FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0694.ptfa, 1816 aa vs ./tmplib.26680 library 1767201 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9300+/-0.00425; mu= 18.3021+/- 0.285 mean_var=91.9753+/-21.735, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 5 in 1/35 Lambda= 0.1337 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1058 ( 2072 res) mbf00778 (2072) 3498 687 1.5e-197 mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a ( 727) 1455 292 3.4e-79 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 1428 287 1.7e-77 mKIAA1395 ( 1930 res) mpf00633 (1930) 1319 266 5.1e-71 mKIAA0716 ( 2035 res) mbg02304 (2035) 295 69 1.6e-11 >>mKIAA1058 ( 2072 res) mbf00778 (2072 aa) initn: 6360 init1: 1580 opt: 3498 Z-score: 3639.1 bits: 686.8 E(): 1.5e-197 Smith-Waterman score: 6368; 54.095% identity (57.626% ungapped) in 1795 aa overlap (5-1771:359-2071) 10 20 30 mKIAA0 VKTTRNMGRLNLFSLDPDIDTLKLQKRDSFENEL .. .:..:: :::: :: : : 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1470 1480 1490 1500 1220 1230 1240 1250 1260 1270 mKIAA0 EVLKCCNHRSRLTQMEASALLYFFMRKNFEFNKQKSIVRSHLQLIKAVSQLIADA-GIGG ::::::: . . ::: ::::.::.::... .::.::.:::.: .:::::::. :::: mKIAA1 EVLKCCNSKLSSIRTEASQLLYFLMRNNFDYTGKKSFVRTHLQVIISVSQLIADVVGIGG 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1280 1290 1300 1310 1320 1330 mKIAA0 SRFQHSLAITNNFANGDKQMKNSNFPAEVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHEKDPEMLVDLQ .:::.::.: :: ::.:. .:...: ..::::::::::::::::::::::.: ::::::: mKIAA1 TRFQQSLSIINNCANSDRIIKHTSFSSDVKDLTKRIRTVLMATAQMKEHENDREMLVDLQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1340 1350 1360 1370 1380 1390 mKIAA0 YSLANSYASTPELRRTWLESMAKIHARNGDLSEAAMCYIHIAALIAEYLKRKGMFSMGWP ::::.:::::::::.:::.:::.::..:::::::::::.:..::.:::: ::::: .: mKIAA1 YSLAKSYASTPELRKTWLDSMARIHVKNGDLSEAAMCYVHVTALVAEYLTRKGMFRQGCT 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1400 1410 1420 1430 1440 1450 mKIAA0 AFLSITPNIKEEGAMKEDSGMQDTPYNENILVEQLYMCVEFLWKSERYELIADVNKPIIA :: ::::: ::..: :: ::::. .::..:.: : .:.. :::.::::::::. : :: mKIAA1 AFRVITPNIDEEASMMEDVGMQDVHFNEDVLMELLEQCADGLWKAERYELIADIYKLIIP 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1460 1470 1480 1490 1500 mKIAA0 VFEKQRDFKKLSDLYYDIHRSYLKVAEVVNSEKRLFGRYYRVAFYGQAV----------- ..::.:::..:. :: .::.: ::.::..: .::.: :.::::.:::. mKIAA1 IYEKRRDFERLAHLYDTLHRAYSKVTEVMHSGRRLLGTYFRVAFFGQAAQYQFTDSETDV 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1510 1520 1530 1540 1550 1560 mKIAA0 -GFFEEEEGKEYIYKEPKLTGLSEISQRLLKLYADKFGADNVKIIQDSNKVNPKDLDPKY ::::.:.:::::::::::: ::::::::::::.::::..:::.::::.:::::::: :. mKIAA1 EGFFEDEDGKEYIYKEPKLTPLSEISQRLLKLYSDKFGSENVKMIQDSGKVNPKDLDSKF 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1570 1580 1590 1600 1610 1620 mKIAA0 AYIQVTYVTPFFEEKEIEDRKTDFEMHHNINRFVFETPFTLSGKKHGGVAEQCKRRTVLT ::::::.:::::.:::...:.:.:: ::: ::.:: ::: .::..::: :::::::.:: mKIAA1 AYIQVTHVTPFFDEKELQERRTEFERCHNIRRFMFEMPFTQTGKRQGGVEEQCKRRTILT 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1630 1640 1650 1660 1670 1680 mKIAA0 TSHLFPYVKKRIQVISQSSTELNPIEVAIDEMSRKVSELNQLCTTEEVDMIRLQLKLQGS . : :::::::: :. : :.::::::::::::.::.:: :::.. :::::.:::::::: mKIAA1 AIHCFPYVKKRIPVMYQHHTDLNPIEVAIDEMSKKVAELRQLCSSAEVDMIKLQLKLQGS 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1690 1700 1710 1720 1730 1740 mKIAA0 VSVKVNAGPMAYARAFLEETNAKKYPDNQVKLLKEIFRQFADACGQALDVNERLIKEDQL :::.:::::.:::::::..::.:.::::.::::::.::::..:::::: ::::::::::: mKIAA1 VSVQVNAGPLAYARAFLDDTNTKRYPDNKVKLLKEVFRQFVEACGQALAVNERLIKEDQL 1990 2000 2010 2020 2030 2040 1750 1760 1770 1780 1790 1800 mKIAA0 EYQEELRSHYKDMLSELSAIMNEQLCRGPCLYSFCASVSSISLSTVSKSDYGQGRPSKVR :::::....:..: .::: :: ::. mKIAA1 EYQEEMKANYREMAKELSDIMREQMG 2050 2060 2070 >>mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a (727 aa) initn: 1390 init1: 683 opt: 1455 Z-score: 1514.2 bits: 292.1 E(): 3.4e-79 Smith-Waterman score: 1455; 36.686% identity (37.979% ungapped) in 676 aa overlap (1114-1778:41-704) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 EGHKQHRSQTLPIIRGKNALSNPKLLQMLDNSMNSNSNEIDIVHHVDTEANIATEVCLTI :: . .... .: :.. ..:.:::. : : mKIAA1 RGQLERSPSGSAFGSQENLRWRKDMTHWRQNSEKLDKSRAEIEHEALIDGNLATEANLII 20 30 40 50 60 70 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA0 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..:.:::.:...:.:: . mKIAA1 WAERRRRGPQDRGYSGDDACSFSSFRPATLTVTNFFKQEAERLSDEDLFKFLADMRRPSS 430 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 ISKMQSIPGSLDIAVDNIPLEHPNCVTSSFIPVKPFNVSAQSEPTVEVEEFIYDSTKYCR . . : .: . .. : . :.. ... :::. . ...:: :. :: . . mKIAA1 LLRRLR-PVTLKLDISPAPENLHFCLSPDLLHVKPYP-DPRGRPTKEILEF--PAREVYA 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 PYRVYKNQIYVYPKHLKYDSQKCFNKARNITVCIEFKNSDDDGAKPMKCIYGKPGGPLFT :. :.: ..:::. :...:.. ...::..: :.. ..:. .. . :.:: . :: mKIAA1 PHSCYRNLLFVYPHSLNFSSRQ--GSVRNLAVRIQYMAGEDQ-SQALPVIFGKSSCSEFT 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 SSAYTAVLHHSQNPDFSDEVKIELPTQLHGKHHLLFSFYHITCDINAKANAKKKEALETS :.: :..:...:.: .: :..::. . .:::.:.:::..:. . :::: mKIAA1 REAFTPVVYHNKSPEFYEEFKLRLPACVTENHHLFFTFYHVSCQ------PRPGTALETP 600 610 620 630 640 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 VGYAWLPLMKHDQIASQEYNIPIATTLPPNYLSIQDPTSAKHGGSDIKWVDGGKPLFKVS ::..:.::..: .. . . .:... :: :. : : : ..:::: : .:.: mKIAA1 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