# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg10179.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1316.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1316, 1441 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921083 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1432+/-0.000182; mu= 15.1328+/- 0.010 mean_var=70.1792+/-13.704, 0's: 36 Z-trim: 39 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.153098 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|38505263|ref|NP_796145.2| HEAT repeat containin (2038) 9311 2066.9 0 gi|148704826|gb|EDL36773.1| RIKEN cDNA D930036F22, (2044) 9311 2066.9 0 gi|81889323|sp|Q5PRF0.1|HTR5A_MOUSE RecName: Full= (2038) 9302 2064.9 0 gi|109478164|ref|XP_343062.3| PREDICTED: similar t (2041) 8829 1960.4 0 gi|150456415|ref|NP_056288.1| HEAT repeat containi (1753) 8132 1806.4 0 gi|162416245|sp|Q86XA9.2|HTR5A_HUMAN RecName: Full (2040) 8132 1806.5 0 gi|28374162|gb|AAH45764.1| HEATR5A protein [Homo s (1778) 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