FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0777.ptfa, 1134 aa vs ./tmplib.26680 library 1767883 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7887+/-0.00843; mu= -8.4875+/- 0.558 mean_var=435.1358+/-104.127, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0615 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1296 ( 1304 res) mfj01232 (1304) 996 104 2.1e-22 >>mKIAA1296 ( 1304 res) mfj01232 (1304 aa) initn: 1320 init1: 360 opt: 996 Z-score: 494.4 bits: 103.6 E(): 2.1e-22 Smith-Waterman score: 1693; 34.905% identity (42.930% ungapped) in 1209 aa overlap (18-1134:228-1302) 10 20 30 40 mKIAA0 KRVTVIKAPHYPGIGPVDESGIPTAIRTTVDRPKDWYKTMFKQIHMV :: ::: .:.: .: :::::::::::: . mKIAA1 TSPGRASERRAKDASRRVVRSAQDLSDVSTDEVGIP--LRNT-ERSKDWYKTMFKQIHKL 200 210 220 230 240 250 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 HKPDEDTDMYNTPYTYNAGLYNSPYSAQSHPAAKTQTYRPLSKSHSDNGTDAFKEVPSPV .. :.:.:... :... .:: :. : :::. : .. : : . mKIAA1 NR-DDDSDVHSPRYSFSDDT-KSPLSV------------PRSKSEM-NYIEGEKVVKRSA 260 270 280 290 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 PPPHVPPRPRD-QSSTLKHDWDPPDRKVDTRKFRSEPRSIFEYEPGKSSILQHERPPPLP : .: : . .:: ..::.: :.::::::.:.::.::.::.:::::.: .:. mKIAA1 TLP-LPARSSSLKSSPERNDWEPLDKKVDTRKYRAEPKSIYEYQPGKSSVLTNEK----- 300 310 320 330 340 350 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 PTPTPVPREPSRKPLSVSPSTDGLRSPSPPPRSCVPAPRPSAPDLSPTRTGRINPADIDL . :. :.: .::: mKIAA1 -----MSRD-------------------------------------------ISPEEIDL 360 230 240 250 260 270 280 mKIAA0 ENEPWYKFFSELEFGHPPP-KKALDYVQDHSSGVSNEVSIYQSSIDRSLERPSSSAS--- .::::::::::::::.: .: :.. : . . ..: ..: : . :.::: mKIAA1 KNEPWYKFFSELEFGRPTNLEKDLSFCQAELEADLEKVETVNKSP--SANSPQSSAVSPT 370 380 390 400 410 420 290 300 310 320 mKIAA0 -----------MAGDFRK-RRKSEPAVGPLRGLGDQSSSRTSPGRA-DLPGSSSTFTKSF ....:. .:.:. . : : .: .. . : .. :.: .. . : mKIAA1 PDITSEPPGYIYSSNFHAVKRESDGTPGGLASLENERQIYKSVLEGGDIPLQGLSGLKR- 430 440 450 460 470 480 330 340 350 360 370 380 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::::: :..: : : . .. mKIAA1 LDFSGRLSKSPTPVLS-RSGLTSAR--SAESLLES-TKLR-P----REMDGMDSGGVYAS 720 730 740 750 760 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 VTSDEQPRTHMEFSDSDQDGVVSDHSDYVHVEGSSFCSESDFDHFSFTSSESFYGSSHHH : ... . : . : : :.::. ..:: : .:..: ::. mKIAA1 PTCSNMADHALSFRS------------LVPSEPLSICSD-ELDHCSNVSNDSREGSGGSV 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 HHHHHHHRHLISSCKGRCPASYTRFTTMLKHERAKHENMDRPRRQEMDPG-LSKLAFLVS : .:: ...::: ::::::::::. :::. . .. : .. : . : . :.: mKIAA1 HGDFPKHR--LNKCKGTCPASYTRFTTIRKHEQQSSRQSDWRSDSRGDKNSLLRNIHLMS 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 PVPFRRKKILT--PQKQTEKAKCKASVVEALDSALKDICDQIKAEKRRGSLPDNSILHRL :.::: :: : :.. . . .. . . : .: :: .. . mKIAA1 PLPFRLKKPLQQHPRQPPPSDSSESPAGQKADLPCHDPQDQPHSAGK------------- 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 mKIAA0 ISELLPQIPERNSSLHALKRSPMHQPFHPLP-PDGASHC--------PLYQNDCG----R ::.: : :: :.. : :. :: : : : :. .: : mKIAA1 -----PQVPTRLSSRHTMARLS-HNSEPPLDRPAGLEDCTRAINNGNPVPYSDHGLDRNN 920 930 940 950 960 850 860 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