FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1249.ptfa, 1079 aa vs ./tmplib.26680 library 1767938 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2448+/- 0.01; mu= -20.9180+/- 0.662 mean_var=605.4405+/-143.529, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0521 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0400 ( 970 res) mfj04247 ( 970) 3243 259 1.8e-69 mKIAA0041 ( 807 res) mbg03660 ( 807) 525 55 5.4e-08 mKIAA1099 ( 981 res) mfj15083 ( 981) 422 47 1.3e-05 mKIAA0167 ( 1029 res) mfj34112 (1029) 403 46 3.7e-05 >>mKIAA0400 ( 970 res) mfj04247 (970 aa) initn: 3058 init1: 1237 opt: 3243 Z-score: 1339.5 bits: 259.4 E(): 1.8e-69 Smith-Waterman score: 3452; 53.839% identity (64.939% ungapped) in 1094 aa overlap (1-1079:49-970) 10 20 30 mKIAA1 VTLLEEALDQDRTALQKVKKSVKAIYNSGQ :. .::::: :: .: :.::::::: :: mKIAA0 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