FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0614.ptfa, 1159 aa vs ./tmplib.26680 library 1767858 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1996+/-0.00481; mu= 0.4091+/- 0.319 mean_var=152.8140+/-34.626, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1038 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0317 ( 826 res) mbg01653 ( 826) 199 42 0.00042 mKIAA0010 ( 1086 res) mbg01752 (1086) 201 43 0.00043 mKIAA1625 ( 222 res) mbh04778 ( 222) 181 39 0.00088 mKIAA1320 ( 150 res) mef00242 ( 150) 168 37 0.0024 mKIAA0312 ( 2934 res) mbf01960 (2934) 188 41 0.0038 mKIAA0093 ( 904 res) mbg10506 ( 904) 177 39 0.0044 >>mKIAA0317 ( 826 res) mbg01653 (826 aa) initn: 182 init1: 91 opt: 199 Z-score: 166.1 bits: 42.2 E(): 0.00042 Smith-Waterman score: 255; 24.599% identity (26.822% ungapped) in 374 aa overlap (778-1150:473-816) 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 PEITLDPLEIVGGEIRASENSYFCQAARQLASVPSSQLCVKLASGGDPTYAFNIRFTGEE : . :: .. : .: . :.. : :: mKIAA0 QDKVNFFQRELRQVHMKRPHSKVTLKVSRHALLESSLKATRNFSISDWSKNFEVVFQDEE 450 460 470 480 490 500 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 VHGTSGSFRHFLWQVCKELQSSSLSLLLLCPSSAVNKNKGKYILTPSPITYGEEQLLHFL . .: :... .:: : ... .:. . ...:.. .:. .. . .. .: mKIAA0 ALDWGGPRREWFELICKALFDTTSQLF----ARFTDSNQALVHPNPNRPAHLRLKMYEFA 510 520 530 540 550 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 GQLLGIAIRADVPLPLDLLPSFWKTLVGEPLDPDQDLQEADILTYNYVKKFESINDESEL :.:.: . . : . .: :: . . : . : ..: : ::. . : mKIAA0 GRLVGKCLYESS------LGGAYKQLVRARFTRSF-LAQIIGLRMHY-KYFETDDPEFYK 560 570 580 590 600 610 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 EALCAEIASQHLATESPEGPKPCCRFTYLTMTGEEVELCSRGRHIPVAWENKDIYAAAIR .: . .. : . . ... . . ::: . : . ::. :: .: . mKIAA0 SKVCFILNNDMSEMELVFAEE---KYNKSGQLDKIVELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLA 620 630 640 650 660 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 SLRLRELQNMECVTAVRAGLGSIIPLQLLTTLSPLEMELRTCGLPYINLEFLKAHTMYQV . :: : : : ::. ..: .::. .. :.:: :: ::. .:::.. mKIAA0 QYRLAS-QVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIFDENELELLMCGTGDINVSDFKAHAVVVG 670 680 690 700 710 720 1050 1060 1070 1080 1090 1100 mKIAA0 GLMETDQHI-ELFWGALEMFTQEELCKFIKFACNQERIPFTCPCKDGGPDTAHVPPYPMK : . ... . ::... .::::: ....:. .. ..: : :: .: : . . mKIAA0 GSWHFREKVMRWFWAVVSSLTQEELARLLQFTTGSSQLP---P---GGF-AALCPSFQI- 730 740 750 760 770 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA0 IAPPDGTAGPPDSRYIRVETCMFMIKLPQYSSLETMLEKLRCAIHYREDPLSG :: : .. : ..::. .. :: :.: : . . :. :: mKIAA0 IAAPTHSTLPT------AHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRMLQLAISEGCEGFGML 780 790 800 810 820 >>mKIAA0010 ( 1086 res) mbg01752 (1086 aa) initn: 171 init1: 125 opt: 201 Z-score: 165.9 bits: 42.5 E(): 0.00043 Smith-Waterman score: 304; 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