FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1771.ptfa, 727 aa vs ./tmplib.26680 library 1768290 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8818+/-0.00432; mu= 14.8409+/- 0.289 mean_var=90.9427+/-21.290, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.1345 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1395 ( 1930 res) mpf00633 (1930) 3521 694 2.8e-200 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 3353 662 1.3e-190 mKIAA0694 ( 1816 res) mbg08921 (1816) 1455 293 1.3e-79 mKIAA1058 ( 2072 res) mbf00778 (2072) 1237 251 7.6e-67 mKIAA0716 ( 2035 res) mbg02304 (2035) 250 60 3.3e-09 >>mKIAA1395 ( 1930 res) mpf00633 (1930 aa) initn: 3565 init1: 3463 opt: 3521 Z-score: 3687.9 bits: 694.4 E(): 2.8e-200 Smith-Waterman score: 3521; 78.306% identity (79.607% ungapped) in 673 aa overlap (1-673:1269-1930) 10 20 30 mKIAA1 GARQEMVRRSRGQLERSPSGSAFGSQENLR ::::::::::: :::: ::.:::.: mKIAA1 KKAFERINSLTFKKSLDMKARLEEAILGTIGARQEMVRRSR---ERSP----FGNQENVR 1240 1250 1260 1270 1280 1290 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 WRKDMTHWRQNSEKLDKSRAEIEHEALIDGNLATEANLIILDTLEIIVQTVSVTESKESI :::. :::::.:...::.. :.:::::.::::::::.:..::::: ::::: ..:..::: mKIAA1 WRKSATHWRQTSDRVDKTKDEMEHEALVDGNLATEASLVVLDTLETIVQTVMLSEARESI 1300 1310 1320 1330 1340 1350 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 LGGVLKVLLQSMACNQSAVYLQHCFATQRALVSKFPELLFEEETEQCADLCLRLLRHCSS :..::::.: :.. :::..::: .:::::::::::::::::.:: ::::::::::::.: mKIAA1 LSAVLKVVLYSLGSAQSALFLQHGLATQRALVSKFPELLFEEDTELCADLCLRLLRHCGS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 SISTIRSHASASLYLLMRQNFEIGNNFARVKMQVTMSLSSLVGTSQNFNEEFLRRSLKTI ::::: :::::::::::::::::.::::::: :::::::::::.:::.:: ::.::::: mKIAA1 RISTIRMHASASLYLLMRQNFEIGHNFARVKMLVTMSLSSLVGTTQNFSEEHLRKSLKTI 1420 1430 1440 1450 1460 1470 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 LTYAEEDLELRETTFPDQVQDLVFNLHMILSDTVKMKEHQEDPEMLIDLMYRIAKGYQTS :::::::. ::..:: .:::::.:::::::.:::::::::::::::.:::::::.::: : mKIAA1 LTYAEEDIGLRDSTFAEQVQDLMFNLHMILTDTVKMKEHQEDPEMLMDLMYRIARGYQGS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 PDLRLTWLQNMAGKHSERSNHAEAAQCLVHSAALVAEYLSMLEDRKYLPVGCVTFQNISS :::::::::::::::.: .::::::::.::.::::::::..::: ..::::::.:::.:: mKIAA1 PDLRLTWLQNMAGKHAELGNHAEAAQCMVHAAALVAEYLALLEDSRHLPVGCVSFQNVSS 1540 1550 1560 1570 1580 1590 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 NVLEESAVSDDVVSPDEEGICSGKYFTESGLVGLLEQAAASFSMAGMYEAVNEVYKVLIP :::::::.:::..::::::.:::: ::: ::::::::::. :.:.:.::::::::: ::: mKIAA1 NVLEESAISDDILSPDEEGFCSGKNFTELGLVGLLEQAAGYFTMGGLYEAVNEVYKNLIP 1600 1610 1620 1630 1640 1650 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 IHEANRDAKKLSTIHGKLQEAFSKIVHQSTGWERMFGTYFRVGFYGTKFGDLDEQEFVYK : ::.:: :::...::::::::.::.:::.::::.::::::::::::.:::::::::::: mKIAA1 ILEAHRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIMHQSSGWERVFGTYFRVGFYGTRFGDLDEQEFVYK 1660 1670 1680 1690 1700 1710 460 470 480 490 500 510 mKIAA1 EPAITKLAEISHRLEGFYGERFGEDVLEVIKDSNPVDKCKLDPNKAYIQITYVEPFFDTY ::.:::::::::::: :: ::::.::.:.::::::::: ::::.::::::::::: :::: mKIAA1 EPSITKLAEISHRLEEFYTERFGDDVVEIIKDSNPVDKSKLDPQKAYIQITYVEPHFDTY 1720 1730 1740 1750 1760 1770 520 530 540 550 560 570 mKIAA1 EMKDRITYFDKNYNLRRFMYCTPFTLDGRAHGELHEQFKRKTILTTSHAFPYIKTRVNVT :.:::.::::.::.:: :..::::: :::::::: :: ::::.:.: :::::::::. : mKIAA1 ELKDRVTYFDRNYGLRAFLFCTPFTPDGRAHGELAEQHKRKTLLSTEHAFPYIKTRIRVC 1780 1790 1800 1810 1820 1830 580 590 600 610 620 630 mKIAA1 HKEEIILTPIEVAIEDMQKKTQELAFATHQDPADPKMLQMVLQGSVGTTVNQGPLEVAQV :.:: .:::.:::::::::::.::::::.::: : :::::::::::: :::::::::::: mKIAA1 HREETVLTPVEVAIEDMQKKTRELAFATEQDPPDAKMLQMVLQGSVGPTVNQGPLEVAQV 1840 1850 1860 1870 1880 1890 640 650 660 670 680 690 mKIAA1 FLSEIPGDPKLFRHHNKLRLCFKDFTKRCEDALRKNKSLIGPDQKEYQRELERNYHRLKE :::::: :::::::::::::::::: : . .:.. ::: mKIAA1 FLSEIPEDPKLFRHHNKLRLCFKDFCK-VRGCTEKEQ---GPD 1900 1910 1920 1930 700 710 720 mKIAA1 ALQPLINRKIPQLYKAVLPVTCHRDSFSRMSLRKMEL >>mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128 aa) initn: 3425 init1: 1788 opt: 3353 Z-score: 3514.5 bits: 661.5 E(): 1.3e-190 Smith-Waterman score: 3353; 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