FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1757.ptfa, 1450 aa vs ./tmplib.26680 library 1767567 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5330+/-0.00936; mu= -5.4099+/- 0.623 mean_var=439.0615+/-102.604, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0612 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0324 ( 1754 res) mbg00352 (1754) 294 42 0.0017 >>mKIAA0324 ( 1754 res) mbg00352 (1754 aa) initn: 178 init1: 101 opt: 294 Z-score: 155.3 bits: 41.6 E(): 0.0017 Smith-Waterman score: 328; 21.200% identity (24.172% ungapped) in 1033 aa overlap (436-1400:692-1665) 410 420 430 440 450 460 mKIAA1 NYKVDCACHKGNRNCPIQKRNPNAAELPLPPPPSFPTIGAETRRRKAR--RKELELEQQN :: . .. :::: :. .. mKIAA0 SESSPEHAPKSRTARRGSRSSIEPKTKSRTPPRRRSSRSSPELTRKARVSRRSRSASSSP 670 680 690 700 710 720 470 480 490 500 510 520 mKIAA1 EVPEENPDPQPQEVPEKVTVSNEHEEVDNPEEKPEEEEKEEATDDQENSAHSRRTREDRK :. ..: :. .. : .::. . : :: . ........ .... ::: : mKIAA0 EIRSRTP-PRRRRSP---SVSSPE-----PTEKSRSSRRRRSVSSPRTKTTSRRGRSPSP 730 740 750 760 770 530 540 550 560 570 mKIAA1 VEAIMHAFESLEKRKK-----RRDQP-VEQSSSDIEITTSSSEIVV-----GEETKTAAP .. .: .:.: :::. ::.: . . : :. : .. .: mKIAA0 KPRGLQRSRSRSRREKTRTTRRRDRSGSSQSTSRRRQRSRSRSRVTRRRRGGSGYHSRSP 780 790 800 810 820 830 580 590 600 610 620 mKIAA1 ESEVSSPVSNVAIPSTPQSTGVNTRRS-SHAGDVAAEKPIPKPPPAKPSRPRPKS----- . :: .:. . .. .. .:: :... . .. . :: : : .. mKIAA0 TRQESSRTSSRRRRGRSRTPLTSRKRSRSRTSPAPWKRSRSRASPATHRRSRSRTPLISR 840 850 860 870 880 890 630 640 650 660 670 680 mKIAA1 RISRYRTSSAQRLKRQKQAIAQQAELSQAALEEGGSNNSVTPP---EAGNTDSSGENRQL : :: ::: ..: :..... .. :.:. . : ::: . . . . . :. mKIAA0 RRSRSRTSPVSR--RRSRSVNRRRSRSRASPVSRRRSRSRTPPVTRRRSRSRTPTRRRSR 900 910 920 930 940 950 690 700 710 720 730 740 mKIAA1 TGSDPTVISVTGSHVNRAASKYPKTKKYLVTEWLNDKAEKQECPV-ECPLRITTDPTVLA . . :.. . :.. .. . ... ::. ..... :: . : :.:.. mKIAA0 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