# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mbg09122.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1632.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1632, 1577 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7921215 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1370+/-0.000184; mu= 15.4406+/- 0.010 mean_var=70.6808+/-13.777, 0's: 31 Z-trim: 32 B-trim: 306 in 1/65 Lambda= 0.152554 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148677494|gb|EDL09441.1| mCG125522, isoform CRA (2065) 10477 2316.3 0 gi|149029474|gb|EDL84688.1| rCG41226, isoform CRA_ (2065) 9791 2165.3 0 gi|149029475|gb|EDL84689.1| rCG41226, isoform CRA_ (2575) 9791 2165.4 0 gi|109507594|ref|XP_001056478.1| PREDICTED: simila (2581) 9791 2165.4 0 gi|109122091|ref|XP_001089105.1| PREDICTED: simila (2521) 9234 2042.8 0 gi|114672979|ref|XP_512111.2| PREDICTED: hypotheti (2581) 9219 2039.5 0 gi|73961705|ref|XP_537275.2| PREDICTED: similar to 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