FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0319.ptfa, 1083 aa vs ./tmplib.26680 library 1767934 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7088+/-0.00674; mu= -1.4023+/- 0.447 mean_var=259.2159+/-63.232, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0797 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1837 ( 1119 res) mfj06041 (1119) 2761 331 4.3e-91 >>mKIAA1837 ( 1119 res) mfj06041 (1119 aa) initn: 2730 init1: 2610 opt: 2761 Z-score: 1727.8 bits: 331.5 E(): 4.3e-91 Smith-Waterman score: 2873; 45.131% identity (48.785% ungapped) in 1068 aa overlap (12-1073:112-1105) 10 20 30 40 mKIAA0 GRMVSPPGVLSSLLLLAAMAGGSSQQCSEGRT-YSDAIISP :.: :.. : : .:..:.: :. .. . mKIAA1 PASWVLPGYCWQTSVKLPRSLYLLYSFFCFSVLWLSTDADES--RCQQGKTLYGAGLRTE 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 mKIAA0 NPETIRIMRVSQTFSVGDCTAACCDLLTCDLAWWFEGSCYLVKCMRSENCEP-RTTGPIR . . .:.. : : . : :::: .: ::.:: :. . 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