FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4075.ptfa, 1945 aa vs ./tmplib.26680 library 1767072 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3933+/-0.00714; mu= -6.8115+/- 0.471 mean_var=298.0542+/-71.270, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0743 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0444 ( 702 res) mbg07064 ( 702) 1387 163 2.1e-40 mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890) 1222 146 9.3e-35 mKIAA1259 ( 1196 res) mpm05149 (1196) 542 73 5.7e-13 mKIAA1122 ( 1071 res) mbh00587 (1071) 436 62 1.4e-09 mKIAA0809 ( 1368 res) mbp01279 (1368) 284 45 0.00013 mKIAA1696 ( 675 res) mpm12224 ( 675) 255 42 0.00067 mKIAA1113 ( 1071 res) mpm06042 (1071) 232 40 0.0052 >>mKIAA0444 ( 702 res) mbg07064 (702 aa) initn: 2450 init1: 1290 opt: 1387 Z-score: 817.9 bits: 163.3 E(): 2.1e-40 Smith-Waterman score: 3013; 67.486% identity (69.806% ungapped) in 692 aa overlap (1257-1945:2-673) 1230 1240 1250 1260 1270 1280 mKIAA4 KTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDET ::::. :::::::::: :: .::::::: : mKIAA0 PGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDAT 10 20 30 1290 1300 1310 1320 1330 1340 mKIAA4 EDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQ .:::::.::::::::::::::::::. : :: ::::.:::::.::::::::::::::::: mKIAA0 DDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREED-GVEE-VEREVIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQ 40 50 60 70 80 1350 1360 1370 1380 1390 1400 mKIAA4 QEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP- ::::::::::::::::::::::.::::..:::. :::::.::..::. ::::.:: :. mKIAA0 QEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQS 90 100 110 120 130 140 1410 1420 1430 1440 1450 1460 mKIAA4 -RRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQW :: ::. :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::...: mKIAA0 GRRQSRRQLKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHW 150 160 170 180 190 200 1470 1480 1490 1500 1510 1520 mKIAA4 LVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIR :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: mKIAA0 LVRDLRGKSEKEFRAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVR 210 220 230 240 250 260 1530 1540 1550 1560 1570 1580 mKIAA4 KKVQEFEHVNGRWSMPELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAED :::::::::::..: :.:. : :.:: .. : .:.::.:..: : .::: mKIAA0 KKVQEFEHVNGKYSTPDLVPEGAEGKKPGEVISSDPNTPVPASP--------AQLPPAPL 270 280 290 300 310 320 1590 1600 1610 1620 1630 1640 mKIAA4 GIKIEENSLKEEESTEGEKEVKSSAPEATVECAQLPAPATAPATAPATATAPEDDKAPAE :. .... . . ::: . :. ..: ::. .. :.: : mKIAA0 GLT---DKMEAQLGYTDEKESGMQKPKKSLEIQTLPTALDRVEGEDKHQSSDSKDRAREE 330 340 350 360 370 1650 1660 1670 1680 1690 1700 mKIAA4 PPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEAKGTTEVEKVEEKSAVDLTPIVVEDKEEKKEEEEKK : .::::. . :.:.. :. . : . .: ..: .. : ::.. mKIAA0 RTE---EVEKAQGSP--EQPLKEEV--LPDKEPIPDKPELSLGHSGDFRPDDPKTEEKEP 380 390 400 410 420 430 1710 1720 1730 1740 1750 1760 mKIAA4 DVMLQNGETPKDLSDEKQKKNSKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWH :::. .: .:. ::.: .::::::::::::::.:::::::::. . : ::::: mKIAA0 GETQQNGDREEDEEGKKEDKNGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYEIWH 440 450 460 470 480 490 1770 1780 1790 1800 1810 1820 mKIAA4 RRHDYWLLAGIINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLE :::::::::::..::::::::::::::: :::::::.:...::.::.::::::::::::: mKIAA0 RRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEIHKGNYLEMKNKFLARRFKLLE 500 510 520 530 540 550 1830 1840 1850 1860 1870 1880 mKIAA4 QALVIEEQLRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVL :::::::::::::::::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::: mKIAA0 QALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL 560 570 580 590 600 610 1890 1900 1910 1920 1930 1940 mKIAA4 HKVLKQLEELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPPPQQVAQ ::::.:::::::::::::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .: ::... mKIAA0 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQTSS 620 630 640 650 660 670 mKIAA4 QQ .. mKIAA0 RRRDFPLFQRSFPAEPSHLPNPRGREKLQPF 680 690 700 >>mKIAA0308 ( 1890 res) mia33045 (1890 aa) initn: 1179 init1: 629 opt: 1222 Z-score: 716.3 bits: 145.9 E(): 9.3e-35 Smith-Waterman score: 1244; 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