# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg10262.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0230.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0230, 1431 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7894421 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0539+/-0.000188; mu= 16.1428+/- 0.010 mean_var=84.3913+/-15.935, 0's: 41 Z-trim: 183 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.139613 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|187956549|gb|AAI50790.1| Peroxidasin homolog (D (1475) 9602 1945.2 0 gi|123788303|sp|Q3UQ28.1|PXDN_MOUSE RecName: Full= (1475) 9591 1943.0 0 gi|172045828|sp|Q92626.2|PXDN_HUMAN RecName: Full= (1479) 8909 1805.6 0 gi|149728202|ref|XP_001503092.1| PREDICTED: peroxi (1431) 8837 1791.1 0 gi|126303939|ref|XP_001381381.1| PREDICTED: hypoth (1627) 8825 1788.7 0 gi|224048672|ref|XP_002195491.1| PREDICTED: peroxi (1490) 8591 1741.6 0 gi|194680924|ref|XP_593953.4| PREDICTED: similar t 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