FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4062.ptfa, 1285 aa vs ./tmplib.26680 library 1767732 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3789+/-0.0106; mu= -26.2350+/- 0.696 mean_var=747.9746+/-179.382, 0's: 0 Z-trim: 27 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0469 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4117 ( 1192 res) mfj20353 (1192) 1988 151 1.4e-36 mKIAA0666 ( 1087 res) mbg21234 (1087) 1010 85 1.1e-16 mFLJ00304 ( 864 res) mng15233 ( 864) 744 66 2.4e-11 mKIAA1727 ( 1159 res) mbh01547 (1159) 671 62 8.9e-10 mKIAA2014 ( 1045 res) mpm02193 (1045) 606 57 1.8e-08 mKIAA1695 ( 1294 res) mbp08127 (1294) 448 47 3.4e-05 mKIAA1205 ( 1848 res) mpf00780 (1848) 413 44 0.00022 mKIAA0595 ( 1646 res) mbg04268 (1646) 386 43 0.00072 mKIAA1902 ( 293 res) mph04215 ( 293) 316 37 0.006 mKIAA1471 ( 801 res) mtj02395 ( 801) 327 38 0.0071 >>mKIAA4117 ( 1192 res) mfj20353 (1192 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.:..:: . : : :: . .: :.::.:: mKIAA0 LKTALRTKPMRFVTRFIDLDGLSCILNFLKTMDYETSE------SRIHTSLIGCIKALMN 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 mKIAA4 NKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTER :. : .: :.: ....... . . . ..:.:.:..: ...::.:: . mKIAA0 NSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGG---HKKVLQAMLHY 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 mKIAA4 AEM-DEVERFQPLLDGLKSGTS-----IALKVGCLQLINALITPA---EELDFRVHIRSE .. .: ::: :.. : ..:. ..::.. ...:::... . : ::::.:.: : mKIAA0 QKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRDEVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLHLRYE 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 mKIAA4 LMRLGLHQVLQELREIENEDMKVQLCVFDEQGDEDFFDLKGRLDDIRMEMDDFGEVFQII .. ::.. :...::: :: . .: :. .:: ... :.. .... . ..:.. mKIAA0 FLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQMFELT 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 mKIAA4 LNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLVRNDYEARP-QYYKLIEECVSQIVLHKN-GTDPDFKCR . :.: :::.:::.: : . . ::. :... ..:::.... : ::: . mKIAA0 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.. ::. .:. ...:::..: ::::: :.:. .:. mKIAA0 QSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSRALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRG-NAY 790 800 810 820 830 840 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA4 GFNISFLCKLRDTKSA-DQKMTLLHFLAELCENDHPEVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQ ::.:: : :. ::::. :...::::.: . :: .:.::.. .:: . .:..:. .:. mKIAA0 GFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVENKYPKVLNLSEELRDIPQAAKVNMTELD 850 860 870 880 890 900 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA4 KSLDQMKKQIADVERDVQNFPAATDEK-DKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLY : .. ... . :: ... . . :::: ...:. :. ... .. . .. . :. mKIAA0 KEISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGDKFVSVVSQFITLASFSFSDVEDLLAEAKELF 910 920 930 940 950 960 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA4 KELGDYFVFDPKKLSVEEFFMDLHNFRNMFLQAVKENQK-RRETEEKMRRAKL-AKEKAE . .: . :.. .::: . .: . .: .::.. :.. ::. :::.: :. : . mKIAA0 TKAVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQAVAEAKQENENMRKRKEEEERRARLEAQLKEQ 970 980 990 1000 1010 1020 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA4 KERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMDSLLEALQSGAAFRRKRGPRQVNRKAGCAVTSLL .:: .: .: .. ..:.: .:.:. ::.:: .: . . . 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.. .. :... : : ::.:.:: ..:.. .. ... .. mKIAA2 ARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILCLRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIA 220 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 mKIAA4 RAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEM-DEVERFQPLLDGLKS ... : . .::.:.:.. . .: .: :. . :. :..::. :.. ... mKIAA2 LSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLV---RGGHEIILAAFDNFKEVCKELHRFEKLMEYFRN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 mKIAA4 -GTSIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQELREIENEDMKVQLC ..: . :.:.:.:: .. .:...::::.. :. .:::.. ::. :. :.: ..::. mKIAA2 EDSNIDFMVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSRHTESEKLQVQIQ 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 VFDEQGDEDFFDLKGRLDDIRMEMDDFGEVFQIILNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLVRND .. . . ::. : :.: .:. .. :. :.. mKIAA2 AYLD----NVFDVGGLLED--------AETKNVALEKVEE-------------------- 390 400 410 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 YEARPQYYKLIEECVSQIVLHKNGTDPDFKCRHLQIDIERLVDQMIDKTKVEKSEAKATE .:: :: :: :.:.: ... ...: mKIAA2 ----------LEEHVS----------------HLT---EKLLDLE------NENMMRVAE 420 430 440 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