FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1516.ptfa, 1364 aa vs ./tmplib.26680 library 1767653 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7194+/-0.00548; mu= 15.0212+/- 0.366 mean_var=130.7759+/-29.036, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1122 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 ( 962) 635 115 6.3e-26 mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 ( 889) 587 107 1.3e-23 mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 584 107 2.7e-23 mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 ( 801) 562 103 2e-22 mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289) 514 96 6e-20 mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048) 508 95 1e-19 >>mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 (962 aa) initn: 760 init1: 244 opt: 635 Z-score: 557.8 bits: 115.1 E(): 6.3e-26 Smith-Waterman score: 934; 27.726% identity (34.319% ungapped) in 963 aa overlap (407-1349:13-810) 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 IESTSLGIFGVGILQLNDFLVNCQGEHCTYDEILSIIQKFEPSVSMCHQGLLSFEGFARF ... .:.:.::. :. ..: .: .:: :. mKIAA0 RLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNSSLAKKGQMSVDGFMRY 10 20 30 40 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 LMDKDNFASKNDESRENKKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGHQLKGESSVELYSQVLLQGC : ..: . . :. . ..... :::.:.:.::::::::. :: :.::::.: ::::.:: mKIAA0 LSGEEN-GVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGC 50 60 70 80 90 100 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 RSIELDCWDGDDGM--PIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFITSDLPIIISIENHCSL : .::::: : . :.: :: :.::.: ::::.::: . :: :: .::..:.::: . mKIAA0 RCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSFENHVDS 110 120 130 140 150 160 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 P-QQRKMAEIFKSVFGEKLVAKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRRKVLLKNKKLKAHQTPVD : :: :::: . .::. :. . : . . . :::: .: :.:.:::: :.:.. mKIAA0 PKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKNKK-KSHKSSEG 170 180 190 200 210 220 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 ILKQKAHQLASMQAQAFTGGNANPPPAS-NEEEEDEEDEYDYDYESLSDDNILEDRPENK :.: . :: .... ... :.: . : : :.. : : ::. mKIAA0 SGKKKLSEQAS---NTYSDSSSVFEPSSPGAGEADTESDDDDD-----DDD--------- 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 SCADKLQFEYNEEVPKRIKKADNSSGNKGKVYDMELGEEFYLPQNKKESRQIAPE-LSDL : ::.. . :. : :. .: : .:.: mKIAA0 -C----------------KKSSMDEGTAG-------------------SEAMATEEMSNL 270 280 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 VIYCQAVKFPGLSTLNSSGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETAPFNRTSGKGSCEGM : : : ::: .. .: ::. : . : .:.: mKIAA0 VNYIQPVKFESFEI----------SKKRNKSF-----------EMSSFVETKG------- 290 300 310 800 810 820 830 840 850 mKIAA1 RHTWEESSPLSPSTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRGSQKLIQHTAYQLLRTYP : . ..: ...... .:: : :: mKIAA0 ---------------LEQLTKSPV---------------------EFVEYNKMQLSRIYP 320 330 340 860 870 880 890 900 910 mKIAA1 AATRIDSSNPNPIMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGCGYVLKPPVLWDKS .::.:::: : .:: : :.::::.:: :: ...: .:.: :: :: ::: . . mKIAA0 KGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTVDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPD 350 360 370 380 390 400 920 930 940 950 960 mKIAA1 CPMYQKFSPL-ERDLDNLDPAIYSLTIISGQNVCPSNSTGSPCIEVDVLGMPLDSCH--F ..:.:. : .:.. :. ::::: . :.. . .:::..:.:.:. . : mKIAA0 ----KHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFL--SDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAF 410 420 430 440 450 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 RTKPIHRNTLNPMWNEQ-FLFR-VHFEDLVFLRFAVVENNSSAITAQRIIPLRALKRGYR .:: . :..::.:.:. ..:. : . .:. ::.:. :.... : ..::.:..:.. ::. mKIAA0 KTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPSLACLRIAAYEEGGKFI-GHRILPVQAIRPGYH 460 470 480 490 500 510 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 HLQLRNLHNEILEISSLFINSRRMEENPSGSSMPASLMFNTEERKCSQTHKVTVHGVPGP .. ::: .:. : ..:: ... . .:. ..... .: mKIAA0 YICLRNERNQPL-------------------TLPAVFVYIEVKDYVPDTYADVIEALSNP 520 530 540 550 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA1 EPFAVFTINEGTKAKQLLQQVLAVDQDTKCTATDYFLMEEKHFISKEKNECRKQPFQRAV .. .. : .:::: .: ....: : . . :. .: : : . .: mKIAA0 IRYV--NLME-QRAKQLAALTLEDEEEVKKEA------DPGETSSEAPSETRTTPAENGV 560 570 580 590 600 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA1 GPEEDIVQILNSWFPE-EGYVGRIVLKPQQETLEEKSIVFDDKEVILSSEEESFFVQVHD . ... : :. . : . . : : .. .. . ..: .... ::... mKIAA0 NHTASLAPKPPSQAPHSQPAPGSVKAPAKTEDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQK 610 620 630 640 650 660 1210 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA1 VSPEQPRTVIKAPRVSTAQDVIQQTLCKAKYSYSILNNPNPCDYVLLEEVLKDAANKKS- .. . ..: . .:.. . ..: .:. ..: . ::. : ..::: mKIAA0 KHYKEMKDLVKRHHKKTTELIKEHTT-----KYNEIQNDYLRRRAALEKSAKKDSKKKSE 670 680 690 700 710 720 1270 1280 1290 1300 1310 mKIAA1 -STPKSSQRILLDQECVFQAQSKWK------GAGKFILKLK-EQVQASREDKRRGISFAS :.: .. . .. ...:. : . .:.:. :: . . .::. :.. mKIAA0 PSSPDHGSSAIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQQLLNLRQEQYYSEKYQKREHIKLL- 730 740 750 760 770 780 1320 1330 1340 1350 1360 mKIAA1 ELKKLTKSTKQSRGLPSPPQLVASESVQSKEEKPVGALSSSDTVGYQQ ..::: ... .. :: . . ::.: mKIAA0 -IQKLTDVAEECQN----NQLKKLKEICEKEKKELKKKMDKKRQEKITEAKSKDKSQMEE 790 800 810 820 830 mKIAA0 EKTEMIRSYIQEVVQYIKRLEEAQSKRQEKLVEKHNEIRQQILDEKPKSQLQTELEQEYQ 840 850 860 870 880 890 >>mKIAA1092 ( 889 res) mbg09321 (889 aa) initn: 925 init1: 433 opt: 587 Z-score: 516.2 bits: 107.3 E(): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 867; 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