FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0817.ptfa, 1399 aa vs ./tmplib.26680 library 1767618 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4861+/-0.00717; mu= 2.8219+/- 0.474 mean_var=281.7394+/-67.546, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0764 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444) 656 87 2.9e-17 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 228 40 0.0039 mKIAA4226 ( 2225 res) mpf00382 (2225) 231 40 0.0048 >>mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444 aa) initn: 582 init1: 170 opt: 656 Z-score: 402.4 bits: 87.0 E(): 2.9e-17 Smith-Waterman score: 946; 23.294% identity (28.807% ungapped) in 1348 aa overlap (7-1304:266-1405) 10 20 30 mKIAA0 KGSSSWGFNASVGSARCGSGGPGSCPVPQECVPQDG ::: . : :..: .:. . . mKIAA0 VRGNETVPEVVTTSGYALLHFFSDAAYNLTGFNIFYSINSC----PNNCSGHGKCTTSVS 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 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