# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg09138.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0435.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0435, 1388 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918787 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2374+/-0.00019; mu= 15.3914+/- 0.011 mean_var=90.6516+/-17.814, 0's: 35 Z-trim: 39 B-trim: 2730 in 1/67 Lambda= 0.134706 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|189029583|sp|Q5DU28.2|PCX2_MOUSE RecName: Full= (2122) 9330 1824.7 0 gi|109509074|ref|XP_001055579.1| PREDICTED: simila (2119) 8914 1743.9 0 gi|73952586|ref|XP_546085.2| PREDICTED: similar to (1964) 8355 1635.2 0 gi|119590391|gb|EAW69985.1| pecanex-like 2 (Drosop (2074) 8332 1630.8 0 gi|189029600|sp|A6NKB5.3|PCX2_HUMAN RecName: Full= (2137) 8332 1630.8 0 gi|149690656|ref|XP_001493647.1| PREDICTED: pecane (2135) 8304 1625.3 0 gi|109019965|ref|XP_001103740.1| PREDICTED: simila 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