FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1516.ptfa, 1364 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1767653 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7194+/-0.00548; mu= 15.0212+/- 0.366
 mean_var=130.7759+/-29.036, 0's: 0 Z-trim: 6  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.1122

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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mKIAA1964  ( 801 res)   meh02207                   ( 801)  562  103   2e-22
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mKIAA4098  ( 1048 res)   mpg00558                  (1048)  508   95   1e-19


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Smith-Waterman score: 934;  27.726% identity (34.319% ungapped) in 963 aa overlap (407-1349:13-810)

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                                     ...  .:.:.::. :. ..: .: .:: :.
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       :  ..: .  . :. . ..... :::.:.:.::::::::. :: :.::::.: ::::.::
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       : .::::: :  .   :.: :: :.::.: ::::.::: . :: :: .::..:.::: . 
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       : :: ::::  . .::. :. . : .  . .   :::: .:  :.:.:::: :.:..   
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         :.:  . ::   .... ...   :.: .  : : :.. : :     ::.         
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        :                ::.. . :. :                   :. .: : .:.:
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       : : : ::: ..             .:  ::.           : . : .:.:       
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                      :  . ..:                      ...... .:: : ::
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        .::.::::  : .::  : :.::::.:: :: ...: .:.: ::  :: :::  .   .
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           ..:.:. :  .:..     :. ::::: .  :..  .  .:::..:.:.:. .  :
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       .::  . :..::.:.:. ..:. : . .:. ::.:. :.... : ..::.:..:.. ::.
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       .. ::: .:. :                   ..:: ...   .    .:.  ..... .:
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         ..  .. :  .::::   .:  ....:  :      .  .  :.  .: :  : . .:
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       .   ...    :  :. .   : .    . : : .. ..  . ..:   .... ::... 
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          .. . ..:  . .:.. . ..:      .:. ..:      . ::.  :  ..::: 
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        :.:  ..  . ..  ...:.   :         . .:.:. ::  . . .::. :..  
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        ..:::  ... ..     ::   . .  ::.:                           
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       ..: ::..::. .::. : .   . : ..  .... :::.:.:.:::::::   :..: :
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       ..  : ..: .::::.::: ::: :. :.:: :::.:..: :. :.. :.. ::..:. :
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       .:. .:::::. ::. :.. .:...:.:: .     .   .. .::::: :. :.:.: :
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       ::... . :.                   :...        .:::  :..   . .. .:
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       .  :::.::  :..:.:              :: .                  . :.   
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         : :..:.  :::::: ::  ::  : :.::.:.::  : . ::.. :. ::.:::::.
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       : .. ..     . ::   .: . ...: .  . ::::::    ...:.      : . :
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       .. :.: :  . ::: ...:   :...:.: :.... .:...::.:....  .. . .: 
mKIAA1 EIHGIPADCAEQRTKTVNQNGDAPIFDESFEFQINLPELAMVRFVVLDDDYIGDEFIGQY
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mKIAA1 IIPLRALKRGYRHLQLRNLHNEILEISSLFINSRRMEENPSGSSMPASLMFNTEERKCSQ
        ::.. :. ::::. :..: .:.:  .:::..                            
mKIAA1 TIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLFVHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREY
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mKIAA1 THKVTVHGVPGPEPFAVFTINEGTKAKQLLQQVLAVDQDTKCTATDYFLMEEKHFISKEK
                                                                   
mKIAA1 ASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRENMQNAVVSFKELCGLSSVANLMQCMLAVSP
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       : :..:. ::  ::: .:.::::: :: ::..::.:::.:: ::.:.:.:.. ::: .. 
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       :.:.:::::::. ::.:::. . ...:.::    :  ..  :  :::::..:. :.:.:.
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       ::: :. .  :  . .. .  : . .       :   ..:... ..  .   :  ::  .
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       . ..:      : :  .:  .   :  :  .::. ..:..    :.: ::.  .  ....
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mKIAA1 SRQIAPELSDLVIYCQAVK-----FPGLSTLNSSGS-SRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPG
       :: .   .:      . .:       :  ::.: :: :::  :. .:..      ..: .
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mKIAA1 ETAPFNRTSGKGSCEGMRHTWEESSPLSPSTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRG
        .   . :.. :.     :  :              :.. . ...::..:. :... .. 
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         . .. . .:: : ::.. :.:::: ::  ::  : :.::::::..   :.:: : : :
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       :: :::::::      .:     :.:  .: : .      .: :::::..  : .:. :.
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mKIAA1 ------PCIEVDVLGMPLDSCHFRTKPIHRNTLNPMWNEQFLFRVHFEDLVFLRFAVVEN
             : .::.:.:.:.:  . .:. .  : .::::.: ..: ::. .....:: : ..
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mKIAA1 N--SSAITAQRIIPLRALKRGYRHLQLRNLHNEILEISSLFINSRRMEENPSGSSMPASL
       .  .  . .:: . . ..  ::::. :     : .: .:.:..                 
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        .  .. :....::  .:.. .. :. :       ...  ::..:.: ::::::::  :.
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        : ::.: : ... :::: .:::::.:  : :.::::::::.:: :..:..:.   :: .
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       :.:.:::                                : : .:               
mKIAA1 LVKGKKL--------------------------------PAARSE---------------
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         :  :: :: :..        : .::. . .. :.. :                     
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        ...::.:::: :..:: :..   : ::. :                  ::   : .   
mKIAA1 -RAKQISPELSALAVYCCATR---LRTLDPS------------------PG---PPQ---
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               ::                              ..::.:  :... :... ..
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       ..:.. :: :.:: . :..:.: ::  .:  : ::::::.::    . ::.. :  :: :
mKIAA1 VRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSGCQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQC
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       ::::::  :      .:  ::     .: .  :     ::  ::   .   :.   .:  
mKIAA1 GYVLKPAYLRQLNTTFDPECP-----GPPRTTL-----AIQVLTAQQLPKLNAEKPSSIV
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mKIAA1 SPCIEVDVLGMPLDSCHFRTKPIHRNTLNPMWNEQFLFRVHFEDLVFLRFAVVENNSSA-
       .: ..:.. :.: :  . .:  .  : .:: :.. . ::..  .::..::.: . .... 
mKIAA1 DPLVRVEIHGVPEDCAQKETDYVLNNGFNPCWEQTLQFRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSP
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mKIAA1 --ITAQRIIPLRALKRGYRHLQLRNLHNEILEISSLFINSRRMEENPSGSSMPASLMFNT
         ...:  .:: .::.::::..: .  .  :  ..::.. :                   
mKIAA1 NDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLAPATLFVHIRIQNS               
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mKIAA1 EERKCSQTHKVTVHGVPGPEPFAVFTINEGTKAKQLLQQVLAVDQDTKCTATDYFLMEEK

>>mKIAA1069  ( 1289 res)   mfj10223                       (1289 aa)
 initn: 687 init1: 277 opt: 514  Z-score: 450.5  bits: 95.7 E(): 6e-20
Smith-Waterman score: 638;  29.044% identity (33.546% ungapped) in 544 aa overlap (531-1051:1-494)

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mKIAA1 LDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFITSDL--PIIISIENHCSLPQQR
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mKIAA1                               AIDRPWLCCCSLRFPVILSIENHCSIQQQR
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mKIAA1 KMAEIFKSVFGEKLVAKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRRKVLLKNKKLKAHQTPVDILKQK
       :.:. .:... .::    :  .: ..  .::::..:. :.:.:.:::  :          
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