var=110.9331+/-25.887, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 152 in 1/35 Lambda= 0.1218 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4128 ( 1002 res) mbf00283 (1002) 871 164 6.1e-41 mKIAA4220 ( 516 res) mia04077 ( 516) 418 84 3.6e-17 mKIAA0772 ( 324 res) mib22030 ( 324) 271 58 1.6e-09 mKIAA1534 ( 493 res) mph00515 ( 493) 179 42 0.00015 mKIAA1249 ( 1079 res) mbg09359 (1079) 152 38 0.0068 >>mKIAA4128 ( 1002 res) mbf00283 (1002 aa) initn: 2224 init1: 861 opt: 871 Z-score: 827.4 bits: 164.3 E(): 6.1e-41 Smith-Waterman score: 2928; 52.791% identity (57.982% ungapped) in 860 aa overlap (32-824:77-926) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 LAPACEDFILSAPPSSNGILTALSPKDQLFTMSDEKNLGVSQKLVSPSRSTSSCSSKQGS : :. . .::..:. : : . mKIAA4 HKTSTPTHRSASSSTSSQRESRQSIHVLERTASSSTEPSVSRQLLEPEPIPLS------K 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 RQDSWEVVEGLRGEMTYTQEPPVQKGFLLKKRKWPLKGWHKRFFCLEKGILKYAKSQADI . ::::..:::. .: .:.: ..::.:::::::::::::::: :..:.:::.:. :: mKIAA4 EADSWEIIEGLKIGQTNVQKPDRHEGFMLKKRKWPLKGWHKRFFVLDNGMLKYSKAPLDI 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 EREKLHGCIDVGLSVMSVKKSSKCIDLDTEEHIYHLKVKSEELFDEWVSKLRHHRMYRQN .. :.:: :::::::::.::... ::::::::::::::::.. :: :::::::::.:::: mKIAA4 QKGKVHGSIDVGLSVMSIKKKARRIDLDTEEHIYHLKVKSQDWFDAWVSKLRHHRLYRQN 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 mKIAA0 EIAMFPRDVN-HFFSGSSVTDSAPGVFESVSSRKR--SSLSKQNSFPPGSNLSFSCG-GD ::. :::.. :.: ..:...:.:.. :: . : .:. :. .: ...: .: :. mKIAA4 EIVRSPRDASFHIFPATSTAESSPAANVSVVDGKMQPNSFPWQSPLPCSNSLPATCTTGQ 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 TRVPFWLQSSEDMEKCSKDLAHCHAYLLEMSQLLESMDVLHRTYSAPAINAIQGGAFESP ..: :::.::.:..:..:::::.. :.:.:.::.....:.:: ::: .. .:.. . mKIAA4 SKVAAWLQDSEEMDRCAEDLAHCQSNLVELSKLLQNLEILQRTQSAPNFTDMQANCVDIS 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 mKIAA0 KKEKRPHRRWRSRAIGKD----------AKGTLQVPK-------------PFSG---PVR ::.:: ::::.....:: ::: ... . :::. ::: mKIAA4 KKDKRVTRRWRTKSVSKDTKIQLQEGPPAKGQFNTTRRRQRLAAAVATTVPFSATMSPVR 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 mKIAA0 LHSSNPNL-STLDFGEEKSY-SDGSEASSEFSKMQEDLCHVAHKVYFALRSAFNSISVER :::::::: . ..: :. .: :.:....:.::..: .:.::. :.::::::..:. mKIAA4 LHSSNPNLCADIEFQTPPSHLTDPLESSTDYTKLQEEFCLIAQKVHSLLKSAFNSIAIEK 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 EKLKQLM-ELDTSPSPSAQVVGLKHALSS--------ALAQNTDLKERLRRIHAESLLLD :::::.. : : . . :.:.. :...::. :: ::..:. :: :::.:: . : mKIAA4 EKLKQVVSEQDHNKGHSTQMARLRQSLSQSEGAGKSWALNQNAELRSRLNRIHSESTICD 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 mKIAA0 PPA----VPKPGDNLAEENSRDEGRALVHQLSNESRLSITDSLSEFFDAQEVLLSPSSSE . .:.: :. .:. . : .:..::::::...:.:::::::::::: :::: mKIAA4 HVVSVNIIPSP-DEPGEQIHVSL--PLSQQVANESRLSMSESVSEFFDAQEVLLSASSSE 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 NEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQTLGPVLESSGEARSKRRTSLPAPGPNTSS :: :::.::.::.:::.: :: : . :: :. : ..: :. ::: :::: :.::. mKIAA4 NEASDDESYISDVSDNISEDNTSVADNISRQILNGEL-TGGAFRNGRRTCLPAPCPDTSN 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 VSLWSILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKASRIPSPLERMVYV ..::.:::::::::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::. .: :::: : mKIAA4 INLWNILRNNIGKDLSKVSMPVELNEPLNTLQHLCEEMEYSELLDKASETDDPYERMVLV 640 650 660 670 680 690 620 630 640 650 mKIAA0 AAFAISAYASSYFRAGSKPFNPVLGETYECIRQDKGFQFFAEQ----------------- ::::.:.: :.:::::::::::::::::::::.::::.::.:: mKIAA4 AAFAVSGYCSTYFRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFRFFSEQVSHHPPISACHCESKNF 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 -----MRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPAFGDHFEWNKVTSCIHNILSGQRWIEHYGE .:::::::::::::.:.:: .:::: .::.. :::::.::::::::.:::::::: mKIAA4 VFWQDIRWKNKFWGKSMEILPVGTLNVTLPKYGDYYVWNKVTTCIHNILSGRRWIEHYGE 760 770 780 790 800 810 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 IDIKNLNDDSCHCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKWHESIYCGGASS . ..: ... : ::..:.:..::..:..:..:.:.:. ::.::::::::::..::: : : mKIAA4 VTLRNTKSSVCICKLTFVKVNYWNSNVNEVQGVVIDQEGKVVHRLFGKWHEGLYCGVAPS 820 830 840 850 860 870 780 790 800 810 820 mKIAA0 STCVWRANPMPKGYEQYYGFTQFALELNEMDPLSRSLLPPTDTRFRPDQR . :.:: . .: .:: :::::.::.::::.::. ..::::::.::::::: mKIAA4 AKCIWRPGSLPTNYELYYGFTRFAVELNELDPVLKDLLPPTDARFRPDQRFLEEGNLEAA 880 890 900 910 920 930 mKIAA4 AAEKQRVEELQRSRRRYMEENNLEHIPKFFKKVIDANQREAWVSNDTYWELRKDPGFSKV 940 950 960 970 980 990 >>mKIAA4220 ( 516 res) mia04077 (516 aa) initn: 760 init1: 309 opt: 418 Z-score: 400.7 bits: 84.4 E(): 3.6e-17 Smith-Waterman score: 800; 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