FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4136.ptfa, 1138 aa vs ./tmplib.26680 library 1767879 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0086+/-0.00452; mu= 17.1194+/- 0.302 mean_var=101.3242+/-23.567, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1274 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0739 ( 1094 res) mfj05109 (1094) 4325 807 0 >>mKIAA0739 ( 1094 res) mfj05109 (1094 aa) initn: 5575 init1: 4325 opt: 4325 Z-score: 4294.8 bits: 806.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5560; 74.728% identity (78.051% ungapped) in 1104 aa overlap (37-1127:21-1090) 10 20 30 40 50 60 mKIAA4 TAEQGAFFPEVLQNMEIKDQGAQMEPLLPTRNDEEAVVDRGGTRSILKTHFEKEDLEGHR : :::::::.::: .::. :.:::.::::: mKIAA0 RLRPAMPAGSNEPDGVLSYQRPDEEAVVDQGGTSTILNIHYEKEELEGHR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 mKIAA4 TLFIGVHVPLGGRKSHRRHRHRGHKHRKRD-RERD-SGLEDGRESPSFDTPSQRVQFILG ::..::..::: :.:::.:: 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