FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0435.ptfa, 1388 aa vs ./tmplib.26680 library 1767629 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7531+/-0.0054; mu= 7.9223+/- 0.358 mean_var=152.8860+/-35.888, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/35 Lambda= 0.1037 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0805 ( 1659 res) mpf00243 (1659) 4794 731 5.5e-211 mKIAA4073 ( 797 res) mbh01340 ( 797) 2983 459 1.2e-129 >>mKIAA0805 ( 1659 res) mpf00243 (1659 aa) initn: 3518 init1: 2200 opt: 4794 Z-score: 3880.3 bits: 730.7 E(): 5.5e-211 Smith-Waterman score: 4794; 54.511% identity (56.115% ungapped) in 1330 aa overlap (5-1317:245-1553) 10 20 30 mKIAA0 GSPDPSSGDPAVSALQQQLLLMVARRTQSETPRH : : ..:: . :. .. .. . .: mKIAA0 PPTLLIGSPLSLQDGQQGQQSTAQVKVQSRPPSQAAVLSASASLLVDLLEQQDIDLSP-- 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 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