# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg09941.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0319.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0319, 1083 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7914980 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7263+/-0.000194; mu= 12.1966+/- 0.011 mean_var=96.5803+/-18.437, 0's: 42 Z-trim: 60 B-trim: 215 in 1/65 Lambda= 0.130506 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|74221737|dbj|BAE28638.1| unnamed protein produc ( 985) 6394 1215.0 0 gi|194379034|dbj|BAG58068.1| unnamed protein produ (1027) 4449 848.8 0 gi|194383062|dbj|BAG59087.1| unnamed protein produ (1063) 4446 848.3 0 gi|219519164|gb|AAI44629.1| Unknown (protein for M (1011) 3795 725.7 3.1e-206 gi|118101658|ref|XP_417781.2| PREDICTED: hypotheti ( 780) 2805 539.2 3.3e-150 gi|148698327|gb|EDL30274.1| expressed sequence AU0 (1122) 2761 531.0 1.4e-147 gi|148698326|gb|EDL30273.1| expressed sequence AU0 (1055) 2750 528.9 5.4e-147 gi|126330167|ref|XP_001363786.1| PREDICTED: simila (1057) 2750 528.9 5.4e-147 gi|123244433|emb|CAM19270.1| likely ortholog of H. (1085) 2745 528.0 1.1e-146 gi|26335463|dbj|BAC31432.1| unnamed protein produc (1085) 2745 528.0 1.1e-146 gi|26351215|dbj|BAC39244.1| unnamed protein produc (1085) 2745 528.0 1.1e-146 gi|149023971|gb|EDL80468.1| rCG31424 [Rattus norve (1056) 2736 526.3 3.4e-146 gi|119890475|ref|XP_001252715.1| PREDICTED: simila (1043) 2730 525.2 7.3e-146 gi|149694073|ref|XP_001503729.1| PREDICTED: simila (1051) 2721 523.5 2.4e-145 gi|18027398|gb|AAL55781.1|AF289597_1 unknown [Homo ( 946) 2714 522.1 5.5e-145 gi|114555487|ref|XP_513307.2| PREDICTED: polycysti (1049) 2714 522.1 5.9e-145 gi|24559836|gb|AAN61054.1| polycystic kidney disea (1049) 2714 522.1 5.9e-145 gi|112616471|gb|AAG24389.2|AF275679_1 PP791 protei (1049) 2708 521.0 1.3e-144 gi|189054402|dbj|BAG37175.1| unnamed protein produ (1049) 2708 521.0 1.3e-144 gi|21739925|emb|CAD38985.1| hypothetical protein [ ( 746) 2699 519.2 3.3e-144 gi|109001967|ref|XP_001102000.1| PREDICTED: simila (1015) 2658 511.6 8.6e-142 gi|125845506|ref|XP_001335068.1| PREDICTED: simila (1048) 2561 493.3 2.8e-136 gi|55731402|emb|CAH92415.1| hypothetical protein [ ( 691) 2522 485.8 3.3e-134 gi|10436632|dbj|BAB14874.1| unnamed protein produc ( 691) 2521 485.7 3.8e-134 gi|73977168|ref|XP_539600.2| PREDICTED: similar to (1052) 2485 479.0 5.7e-132 gi|148700523|gb|EDL32470.1| mCG116690 [Mus musculu (1076) 2053 397.7 1.8e-107 gi|210132104|gb|EEA79771.1| hypothetical protein B ( 596) 2005 388.4 5.9e-105 gi|18381142|gb|AAH22154.1| AU040320 protein [Mus m ( 603) 2001 387.7 1e-104 gi|94733530|emb|CAK04276.1| novel protein [Danio r ( 763) 1869 362.9 3.7e-97 gi|156222022|gb|EDO42871.1| predicted protein [Nem ( 652) 1859 361.0 1.2e-96 gi|66532488|ref|XP_395372.2| PREDICTED: similar to (1124) 1839 357.4 2.4e-95 gi|156543112|ref|XP_001605458.1| PREDICTED: simila (1029) 1796 349.3 6.3e-93 gi|194118598|gb|EDW40641.1| GM24974 [Drosophila se (1019) 1749 340.4 2.9e-90 gi|7295169|gb|AAF50494.1| CG7565, isoform A [Droso (1069) 1749 340.5 3e-90 gi|194196057|gb|EDX09633.1| GD13023 [Drosophila si (1042) 1745 339.7 4.9e-90 gi|194180214|gb|EDW93825.1| GE20376 [Drosophila ya (1071) 1741 339.0 8.5e-90 gi|190653162|gb|EDV50405.1| GG14923 [Drosophila er (1069) 1738 338.4 1.2e-89 gi|198151324|gb|EAL30377.2| GA20444 [Drosophila ps (1103) 1695 330.3 3.5e-87 gi|194161800|gb|EDW76701.1| GK19891 [Drosophila wi (1147) 1692 329.8 5.3e-87 gi|190624869|gb|EDV40393.1| GF10486 [Drosophila an (1074) 1691 329.5 5.8e-87 gi|190582312|gb|EDV22385.1| hypothetical protein T ( 676) 1676 326.6 2.9e-86 gi|189239768|ref|XP_966476.2| PREDICTED: similar t (1211) 1673 326.2 6.6e-86 gi|193897986|gb|EDV96852.1| GH16502 [Drosophila gr (1062) 1670 325.6 8.9e-86 gi|212514641|gb|EEB16918.1| conserved hypothetical ( 973) 1669 325.4 9.5e-86 gi|21749121|dbj|BAC03536.1| unnamed protein produc ( 491) 1662 323.8 1.4e-85 gi|74149588|dbj|BAE36422.1| unnamed protein produc ( 487) 1658 323.0 2.4e-85 gi|157016682|gb|EAA10200.4| AGAP008639-PA [Anophel (1010) 1655 322.7 6.1e-85 gi|108871233|gb|EAT35458.1| serine-type protease i ( 995) 1648 321.4 1.5e-84 gi|194154613|gb|EDW69797.1| GJ13453 [Drosophila vi (1055) 1645 320.9 2.3e-84 gi|193919416|gb|EDW18283.1| GI12179 [Drosophila mo (1089) 1601 312.6 7.4e-82 >>gi|74221737|dbj|BAE28638.1| unnamed protein product [M (985 aa) initn: 6394 init1: 6394 opt: 6394 Z-score: 6503.6 bits: 1215.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6394; 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