FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0622.ptfa, 791 aa vs ./tmplib.26680 library 1768226 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5005+/-0.00443; mu= 7.9427+/- 0.294 mean_var=116.0377+/-26.481, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1191 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0627 ( 1188 res) mbh01007 (1188) 2424 428 3.4e-120 >>mKIAA0627 ( 1188 res) mbh01007 (1188 aa) initn: 3448 init1: 1241 opt: 2424 Z-score: 2250.2 bits: 427.8 E(): 3.4e-120 Smith-Waterman score: 3538; 70.744% identity (74.206% ungapped) in 793 aa overlap (1-791:431-1188) 10 20 30 mKIAA0 ARSSRIPRPSMSQGCSRDTSRESSRDTSPA ::::::::::.::::::..::::::::::. mKIAA0 LVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVARSSRIPRPSVSQGCSREASRESSRDTSPV 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 RGFTPLASRRHSRSTSALSTAESVGQSDRFGLGQSGRIPGSVNAMRVLSTSTDLEAAVAD :.: ::. : .:..::.:. .::.:::::.:..:.: :::: mKIAA0 RSFQPLGP----------------G----YGISQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVAD 470 480 490 500 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 ALLLGDARSKKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSERSYGSRNGGIPHYLRQTEDVA :::::: :.::::.::::: :::.:::::::::::.::::::.::::.:: :.::::::: mKIAA0 ALLLGDIRTKKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSERSYSSRNGSIPTYMRQTEDVA 510 520 530 540 550 560 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 EVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADPHSKRVFSMFL ::::.::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::: mKIAA0 EVLNRCATSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLCEIFTRMFADLHGKRVFSMFL 570 580 590 600 610 620 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ETLVDFIIIHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAKVQKALDVTRDSFPFDQQFNI ::::::: .::::::::::::::::::: :. . : .: : . ..: mKIAA0 ETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKWVLICLALFRQKFRKPL-ILQES--------- 630 640 650 660 670 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 LMRFIVDQTQTPNLKVKVAILKYIESLARQMDPTDFVNSSETRLAVSRIITWTTEPKSSD :::: :::::::.::::::::::::.::.:::: ::.:::::::::::.::::::::::: mKIAA0 LMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPRDFTNSSETRLAVSRVITWTTEPKSSD 680 690 700 710 720 730 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 VRKAAQIVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLKNSSNTGVGSPSNTIGR :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..: .: .. . : mKIAA0 VRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLHNHLRNTGNGTQSSMGSPLTR 740 750 760 770 780 790 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 TPSRHPSSRTSPLTSPTNCSHGGLSPSMLDYDTENLNSEEIYSSLRGVTEAIEKFSFRSQ : :.. .:::::::: :.. :::: .::::::.:::.::::::::::::..:::::: mKIAA0 PTPRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPSAFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFRSQ 800 810 820 830 840 850 460 470 480 490 500 mKIAA0 EDLNEPIKRDGKK-DCDIVSRDGGAASPATEGRGGSEIEGGRMALDNKTSLLNTQPPRAF ::..::..:: :: : : . : ..: . ::. .:.. :::::.:::...: .. mKIAA0 EDMSEPVRRDPKKEDGDTICSGPGMSDPRA---GGDAADGSQPALDNKASLLHSMPLHS- 860 870 880 890 900 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 PGPRAREYNPYPYSDTINTYDKTALKEAVFDDDMEQL-RDVPIDHSDLVADLLKELSNHN .::.:.:::: :::.:. ..:.:::::.:::: .:. :. .:::::::.::::::::: mKIAA0 -SPRSRDYNPYNYSDSISPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSNHN 910 920 930 940 950 960 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 ERVEERKGALLELLKITREDSLGVWEEHFKTILLLLLETLGDKDHSIRALALRVLREILR ::.:::: :: ::.:.:.:.:..::.:::::::::::::::::. .::::::.::.:::: mKIAA0 ERIEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPTIRALALKVLKEILR 970 980 990 1000 1010 1020 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 NQPARFKNYAELTIMKTLEAHKDSHKEVVRAAEEAASTLASSIHPEQCIKVLCPIIQTAD .::::::::::::.::::::::: ::::::.::::::.::.:: :::::::::::::::: mKIAA0 HQPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRSAEEAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQTAD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 YPINLAAIKMQTKVVERITKESLLQLLVDIIPGLLQGYDNTESSVRKASVFCLVAIYSVI ::::::::::::::.::..::.: .:: .:.:::.:::::.::::::: ::::::...:: mKIAA0 YPINLAAIKMQTKVIERVSKETLNMLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHAVI 1090 1100 1110 1120 1130 1140 750 760 770 780 790 mKIAA0 GEDLKPHLAQLTGSKMKLLNLYIKRAQTTNSNSSSSSDVSTHS :..:::::.::::::::::::::::::: ..... ..::: .: mKIAA0 GDELKPHLSQLTGSKMKLLNLYIKRAQTGSAGADPTADVSGQS 1150 1160 1170 1180 791 residues in 1 query sequences 1768226 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:24:39 2006 done: Mon Mar 27 10:24:40 2006 Scan time: 0.900 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]