FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0817.ptfa, 1399 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767618 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4861+/-0.00717; mu= 2.8219+/- 0.474
 mean_var=281.7394+/-67.546, 0's: 0 Z-trim: 11  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0764

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA0534  ( 1444 res)   mpf00179                       (1444 aa)
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       .:.   :.: . : :  : .  :  ::..    : :. .   .:.: ... ::::. .. 
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       . .  :  : . .  . ...:  :.   ....:    .:..::  .  . .  .  :.. 
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          :.   .:: . ::    :  :. :    .   ... ::    . :.:: ..::.:. 
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       . .:  . :    . .  :: ::.        : . .... :::   :..... ::....
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       .::.    .:.   : :::..:: :.: :.:: ::.. .  .  .   .::. .   :::
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       ..:  :  :    : .:...:.. .:...:: .  :         ::.: : :.. :. :
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          .: .: .  .   .  .:....... .:: :::..: :. .:.   ::. :. . . 
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       : : ..:    :.: .. :    ::.  . :    :: .    . ..: :   :. : : 
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               .:      :.:: .     ::. ...:..     . :.: ....     :..
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        .    .:..:. . .:.:    .:  : . . .      :.  . . : . :     ..
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         : :    .:  : .:  .:: ..   ..   ..  :: .:: .. :: .  .      
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       : :. :     . :  :  .    :.::.  . . .    .  ..  :::.: .: .:  
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         . : .  :.  . .:    :: ..  :.::  :. :   .: :.  .  :        
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       :.:.: .   :      .:::    :.   .:     :  :  : :  ...    :.   
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        ::. :     : .     :: : .   .  .  :: ..:  .  .  .   .: :   .
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       . :: .:.: . : .:. :. ::.      :.:: : :.:::..:. . :  : :   : 
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        :  .:.           ::  :  .. . :.:: :  ::  . .. .  ..  .. .  
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             ..  ::    .. .:.  ..:.    . . :.. . :     :       : : 
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       ....:    : :: .     . :    : :  .. . :. ::    :  ..  : .   :
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mKIAA0 EASIPRCKW----CTN-CPEGACIGRNGSCTSENDCRINQREVFWAGNCSEAACGAAD-C
       : . :   :    :.. :: :. .:.:  :...  :. . .    .:.:  .:   .: :
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       ..          :...  :    : .  ::  .     .: :     .. :    :  ..
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       .:   .: :  :...:. :.:     ::::        .:  : .         : :   
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          .:     .  :  .      ... :  .. . . .:  :  .. : .:  .  :  :
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        ..:  :..   . : . :.:.. : .:. .::. : :  .     :    ::    .::
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Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]