FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0465.ptfa, 1485 aa vs ./tmplib.26680 library 1767532 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7747+/-0.00784; mu= 1.8334+/- 0.521 mean_var=326.4865+/-77.272, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0710 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0728 ( 1589 res) mpm08199 (1589) 912 109 1.1e-23 mKIAA1011 ( 1666 res) mbg00096 (1666) 479 64 2.4e-10 mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290) 310 47 3.3e-05 mKIAA1251 ( 1900 res) meh00539 (1900) 276 44 0.00047 >>mKIAA0728 ( 1589 res) mpm08199 (1589 aa) initn: 1351 init1: 320 opt: 912 Z-score: 517.9 bits: 108.6 E(): 1.1e-23 Smith-Waterman score: 1181; 22.990% identity (24.785% ungapped) in 1505 aa overlap (8-1485:167-1589) 10 20 30 mKIAA0 LSSRLRMPPLIPAEVDKIRECISDNKSATVELEKLQP :: : :..: .. ....:. . . . mKIAA0 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:..:: . : . :..:: .:. .:.. . . . . ...:.. mKIAA0 SRSELLQQALCNAKIFGEDEVELMNWLNEVHGKLSKLSVQDHSPEALWRQRAELRALQED 900 910 920 930 940 950 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 LGKRTGTVQVLKRSGRELIEGSR-DDTTWVKGQLQELSTRWDTVCKLSVSKQSRLEQALK . : .:. .: ::.. . :.. .. .:. ...:. . :::.. . ::.::. mKIAA0 ILLRKQSVDQALLNGLELLKQTTGDEVLIIQDKLEAIKARYKDITKLSADVAKTLEHALQ 960 970 980 990 1000 1010 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 QAEEFRDTVHMLLEWLSEAEQTLRFRGALPDDTEALQSLIDTHKEFMKKVEEKRVDVNTA : .... . : .::...: : . :: ... . .::. ..:. ... :.. mKIAA0 LAGQLQSMHKELCNWLDKVEVELLSYETQGLKGEAASQVQERQKELKNEVRSNKALVDSL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 VAMGEAILAVCHPDCITTIKHWITIIRARFEEVLTWAKQHQQRLETALSELVANAELLEE .. :.: . ... :. :.. : :. .....:. . . . mKIAA0 NEVSSALLELVPWRAREGLEKTIAEDNERYRLVSDTITQKVEEIDAAILRSQQFEQAADA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 LLAWIQWAETTLIQRDQEPIPQNIDRVKALITEHQSFMEEMTRKQPDVDR-VTKTYKRKS :.:: .. :.. . . : :...: . ...: .. :.. .:. ::. .: mKIAA0 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. . .. . :.. .:. .: ..:. :.::. :.::. . mKIAA1 AGVESVFNICDVLLHDSDACANETECDSIQQTTRSLDRRWRNICAMSMERRMKIEETWRL 840 850 860 870 880 890 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 SGQFMDALQALVDWLYKVEPQLAEDQPVHGDLDLVMNLMDAHKVFQKELGKRTGTVQVLK .:.: . . ::: ..: : . . . . . ..::... .: ..... mKIAA1 WQKFLDDYSRFEDWLKSAERTAACPNSSEVLYTNAKEELKRFEAFQRQIHERLTQLELIN 900 910 920 930 940 950 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 RSGRELIEGSRDDT-TWVKGQLQELSTRWDTVCKLSVSKQSRLEQALKQAEEFRDTVHML .. :.: . .: :: . .: ...: . :::.. : .. ::. .: :::. : . . mKIAA1 KQYRRLARENRTDTASKLKQMVHEGNQRWDNLQKRVTAILRRLRYFTNQREEFEGTRESI 960 970 980 990 1000 1010 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 LEWLSEAE-QTLRFRGALPDDTEALQSLIDTHKEFMKKVEEKRVDVNTAVAMGEAILAVC : ::.: . : . .:.: . .. :.... . .. ...:: .. mKIAA1 LVWLTEMDLQLTNVEHFSESDAEDKMRQLNG---FQQEITLNTNKIDQLIVFGEQLIQKS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 HPDCITTIKHWITIIRARFEEVLTWAKQHQQRLETALSELVANAELLEELLAWIQWAETT .: . :. . .. .::. ... ..:: . mKIAA1 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