FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA3005.ptfa, 1833 aa vs ./tmplib.26680 library 1767184 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6624+/-0.00927; mu= -3.2246+/- 0.614 mean_var=536.5274+/-128.737, 0's: 0 Z-trim: 54 B-trim: 22 in 1/35 Lambda= 0.0554 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 8983 735 5.7e-212 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 7337 603 2e-172 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 6288 519 3e-147 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 1038 100 6.6e-21 mKIAA4211 ( 314 res) mfj31105 ( 314) 904 88 4e-18 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 825 83 6.7e-16 mFLJ00293 ( 1022 res) msh04332 (1022) 733 75 9.8e-14 mKIAA1749 ( 922 res) meh00393 ( 922) 715 74 2.5e-13 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 541 60 4.4e-09 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 470 54 2.7e-07 mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 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NLAEEEEKAKNLTKLKSKHESMISELEVRLKKEEKSRQELEKLKRKLEGDASDFHEQIAD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 940 950 960 970 980 990 mKIAA3 LQAQVDELKVQLTKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVARELQAQIAELQEDFESEKAS ::::. :::.::.:::::::.:::: :.: .:::::: :::...:..::::..::.:. mKIAA0 LQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARLDEEIAQKNNALKKIRELEGHISDLQEDLDSERAA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1000 1010 1020 1030 1040 1050 mKIAA3 RNKAEKQKRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELRTKREQEVAELKKALEDETKNHEAQ :::::::::::.:::::::::::::::.::.:::::.::::::. :::::..::..:::: mKIAA0 RNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTATQQELRAKREQEVTVLKKALDEETRSHEAQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA3 IQDMRQRHATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGLETDNKELACEVKVLQQVKAESEHK .:.:::.:. :.:::.::::: :: ::::.:.:: :: .: .:: :..:: :.: : ::: mKIAA0 VQEMRQKHTQAVEELTEQLEQFKRAKANLDKSKQTLEKENADLAGELRVLGQAKQEVEHK 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA3 RKKLDAQVQELHAKVSEGDRLRVELAEKANKLQNELDNVSTLLEEAEKKGIKFAKDAAGL .:::..:.:.:..: :.:.: :.::..:..:::::...:. .:.::: :.::.:::.:.: mKIAA0 KKKLEVQLQDLQSKCSDGERARAELSDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGKAIKLAKDVASL 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA3 ESQLQDTQELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQEQQEEEEEARKNLEKQVLALQSQL :::::::::::::::::::.:...::::.:.::::.: .:: ::..:::..: .:. :: mKIAA0 GSQLQDTQELLQEETRQKLNVSTKLRQLEDERNSLQDQLDEEMEAKQNLERHVSTLNIQL 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA3 ADTKKKVDDDLGTIESLEEAKKKLLKDVEALSQRLEEKVLAYDKLEKTKNRLQQELDDLT .:.:::..: .::: .::.::.: :..:.:::. :::. :::::::::::::::::::. mKIAA0 SDSKKKLQDFASTIEVMEEGKKRLQKEMEGLSQQYEEKAAAYDKLEKTKNRLQQELDDLV 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA3 VDLDHQRQIVSNLEKKQKKFDQLLAEEKGISARYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALE ::::.:::.:::::::::::::::::::.::..::.:::::::::::::::::::::::: mKIAA0 VDLDNQRQLVSNLEKKQKKFDQLLAEEKNISSKYADERDRAEAEAREKETKALSLARALE 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mKIAA3 EALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSKRALEQQVEEMRTQLEELED ::::::::.:: ::.:.:.::::.::::::::::::::::::::: :.:::.:::::::: mKIAA0 EALEAKEELERTNKMLKAEMEDLVSSKDDVGKNVHELEKSKRALETQMEEMKTQLEELED 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1420 1430 1440 1450 1460 1470 mKIAA3 ELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLLLKQVRELEAELEDERKQRA ::::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::.: : .:..: :.:::::::::: mKIAA0 ELQATEDAKLRLEVNMQALKGQFERDLQARDEQNEEKRRQLQRQLHEYETELEDERKQRA 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1480 1490 1500 1510 1520 1530 mKIAA3 LAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQMKDYQRELEEARASRDEIFA ::.:.:::.: :::::: : ..: :.:.:.:::::::::::::.::::..:::::::::: mKIAA0 LAAAAKKKLEGDLKDLELQADSAIKGREEAIKQLRKLQAQMKDFQRELDDARASRDEIFA 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1540 1550 1560 1570 1580 1590 mKIAA3 QSKESEKKLKSLEAEILQLQEELASSERARRHAEQERDELADEIANSASGKSALLDEKRR :::.::: :::::...::::.::..::::..:. :..:::.:.:.: ::...: ::::: mKIAA0 TSKENEKKAKSLEADLMQLQEDLAAAERARKQADLEKEELAEELASSLSGRNTLQDEKRR 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1600 1610 1620 1630 1640 1650 mKIAA3 LEARIAQLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTLNTELAAERSAAQKSDNARQQLERQ ::::::::::::::::.::: ..:: ::.:::.. :..:::.:::.:::...:::::::: mKIAA0 LEARIAQLEEELEEEQGNMEAMSDRVRKATLQAEQLSNELATERSTAQKNESARQQLERQ 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1660 1670 1680 1690 1700 1710 mKIAA3 NKELKAKLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKERAAANKLVRRTEKKLKE ::::..::::.:::::.:.:.:..::::::.:::::.::::.:. ::.: ... .::::: mKIAA0 NKELRSKLQEVEGAVKAKLKSTVAALEAKIAQLEEQVEQEAREKQAATKSLKQKDKKLKE 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1720 1730 1740 1750 1760 1770 mKIAA3 IFMQVEDERRHADQYKEQMEKANARMKQLKRQLEEAEEEATRANASRRKLQRELDDATEA ...::::::. :.::::: ::.:...:::::::::::::. : ::.:::::::::.:::. mKIAA0 VLLQVEDERKMAEQYKEQAEKGNTKVKQLKRQLEEAEEESQRINANRRKLQRELDEATES 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1780 1790 1800 1810 1820 mKIAA3 NEGLSREVSTLKNRLRRGGPISFSSSR--SGRRQLHIEGASLELSDDDTESKTSDVNDTQ ::...:::..::..::::. :: :: .::: .. . . :... ... :: : :. mKIAA0 NEAMGREVNALKSKLRRGNEASFVPSRRAGGRRVIE----NTDGSEEEMDARDSDFNGTK 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1830 mKIAA3 PPQSE mKIAA0 ASE >>mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729 aa) initn: 6965 init1: 5226 opt: 7337 Z-score: 3187.8 bits: 603.0 E(): 2e-172 Smith-Waterman score: 7337; 64.525% identity (64.750% ungapped) in 1728 aa overlap (105-1832:1-1722) 80 90 100 110 120 130 mKIAA3 LLQANPILESFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAVRQAKD ::::..::::::::::::::::::.::::: mKIAA2 INFDIAGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKD 10 20 30 140 150 160 170 180 190 mKIAA3 ERTFHIFYQLLSGAGEHLKSDLLLEGFNNYRFLSNGYIPIPGQQDKDNFQETMEAMHIMG : .::::::::.::::.::.::::: ..::::.:: :::. .. ::::.:.....: mKIAA2 ECSFHIFYQLLGGAGEQLKADLLLEPCSHYRFLTNGPSSSPGQE-RELFQETLESLRVLG 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 mKIAA3 FSHEEILSMLKVVSSVLQFGNISFKKERNTDQASMPENTVAQKLCHLLGMNVMEFTRAIL . ::: .::..::.::::::: .:::::::::.::.::.:::::.:::..: .:.::.: mKIAA2 LLPEEITAMLRTVSAVLQFGNIVLKKERNTDQATMPDNTAAQKLCRLLGLGVTDFSRALL 90 100 110 120 130 140 260 270 280 290 300 310 mKIAA3 TPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAVEALAKATYERLFRWLVHRINKALDRTKRQGASFIGI :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: :.:.::::. ::::::.:: mKIAA2 TPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFALEALAKATYERLFRWLVLRLNRALDRSPRQGASFLGI 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 mKIAA3 LDIAGFEIFELNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQP :::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :.:.:::::::: mKIAA2 LDIAGFEIFQLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFVLEQEEYQREGIPWTFLDFGLDLQP 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 mKIAA3 CIDLIERPANPPGVLALLDEECWFPKATDKTFVEKLVQEQGSHSKFQKPRQLKDKADFCI :::::::::::::.::::::::::::::::.::::..:::::: :::.::.:.:.::: . mKIAA2 CIDLIERPANPPGLLALLDEECWFPKATDKSFVEKVAQEQGSHPKFQRPRNLRDQADFSV 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 mKIAA3 IHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNVATLLHQSSDRFVAELWKDVDRIVGLDQVTGMTET .::::::::::.:::::::::::::::.:::::.::..::.::::. ::::.::... . mKIAA2 LHYAGKVDYKASEWLMKNMDPLNDNVAALLHQSTDRLTAEIWKDVEGIVGLEQVSSLGDG 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 mKIAA3 AFGSAYKTKKGMFRTVGQLYKESLTKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKRAGKLDPHLVLD :. . ..::::::::::::::..::::: ::::.:::::.::::::::::.:.:::: mKIAA2 PPGG--RPRRGMFRTVGQLYKESLSRLMATLSNTNPSFVRCIVPNHEKRAGKLEPRLVLD 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 mKIAA3 QLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACERMIRALELD ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::.::::: mKIAA2 QLRCNGVLEGIRICRQGFPNRILFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACEKMIQALELD 450 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 mKIAA3 PNLYRIGQSKIFFRAGVLAHLEEERDLKITDIIIFFQAVCRGYLARKAFAKKQQQLSALK :::::.:::::::::::::.::::::::.::::. :::. ::::::.:: ..::: :::. mKIAA2 PNLYRVGQSKIFFRAGVLAQLEEERDLKVTDIIVSFQAAARGYLARRAFQRRQQQQSALR 510 520 530 540 550 560 680 690 700 710 720 730 mKIAA3 VLQRNCAAYLKLRHWQWWRVFTKVKPLLQVTRQEEELQAKDEELLKVKEKQTKVEGELEE :.:::::::::::.:::::.: :::::::::::.: :::. .:: ::.: : . :. : mKIAA2 VMQRNCAAYLKLRNWQWWRLFIKVKPLLQVTRQDEVLQARAQELQKVQELQQQSAREVGE 570 580 590 600 610 620 740 750 760 770 780 790 mKIAA3 MERKHQQLLEEKNILAEQLQAETELFAEAEEMRARLAAKKQELEEILHDLESRVEEEEER .. . :: ::.. :::::.::.:: .:::: ::::::.::::: .. .::.:: :::: mKIAA2 LQGRVAQLEEERTRLAEQLRAEAELCSEAEETRARLAARKQELELVVTELEARVGEEEEC 630 640 650 660 670 680 800 810 820 830 840 850 mKIAA3 NQILQNEKKKMQAHIQDLEEQLDEEEGARQKLQLEKVTAEAKIKKMEEEVLLLEDQNSKF .. ::.:::..: :::.:: .:. ::::::::::::::.:::.::.::..:::::::::. mKIAA2 SRQLQSEKKRLQQHIQELESHLEAEEGARQKLQLEKVTTEAKMKKFEEDLLLLEDQNSKL 690 700 710 720 730 740 860 870 880 890 900 910 mKIAA3 IKEKKLMEDRIAECSSQLAEEEEKAKNLAKIRNKQEVMISDLEERLKKEEKTRQELEKAK ::..:.:.:.:: ::: ::::::.:.: :.: : :. :::.:.::::::: :::::: : mKIAA2 SKERRLLEERLAEFSSQAAEEEEKVKSLNKLRLKYEATISDMEDRLKKEEKGRQELEKLK 750 760 770 780 790 800 920 930 940 950 960 970 mKIAA3 RKLDGETTDLQDQIAELQAQVDELKVQLTKKEEELQGALARGDDETLHKNNALKVARELQ :.::::...::.:..: . ...:: .:: .::.:::.:: :...: . . :: :: : mKIAA2 RRLDGESSELQEQMVEQKQRAEELLAQLGRKEDELQAALLRAEEEGGARAQLLKSLREAQ 810 820 830 840 850 860 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA3 AQIAELQEDFESEKASRNKAEKQKRDLSEELEALKTELEDTLDTTAAQQELRTKREQEVA : .:: :::.:.:...: :::::.:::.::::::. :::::::.: ::::::.::::::. mKIAA2 AGLAEAQEDLEAERVARAKAEKQRRDLGEELEALRGELEDTLDSTNAQQELRSKREQEVT 870 880 890 900 910 920 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA3 ELKKALEDETKNHEAQIQDMRQRHATALEELSEQLEQAKRFKANLEKNKQGLETDNKELA :::::::.:.. ::...:..::::. :: :..::::::.: :. ::.. .::.. .:: mKIAA2 ELKKALEEESRAHEVSMQELRQRHSQALVEMAEQLEQARRGKGVWEKTRLSLEAEVSELK 930 940 950 960 970 980 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA3 CEVKVLQQVKAESEHKRKKLDAQVQELHAKVSEGDRLRVELAEKANKLQNELDNVSTLLE :.. :: . :.:.::..:..:.::.... :...: : : ::: .. : ::..::: : mKIAA2 AELSSLQTSRQEGEQKRRRLESQLQEVQGRSSDSERARSEAAEKLQRAQAELESVSTALS 990 1000 1010 1020 1030 1040 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA3 EAEKKGIKFAKDAAGLESQLQDTQELLQEETRQKLNLSSRIRQLEEEKNSLQEQQEEEEE :::.:.:...:. .. ::::.::::::::::: :: :.::.: :: : .:.::.::: mKIAA2 EAESKAIRLGKELSSAESQLHDTQELLQEETRAKLALGSRVRALEAEAAGLREQMEEEVV 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1220 1230 1240 1250 1260 1270 mKIAA3 ARKNLEKQVLALQSQLADTKKKVDDDLGTIESLEEAKKKLLKDVEALSQRLEEKVLAYDK ::. ... . :.::.. ... ... ...:. :::... ...:.:.::: ::. : .. mKIAA2 ARERAGRELQSTQAQLSEWRRRQEEEAAVLEAGEEARRRAAREAETLTQRLAEKTEAVER 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1280 1290 1300 1310 1320 1330 mKIAA3 LEKTKNRLQQELDDLTVDLDHQRQIVSNLEKKQKKFDQLLAEEKGISARYAEERDRAEAE ::... :::::::: :::: .:.:..:.:::::.::::::::::. : .:.:.: ::: mKIAA2 LERARRRLQQELDDATVDLGQQKQLLSTLEKKQRKFDQLLAEEKAAVLRAVEDRERIEAE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1340 1350 1360 1370 1380 1390 mKIAA3 AREKETKALSLARALEEALEAKEEFERQNKQLRADMEDLMSSKDDVGKNVHELEKSKRAL .::.:..::::.::::: ::.::.::::. :::..: :.::::::::::::::....: mKIAA2 GREREARALSLTRALEEEQEAREELERQNRALRAELEALLSSKDDVGKNVHELERARKAA 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1400 1410 1420 1430 1440 1450 mKIAA3 EQQVEEMRTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNMQAMKAQFERDLQTRDEQNEEKKRLLLKQ :: . ..:::. :::::: :.:::::::::..::.::: ::::: ::. .::..: : :: mKIAA2 EQAASDLRTQVTELEDELTAAEDAKLRLEVTVQALKAQHERDLQGRDDAGEERRRQLAKQ 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1460 1470 1480 1490 1500 1510 mKIAA3 VRELEAELEDERKQRALAVASKKKMEIDLKDLEAQIEAANKARDEVIKQLRKLQAQMKDY .:. :.: ..::::::::.:..::.:..:..:.:: ::.....:..:::.:.:.:::. mKIAA2 LRDAEVERDEERKQRALAMAARKKLELELEELKAQTSAAGQGKEEAVKQLKKMQVQMKEL 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1520 1530 1540 1550 1560 1570 mKIAA3 QRELEEARASRDEIFAQSKESEKKLKSLEAEILQLQEELASSERARRHAEQERDELADEI ::.::.:.::::.:. :.:.:::::.::::.:.::::::.:.::::.:.:.:::.:.:. mKIAA2 WREVEETRSSRDEMFTLSRENEKKLKGLEAEVLRLQEELAASDRARRQAQQDRDEMAEEV 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1580 1590 1600 1610 1620 1630 mKIAA3 ANSASGKSALLDEKRRLEARIAQLEEELEEEQSNMELLNDRFRKTTLQVDTLNTELAAER :.. .:.: :.:::.::.:..::::::::::.: :::.:..:: .:::..:.:::.::: mKIAA2 ASGNLSKAATLEEKRQLEGRLSQLEEELEEEQNNSELLKDHYRKLVLQVESLTTELSAER 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1640 1650 1660 1670 1680 1690 mKIAA3 SAAQKSDNARQQLERQNKELKAKLQELEGAVKSKFKATISALEAKIGQLEEQLEQEAKER : . :....::::::: .::.:.: : ....... : :.:::.:..: :::::::..:: mKIAA2 SFSAKAESGRQQLERQIQELRARLGEEDAGARARQKMLIAALESKLAQAEEQLEQESRER 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1700 1710 1720 1730 1740 1750 mKIAA3 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