FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1092.ptfa, 889 aa vs ./tmplib.26680 library 1768128 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4274+/-0.00437; mu= 18.5717+/- 0.291 mean_var=85.8611+/-20.206, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 135 in 1/35 Lambda= 0.1384 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 ( 801) 1452 301 5e-82 mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289) 774 165 3.8e-41 mKIAA0450 ( 1592 res) mbg09026 (1592) 740 159 4.8e-39 mKIAA1516 ( 1364 res) mbg09342 (1364) 587 128 6.9e-30 mKIAA4098 ( 1048 res) mpg00558 (1048) 581 127 1.3e-29 mKIAA0581 ( 962 res) mbg02025 ( 962) 556 122 4.1e-28 >>mKIAA1964 ( 801 res) meh02207 (801 aa) initn: 1279 init1: 922 opt: 1452 Z-score: 1565.0 bits: 300.6 E(): 5e-82 Smith-Waterman score: 1452; 38.776% identity (39.968% ungapped) in 637 aa overlap (16-644:175-800) 10 20 30 40 mKIAA1 ANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWISQMFS-EIDVD ...::. . .. . :. . . . .: mKIAA1 VREGHQSEGLRRFGGAFAPACCLTIAFKGRRKNLDLAAPTAEEAQR-WVRGLAKLRARLD 150 160 170 180 190 200 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 GLGHIT-LCHAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKELHKSKDKAGTEITKEEFIEVF-HELCT .... : .. . :..: .... .. .: : :....: . ::.: ..: mKIAA1 AMSQRERLDQSFKEIKSLLRMVNVDMNDMYAYRLFKECDHSNNERLEGAEIEAFLRRLLK 210 220 230 240 250 260 110 120 130 140 150 160 mKIAA1 RPEIYFLLVQFSSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINEEISLEIIHKYEPSKEGQEKGWL :::. .. ..:.. . :....:. ::: .:: . . ..:. :: .. :... . mKIAA1 RPELEEIFRRYSGEDRVLSASELLEFLE-DQGEDGATLACAQQLIQTYELNETGEQHELM 270 280 290 300 310 320 170 180 190 200 210 220 mKIAA1 SIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTYLIEDQFRGPSDITGYI ..::: ::.::. .. : : ::: :::.::::.::::::: ..:. : :. .:: mKIAA1 TLDGFMMYLLSPEGAALNVAHTCVFQDMGQPLAHYFISSSHNTYLTDSQIGGTSSTEAYI 330 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 mKIAA1 RALKMGCRSVELDVWDGPDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDIINKYAFFASEYPLILCLE ::. .::: :::: :.:: .::::: :::.::.:.::.::. . .:: .: ::.:: :: mKIAA1 RAFAQGCRCVELDCWEGPGGEPVIYHGHTLTSKILFRDVIQAVRDHAFTSSPYPVILSLE 390 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 mKIAA1 NHCSIKQQKVMVQHMKKILGDKLYTT---SPNMEESYLPSPDV-LKGKILIKAKKLSSNC :::...:: ::..:...:::: : : : : :: ::::. :::.::.:.::: . mKIAA1 NHCGLEQQAVMARHLRSILGDMLVTQALDSQNPEE--LPSPEQQLKGRILVKGKKLPAAR 450 460 470 480 490 500 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 SGVEGDVTDEDEGAEMSQRMGKENVEQPNHVPVKRFQLCKELSELVSICKSVQFKEFQVS : .: . .. : : .. ..: .: .. . :. ::: :. : ..... .. : mKIAA1 SE-DGRILSDREEEEEEEEEAEEALEAAEQRSRAK-QISPELSALAVYCCATRLRTLDPS 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 FQVQKYWEVCSFNEVLASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCG . : :..: : :.. : .:: .: . :.::.: .:..:.:.:::..:. : mKIAA1 PGPPQSCTVGSLSERKARKFTREAGTSFVRHNTQQLTRVYPLGLRMNSANYNPQEMWNSG 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 CQIVAMNFQTPGLMMDLNVGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLL ::.::.:::::: ::::.: : ::.:::::.:: .:. . :. . :: : mKIAA1 CQLVALNFQTPGYEMDLNTGRFLINGQCGYVLKPAYLRQLNTTFDPEC----PGPPRTTL 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 HIKIISGQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVNQNGDAPIFDESFE :.....:..:: .. ...::: : :::::.: :::...: : .:: : ...... mKIAA1 AIQVLTAQQLPKLNAE-KPSSIVDPLVRVEIHGVPEDCAQKETDYVLNNGFNPCWEQTLQ 680 690 700 710 720 730 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 FQINLPELAMVRFVVLDDDYIG-DEFIGQYTIPFECLQTGYRHVPLQSLTGEVLAHASLF :.. :::..::::: : : . ..:.:: :.:. :. ::::. : : : :: :.:: mKIAA1 FRLRAPELVLVRFVVEDYDTTSPNDFVGQSTLPLSSLKQGYRHIHLLSKDGASLAPATLF 740 750 760 770 780 790 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 VHVAITNRRGGGKPHKRGLSVRKGKKSREYASLRTLWIKTVDEVFKNAQPPIRDATDLRE ::. : : mKIAA1 VHIRIQNS 800 >>mKIAA1069 ( 1289 res) mfj10223 (1289 aa) initn: 877 init1: 613 opt: 774 Z-score: 831.0 bits: 165.5 E(): 3.8e-41 Smith-Waterman score: 798; 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