FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1200.ptfa, 1447 aa vs ./tmplib.26680 library 1767570 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7509+/-0.00609; mu= 0.6160+/- 0.402 mean_var=298.4424+/-69.910, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0742 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA2028 ( 1392 res) mib04094 (1392) 3369 376 3.3e-104 >>mKIAA2028 ( 1392 res) mib04094 (1392 aa) initn: 2546 init1: 1460 opt: 3369 Z-score: 1963.1 bits: 375.8 E(): 3.3e-104 Smith-Waterman score: 3810; 47.711% identity (54.897% ungapped) in 1398 aa overlap (181-1428:1-1365) 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 ETQVGVMEEKIKLSNLKSVDSTGTLHQKYQELLKAVQGKDELISQLQAQLEKQKQTRAEE .: ...: ::..:..: .::.:::.: .: mKIAA2 DLESVMQEKDDIIQNLALRLEEQKQVRIQE 10 20 30 220 230 240 250 260 mKIAA1 AKIVQEKAAKIKEWVTVKLAELEMENQQLKTCNQQLVEQVAALQDALEDLRM-------T :::..:::::::::::::: :::.:::.:. :: .:.. :.:. :..:. . mKIAA2 AKIIEEKAAKIKEWVTVKLNELEVENQNLRFINQTQTEEIRAIQSKLQELQEKKISCVSS 40 50 60 70 80 90 270 280 mKIAA1 PS--------------------------EELLVVPEGTP--------ERDPVPSGPSDQP :. ::. . . : :. . :.:. mKIAA2 PKTSEGQRNLTFGCFLSRAKSPPCVVRCEEVSKMASNEPEITEGRCVEEMEIAEKPADNQ 100 110 120 130 140 150 290 300 310 mKIAA1 VEQDSNPHTQILKVA------------------------VPTP---------SLGTLQSR :...: . .. ... ::. : : .:: mKIAA2 VQENSRSQRKLHETSCSSEQNQKTRASFAMDGGTSQNSGVPVSDWSSDEDDGSKGRSKSR 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 mKIAA1 --DSLSEARSLE----------------DLRFSMVH----PGETAEAKTLQSHLQKEGSP ..:: : : : :. . :. : : : : :: mKIAA2 CTSTLSSHTSEEGGQCGRLGSEAYLTASDDSSSIFEEETFDGNRPEQKKLCSWQQKAPWK 220 230 240 250 260 270 360 370 380 mKIAA1 SQLCMKPGNPKHG-----SAS-------------YRES----------LVTAQGGTFPGT .: . : . : :.: : : :. : .:.. mKIAA2 AQGNLAKGRSQSGVKEQDSSSDELNKKFHSQRLDYTSSSSEANTPSPILTPALTPRYPNS 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 KTSAREGG----PGSSLTLPKVRAPSIPRDSFQVAKRHHSQPQVGPGHC-DHVVSIEIGA . .:: : 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