FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1209.ptfa, 1220 aa vs ./tmplib.26680 library 1767797 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6678+/-0.0059; mu= 5.1841+/- 0.394 mean_var=188.8684+/-45.785, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 143 in 1/35 Lambda= 0.0933 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00018 ( 1372 res) mpm05346 (1372) 901 135 1.1e-31 mKIAA0362 ( 806 res) mbe05003 ( 806) 344 59 2.7e-09 mFLJ00298 ( 577 res) mbg10993 ( 577) 316 56 2.9e-08 mKIAA0142 ( 809 res) mbg20462 ( 809) 306 54 9.4e-08 mKIAA0424 ( 520 res) mbg05532 ( 520) 300 53 1.2e-07 mKIAA1415 ( 1665 res) mib23074 (1665) 303 54 2.1e-07 mKIAA2016 ( 1731 res) mbg07142 (1731) 256 48 1.7e-05 mKIAA1362 ( 1407 res) mia41047 (1407) 247 47 3.4e-05 mKIAA1112 ( 280 res) mbg21942 ( 280) 230 44 5.3e-05 mFLJ00068 ( 1002 res) mbg21780 (1002) 225 44 0.00021 mKIAA4239 ( 1059 res) mfj24184 (1059) 197 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.. .: ..:. .. ... :. :::: . :: ::.. ........ :. . mKIAA0 KLEDSENHR-NAFEISGSMIERILVSCTSQQDLHEWVEHLQK---QTKVTSVSNPTIKPH 550 560 570 580 590 270 280 290 300 310 mKIAA1 AILEMDAIHYPGFCYSPEGEMKTPCGSAP--HRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETSQDIQKV .. .: : ... : : . .: : : .:: :. . : . mKIAA0 SVPSHTLPSHPLTPSSKHADSK-PVALTPAYHTL---PHPS---HHGTPHTTISWGPLEP 600 610 620 630 640 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 SREESPSQLTSAVPAQRNCQPGSAAVINMLRGGGGVRSPWTDHHI--RQRTDHHIRQPLF . .: .:. :: .:..: . .:: : ... ... ... . : mKIAA0 PKTPKPWSLSCLRPAP-PLRPSAA----LCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEF 650 660 670 680 690 700 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 PSRRSPQENEDDDDDYQMFVPSFSSSDLNSTRLCEENASSRPCSWHLGLIEPTEISSSGH :.: :.: mKIAA0 AVRKSTAALEEDAQILKVIEAYCTSAKTRQTLNSTWQGTDLMHNHVLADDDQSSLDSLGR 710 720 730 740 750 760 >>mKIAA0424 ( 520 res) mbg05532 (520 aa) initn: 239 init1: 159 opt: 300 Z-score: 229.6 bits: 53.3 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 320; 26.481% identity (29.119% ungapped) in 287 aa overlap (2-263:166-451) 10 20 mKIAA1 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: .::. ::. :. :...:: . mKIAA1 ICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHTAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEALEQLQSHIE 210 220 230 240 250 260 150 160 170 180 190 mKIAA1 NWEGPDLTSY-GELVLEGTF-RIQKAK-KERTLFLLDQLLLITKKRDDTFTYKAHILCGN .::: .::. ::.:.:.. .:. .. .::..::.:.::. :... mKIAA1 GWEGSNLTDICTELLLQGNLLKISAGNIQERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTGSKKSTKRTK 270 280 290 300 310 320 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 LMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAAAKIPAK mKIAA1 SINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGWKIHNTAKNKWFVCMAKTAE 330 340 350 360 370 380 >>mKIAA2016 ( 1731 res) mbg07142 (1731 aa) initn: 210 init1: 180 opt: 256 Z-score: 190.9 bits: 47.9 E(): 1.7e-05 Smith-Waterman score: 266; 31.073% identity (33.537% ungapped) in 177 aa overlap (20-184:1228-1403) 10 20 30 40 mKIAA1 ELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAVLTECMR :. ...:..:. .:.:. . :: . mKIAA2 LEDAISASSDFSVLETPSQFRKLLFSLGGSFLYYADHFKLYSGFCANHIKVQRVLERAKT 1200 1210 1220 1230 1240 1250 50 60 70 80 90 100 mKIAA1 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