# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg09212.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1612.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1612, 543 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920736 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2701+/-0.000183; mu= 11.5345+/- 0.010 mean_var=74.5685+/-14.820, 0's: 34 Z-trim: 36 B-trim: 2848 in 1/67 Lambda= 0.148524 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123787387|sp|Q3U0K8.1|OGFD1_MOUSE RecName: Full ( 545) 3702 802.7 0 gi|74147689|dbj|BAE38717.1| unnamed protein produc ( 545) 3665 794.7 0 gi|73949826|ref|XP_535297.2| PREDICTED: similar to ( 545) 3143 682.9 6.3e-194 gi|10434339|dbj|BAB14226.1| unnamed protein produc ( 542) 3133 680.7 2.8e-193 gi|74728942|sp|Q8N543.1|OGFD1_HUMAN RecName: Full= ( 542) 3128 679.7 5.8e-193 gi|10433458|dbj|BAB13967.1| unnamed protein produc ( 542) 3123 678.6 1.2e-192 gi|149699558|ref|XP_001492988.1| PREDICTED: simila ( 545) 3119 677.7 2.2e-192 gi|75054709|sp|Q5R4R3.1|OGFD1_PONAB RecName: Full= ( 542) 3117 677.3 3e-192 gi|158563809|sp|Q3MI03.2|OGFD1_BOVIN RecName: Full ( 542) 2998 651.8 1.4e-184 gi|75775235|gb|AAI04500.1| OGFOD1 protein [Bos tau ( 540) 2991 650.3 4e-184 gi|90083413|dbj|BAE90789.1| unnamed protein produc ( 489) 2774 603.8 3.7e-170 gi|126296157|ref|XP_001364828.1| PREDICTED: hypoth ( 540) 2550 555.8 1.1e-155 gi|149410245|ref|XP_001508441.1| PREDICTED: simila ( 497) 2530 551.5 2e-154 gi|7023103|dbj|BAA91838.1| unnamed protein product ( 402) 2353 513.5 4.5e-143 gi|119603268|gb|EAW82862.1| 2-oxoglutarate and iro ( 402) 2347 512.2 1.1e-142 gi|10436665|dbj|BAB14880.1| unnamed protein produc ( 402) 2338 510.3 4.2e-142 gi|194385994|dbj|BAG65372.1| unnamed protein produ ( 386) 2173 474.9 1.8e-131 gi|118096214|ref|XP_414062.2| PREDICTED: hypotheti ( 462) 2062 451.2 3e-124 gi|224064208|ref|XP_002188514.1| PREDICTED: simila ( 448) 1954 428.1 2.7e-117 gi|25955561|gb|AAH40267.1| Ogfod1 protein [Mus mus ( 488) 1919 420.6 5.2e-115 gi|74211190|dbj|BAE37671.1| unnamed protein produc ( 494) 1919 420.6 5.2e-115 gi|148224284|ref|NP_001087226.1| 2-oxoglutarate an ( 502) 1919 420.6 5.3e-115 gi|73949828|ref|XP_863140.1| PREDICTED: similar to ( 269) 1519 334.7 2.1e-89 gi|110645348|gb|AAI18749.1| Ogfod1 protein [Xenopu ( 470) 1501 331.0 4.6e-88 gi|62858691|ref|NP_001016322.1| 2-oxoglutarate and ( 509) 1501 331.0 4.9e-88 gi|82182606|sp|Q6DE73.1|OGFD1_XENLA RecName: Full= ( 511) 1490 328.7 2.5e-87 gi|33416415|gb|AAH55624.1| 2-oxoglutarate and iron ( 482) 1427 315.2 2.8e-83 gi|156224253|gb|EDO45080.1| predicted protein [Nem ( 511) 1140 253.7 9.5e-65 gi|47230368|emb|CAF99561.1| unnamed protein produc ( 391) 1106 246.3 1.2e-62 gi|215502508|gb|EEC12002.1| 2-oxoglutarate and iro ( 504) 1105 246.2 1.7e-62 gi|221131225|ref|XP_002154702.1| PREDICTED: simila ( 611) 1081 241.1 7e-61 gi|190582936|gb|EDV23007.1| hypothetical protein T ( 442) 889 199.8 1.3e-48 gi|156543699|ref|XP_001605634.1| PREDICTED: hypoth ( 648) 821 185.4 4.3e-44 gi|110762092|ref|XP_001121712.1| PREDICTED: simila ( 604) 792 179.2 3e-42 gi|189240835|ref|XP_001812198.1| PREDICTED: simila ( 544) 757 171.6 5.1e-40 gi|212510965|gb|EEB14045.1| conserved hypothetical ( 532) 666 152.1 3.7e-34 gi|210110050|gb|EEA57904.1| hypothetical protein B ( 220) 575 132.3 1.4e-28 gi|187037401|emb|CAP24067.1| Hypothetical protein ( 481) 574 132.4 2.9e-28 gi|861277|gb|AAB93451.1| Hypothetical protein C17G ( 480) 563 130.0 1.5e-27 gi|193605848|ref|XP_001945000.1| PREDICTED: simila ( 453) 526 122.1 3.5e-25 gi|198420064|ref|XP_002123103.1| PREDICTED: simila ( 538) 495 115.5 4e-23 gi|108876569|gb|EAT40794.1| nikI, nikkomycin biosy ( 381) 470 110.0 1.2e-21 gi|194129064|gb|EDW51107.1| GM17768 [Drosophila se ( 523) 454 106.7 1.7e-20 gi|194142727|gb|EDW59130.1| GJ10452 [Drosophila vi ( 551) 427 100.9 9.9e-19 gi|193915885|gb|EDW14752.1| GI23150 [Drosophila mo ( 547) 420 99.4 2.8e-18 gi|210110051|gb|EEA57905.1| hypothetical protein B ( 218) 410 97.0 6e-18 gi|190628318|gb|EDV43842.1| GF18678 [Drosophila an (1037) 416 98.8 8.3e-18 gi|194169834|gb|EDW84735.1| GK14270 [Drosophila wi ( 529) 406 96.4 2.2e-17 gi|194102973|gb|EDW25016.1| GL23075 [Drosophila pe ( 536) 405 96.2 2.5e-17 gi|54638141|gb|EAL27543.1| GA16024 [Drosophila pse ( 536) 403 95.8 3.4e-17 >>gi|123787387|sp|Q3U0K8.1|OGFD1_MOUSE RecName: Full=2-o (545 aa) initn: 3700 init1: 3369 opt: 3702 Z-score: 4285.2 bits: 802.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 3702; 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82.537% identity (94.669% similar) in 544 aa overlap (1-543:2-542) 10 20 30 40 50 mKIAA1 NGKRPADPGPARPMKKGKKQVSAEFSDAVTEEILRKQVAEAWSCRTPFSH-AIALDMDP ::::::.::::: :: ::.: :::::::::: :.:::::::: :::::: .:..:::: gi|750 MNGKRPAEPGPARVGKKRKKEVMAEFSDAVTEETLKKQVAEAWSRRTPFSHEVIVMDMDP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 FLHCVIPNFIQSQDFLEGLHKELLSLDFHEKYNDLYKFQQSDDLKNRKEPHISALRKLMF :::::::::::::::::::.:::..::::::::::::::::::::.:.:::::::::..: gi|750 FLHCVIPNFIQSQDFLEGLQKELMNLDFHEKYNDLYKFQQSDDLKKRREPHISALRKILF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 EDFRAWLSKVSGIDLEPTIDMSCAKYEFTDALLCHDDELEGRRIAFILYLVPSWDRDLGG ::::.::: .: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::: gi|750 EDFRSWLSDISKIDLESTIDMSCAKYEFTDALLCHDDELEGRRIAFILYLVPPWDRSLGG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 TLDLYDTDEHLQPKQIVKSLIPSWNKLVFFEVSPVSFHQVSEVLSEETSRLSISGWFYGP :::::. :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:: gi|750 TLDLYSIDEHFQPKQIVKSLIPSWNKLVFFEVSPVSFHQVSEVLSEEKSRLSISGWFHGP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 SLTRPPTYFEPPIPRNPHIPQDHEILYEWINPAYLEMDYQMQIQEEFEERSEILLKEFLK ::::::..:::::::.:::::::::::.::::.::.::::.:::::::: :::::::::: gi|750 SLTRPPNHFEPPIPRSPHIPQDHEILYDWINPTYLDMDYQVQIQEEFEESSEILLKEFLK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 PEKFAEVCEALEKGDVEWKSHGPPNKRFYEKAEENNLPDVLKECMGLFRSEALFLLLSNL :::: .::::::.:::::.:.:::::::::::::..::..::::: ::.::::::::::. gi|750 PEKFMKVCEALEHGDVEWSSRGPPNKRFYEKAEESKLPEILKECMKLFHSEALFLLLSNF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 TGLKLHFLAPSEDDETEEKGEGETASAAAGTEEGTSRRPSGPENNQVAAGSHSQENGEQA ::::::::::::.:: ..: :.:.:. ::::::. : :::::.: ...::...::. gi|750 TGLKLHFLAPSEEDEMNDKKEAEAADI---TEEGTSHSPPEPENNQTAISNNSQQSNEQT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 DPEAQEEEAKKESSVPMCQGELRRWKTGHYTLVHDNTKTEFALDLFLYCGCEGWEPEYGG ::: .:.:.::::::: :::::::::::::::.::..:.::::::.:::::::::::::: gi|750 DPEPEENETKKESSVPTCQGELRRWKTGHYTLIHDHSKAEFALDLILYCGCEGWEPEYGG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 FTSYIAKGEDEELLIVNPENNSLALVYRDRETLRFVKHINHRSLEQSKAFPSRSGFWDFA :::::::::::::: ::::.:::::::::::::.::::::::::::.:.::.:.:::::. gi|750 FTSYIAKGEDEELLTVNPESNSLALVYRDRETLKFVKHINHRSLEQKKTFPNRTGFWDFS 480 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 FIYYE ::::: gi|750 FIYYE 540 >>gi|158563809|sp|Q3MI03.2|OGFD1_BOVIN RecName: Full=2-o (542 aa) initn: 2922 init1: 1916 opt: 2998 Z-score: 3470.0 bits: 651.8 E(): 1.4e-184 Smith-Waterman score: 2998; 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80.110% identity (92.265% similar) in 543 aa overlap (2-543:1-540) 10 20 30 40 50 mKIAA1 NGKRPADPGPARPMKKGKKQVSAEFSDAVTEEILRKQVAEAWSCRTPFSH-AIALDMDPF :::::.:: : :: ::.: :.:::::::: :.:::::::: :::: : ::..::::: gi|757 GKRPAEPGSDRAGKKVKKEVMAKFSDAVTEETLKKQVAEAWSRRTPFRHEAIVMDMDPF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 LHCVIPNFIQSQDFLEGLHKELLSLDFHEKYNDLYKFQQSDDLKNRKEPHISALRKLMFE ::::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::.:.:::: ::::..:: gi|757 LHCVIPNFIQSQNFLEGLQKELLNLDFHEKYNDLYKFQQSDDLKKRREPHICALRKILFE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 DFRAWLSKVSGIDLEPTIDMSCAKYEFTDALLCHDDELEGRRIAFILYLVPSWDRDLGGT ::.:.: .: :::: :::::::::::.::::::::::::::::::::::: :: .:::: gi|757 HFRSWISDISKIDLESTIDMSCAKYEFSDALLCHDDELEGRRIAFILYLVPPWDASLGGT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 LDLYDTDEHLQPKQIVKSLIPSWNKLVFFEVSPVSFHQVSEVLSEETSRLSISGWFYGPS :::...:::.:::::::::::::: ::::::::::::::::::::: :::::::::.::: gi|757 LDLFSVDEHFQPKQIVKSLIPSWNTLVFFEVSPVSFHQVSEVLSEEKSRLSISGWFHGPS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 LTRPPTYFEPPIPRNPHIPQDHEILYEWINPAYLEMDYQMQIQEEFEERSEILLKEFLKP :::::::::: : :.:::::::::::.::::.::.:.:: :::::::: :::::::::.: gi|757 LTRPPTYFEPLIARSPHIPQDHEILYDWINPTYLDMEYQAQIQEEFEESSEILLKEFLQP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 EKFAEVCEALEKGDVEWKSHGPPNKRFYEKAEENNLPDVLKECMGLFRSEALFLLLSNLT :::::::::::.: :::.:.:::::::::::::..:::.:..::.::::::.::::::.: gi|757 EKFAEVCEALERGRVEWSSRGPPNKRFYEKAEESQLPDILRDCMALFRSEAMFLLLSNFT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 GLKLHFLAPSEDDETEEKGEGETASAAAGTEEGTSRRPSGPENNQVAAGSHSQENGEQAD :::::::::::: : :.: : ...::: .::::::. : :::. .:... : .. .: gi|757 GLKLHFLAPSED-EPEDKKERDAVSAAENTEEGTSHSSSEPENSWAATSDSSLQSEGPTD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 PEAQEEEAKKESSVPMCQGELRRWKTGHYTLVHDNTKTEFALDLFLYCGCEGWEPEYGGF :: :.::::::::: ::::::.::::::::.:::.::::::::.::::::::::::::: gi|757 PE--EDEAKKESSVPTCQGELRHWKTGHYTLIHDNSKTEFALDLLLYCGCEGWEPEYGGF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 TSYIAKGEDEELLIVNPENNSLALVYRDRETLRFVKHINHRSLEQSKAFPSRSGFWDFAF ::::::::::::: ::::::::::::::::::.::::::::::::.:.::.:.:::::.: gi|757 TSYIAKGEDEELLTVNPENNSLALVYRDRETLKFVKHINHRSLEQKKSFPNRTGFWDFSF 480 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 IYYE .::: gi|757 VYYE 540 543 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Sun Mar 15 03:29:09 2009 done: Sun Mar 15 03:36:27 2009 Total Scan time: 976.370 Total Display time: 0.180 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]