FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0641.ptfa, 1415 aa vs ./tmplib.26680 library 1767602 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6597+/-0.00791; mu= -7.3165+/- 0.520 mean_var=409.3444+/-99.951, 0's: 0 Z-trim: 21 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0634 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1079 ( 1062 res) mbg18715e (1062) 443 56 5.4e-08 mKIAA4203 ( 1062 res) mfj16282 (1062) 364 49 8.1e-06 mKIAA1804 ( 807 res) meh03138 ( 807) 290 42 0.00073 mKIAA1459 ( 855 res) mfj58296 ( 855) 268 40 0.0031 mKIAA3023 ( 1305 res) mpm03294 (1305) 260 39 0.0068 >>mKIAA1079 ( 1062 res) mbg18715e (1062 aa) initn: 696 init1: 181 opt: 443 Z-score: 235.9 bits: 55.7 E(): 5.4e-08 Smith-Waterman score: 813; 28.520% identity (35.892% ungapped) in 1115 aa overlap (458-1407:9-1059) 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 FCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGTTELEEEFERRWRSLRPGGSTGLGSGSAAPAAAT : .::..: .:.: .. .:.::: mKIAA1 RMQSQRDSEVDFEQQWTALKPDTNSRDASSSAA----- 10 20 30 490 500 510 520 530 mKIAA0 AASAELTAASSFPLLERFTSDGFHVDSDDVLTVTETSHGLNFEYKWEA---------GCG ::.:..:. : . . ..::::::::.::.::: ::: : : mKIAA1 -----------FPILDHFARDRLGREMEEVLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDEQGRG 40 50 60 70 80 540 550 560 570 580 mKIAA0 AEE---------YPPS---GAASSPGSAARLQELCAPDSSPPGVVPVLSAHSPSVGSEYF . .: .. :.:: . . . ::::::..::. ::::.:. mKIAA1 HPDEALSYSSMFFPVEVFENSLSDPGPGKQDDSGQEVPVRAPGVVPVFDAHNLSVGSDYY 90 100 110 120 130 140 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 IRLE-GAVPAAGHDPDCAGCAPSPQAVTDQDNNSEESTVASLAMEP--LLGHAPPTEGLW :.:: . : :: : .: . .. :.. . : . . : : :. mKIAA1 IQLEEKSSSNLGLDP--------PALLTTEVDKLERAGAEEPRTEEDFFQSSAHPKEAS- 150 160 170 180 190 650 660 670 680 690 mKIAA0 GPCDHHSHRRQGSPCPSRSPSPGTPMLPAED--IDW----GV-ATFCPPFFDDPLGASPS . : .. ::: : . ::... .: :: : : : .... : . mKIAA1 STEDSRATSIPGSPFNLFSDLDKADDLPSHQKIFDLMELNGVQADFKPAILSSSLDDPKD 200 210 220 230 240 250 700 710 720 730 740 mKIAA0 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.:.: :. . :.. : ... mKIAA4 -------YPSPR--SSEGFYPSPQHMV---QTNH-----YQVSGYPGSHGIPAMAGSIYQ 730 740 750 760 770 560 570 580 590 600 mKIAA0 GSAARLQELCAPDSSPPGVVPVLSAHSPSVGSEYFIRLEG---AVPAAGHDPDCAGCAPS :.:. :.. . : .: .::: . . :.: ..: : . . mKIAA4 GQASLLDQTELWNHRPQE----MSMWQPSVEDSAALDLRGMGQVLPP--HLMEERLIRQQ 780 790 800 810 820 610 620 630 640 650 660 mKIAA0 PQAVTDQDNNSEESTVASLAMEPLLGHAPPTEG-LWGPC-DHHSHRRQGSPCPSRSPS-P . :: .: . .. : .: . :: ..: .. :.: :. :. : mKIAA4 QEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLSRGSIDREDGSFQGPTGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKP 830 840 850 860 870 880 670 680 690 700 710 720 mKIAA0 GTPMLPAEDIDWGVATFCPPFFDDPLGASP---SGSPGAQPSPSDEEPEEGKVGLAAQCG : :.. . . . ... . .: : : :. . :... :. .::. mKIAA4 PRPGAPGHLSNLSSISSPADSYNEGVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVI 890 900 910 920 930 940 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 HWSSNMSANNNSASRDPESWDPGYVSSFTDSYRDDCSSLEQTPRASPEVGHLLSQEDPRD . ::... :: . : .:. . : .....: : : : mKIAA4 EMSSKIQPA------PPEEYVP-MVKEVGLALRTLLATVDETIPALPASTHREIEMAQKL 950 960 970 980 990 790 800 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