FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0292.ptfa, 1725 aa vs ./tmplib.26680 library 1767292 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0337+/-0.00885; mu= -13.5395+/- 0.584 mean_var=497.0697+/-121.869, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0575 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1820 ( 1518 res) mpm10033 (1518) 758 79 1e-14 >>mKIAA1820 ( 1518 res) mpm10033 (1518 aa) initn: 905 init1: 407 opt: 758 Z-score: 356.5 bits: 78.9 E(): 1e-14 Smith-Waterman score: 1176; 25.532% identity (30.281% ungapped) in 1645 aa overlap (179-1698:3-1514) 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 SSTPSPLMQSGENLQCGQGNVPMSSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLE ..:: :.:.:. : . .:.. : . : mKIAA1 HSHFMPLLNPSPTDAASSVDPQAGNCKPLQKE 10 20 30 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 GVPEKRLTDPGLSSLSALSSQVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSKRPSSSS---KKADS .:.. :.: .:.::.::.::: :. ::::..::: : :::: 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