FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA3014.ptfa, 1304 aa vs ./tmplib.26680 library 1767713 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9544+/-0.00748; mu= 1.7764+/- 0.500 mean_var=283.1024+/-67.901, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0762 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1004 ( 709 res) mtj02443 ( 709) 1357 163 1.5e-40 mKIAA1111 ( 1005 res) mbg06704 (1005) 644 85 7.5e-17 mKIAA0662 ( 1038 res) mth02305 (1038) 598 80 2.5e-15 >>mKIAA1004 ( 709 res) mtj02443 (709 aa) initn: 2169 init1: 803 opt: 1357 Z-score: 820.5 bits: 163.2 E(): 1.5e-40 Smith-Waterman score: 2084; 43.802% identity (53.768% ungapped) in 847 aa overlap (477-1304:1-709) 450 460 470 480 490 500 mKIAA3 ESVKSTSMPMDDPKTPTGSPATEVSTKWTHLTEFELKGLKALVEKLESLPENKKCVPEGI ::.:::.::. ::.:::::: .::::: :: mKIAA1 LTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPTGI 10 20 30 510 520 530 540 550 mKIAA3 EDPQALLEGVKNVLKEHVDDDPTLAITGVPVVSWPKKTAKNRVVGRPKGK---------- :: .::. :: .:.: ...:: ::.::::.:.:::. : . ::: . mKIAA1 EDEDALIADVKILLEELASSDPKLALTGVPIVQWPKRD-KLKFPTRPKVRVPTIPITKPH 40 50 60 70 80 560 570 580 590 600 610 mKIAA3 -LGPA---SAVK-LAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMK . :: . :. ::. ..::::::.:::::.::.. ::: ::.:.:::::::::::: mKIAA1 TMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMK 90 100 110 120 130 140 620 630 640 650 660 670 mKIAA3 QSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCLKIK :::..:::.:: :::...: .:::. ... ... : : :::: :::::.:::::.. mKIAA1 QSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKK----LMECCICNEIVHPGCLQM- 150 160 170 180 190 200 680 690 700 710 720 730 mKIAA3 ESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGK-QKRGPGFKYASNLPGSLLKEQKMNRDNKEGQE ..::..:.::::::::::: . .. : ::: : .. ... ... mKIAA1 DGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSDKAQKR---------------KIEESDEEAVQAKV 210 220 230 240 740 750 760 770 780 790 mKIAA3 PAKRRSECEEAPRRRSDEHPKKVPADGILRRKSDDVHLRRKRKYEKPQELSGRKRASSLQ :: ::: : : . :.. .:. : : .:. . : mKIAA1 LRPLRS-CEE-PLT----PPPHSPTS-MLQLIHDPV---------SPRGMVTR------- 250 260 270 280 800 810 820 830 840 850 mKIAA3 TSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNAEDRLSLA .:::.. : : : .:. : :::. ::. . mKIAA1 SSPGAG------PSDHHSAS------------------RDERF--KRRQLL----RLQAT 290 300 310 860 870 880 890 900 910 mKIAA3 NKPLRRFKQEPEDDLPEAPPKTRESDQSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRKRRLV .. . : :.. .:: : . : .:.:.: mKIAA1 ERTMVREKEN-------------------------NPS--GKKELSEVEKAKIR------ 320 330 340 920 930 940 950 960 mKIAA3 NKELSKELSKELNHEIQKTESTLAHESQQPIKSEPESENDEPKRPLSHC--ERP-HRFSK .. :. :.. .. ..: . : : . . .:. ..:: . : : . mKIAA1 ----GSYLTVTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRPNPRVLMQHCPARNPQHGDEE 350 360 370 380 390 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA3 GLNGTPRELRHSLGPGLRSPPRVMSRPPPSASPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDD ::.: .: .. . :: ... . : .: mKIAA1 GLGGEEEEEEEE-------------EEDDSAEEGGAARLNGR-----------GSWA-QD 400 410 420 430 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA3 GAAHVMHREVWMAVFSYLSHRDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNRCKSITPLMLS : :.:::::.:: :::...:: :::::.:: .:::::::::.:::.:::.:.: :: mKIAA1 GDESWMQREVWMSVFRYLSRKELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALS 440 450 460 470 480 490 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA3 GIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLD :::.::::::::::::::::::.::.::::::.::.:.:::: ::::: .:::::::::: mKIAA1 GIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSCPLLRTLD 500 510 520 530 540 550 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA3 VQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDVSLRLIIRHMPL ..:. :.:: :.::::.:::: .::: ::::::::....:::::::::..:::::::::: mKIAA1 LRWAVGIKDPQIRDLLTPPTD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFRLAGLDITDATLRLIIRHMPL 560 570 580 590 600 610 1210 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA3 LSKLQLSYCNHINDQSINLLTAVGTTTRDSLTEVNLSDCNKVTDLCLSFFKRCGNICHID ::.:.::.:.:..::: :::::::..:: ::::.:.. :::.:: : :..: .:. :: mKIAA1 LSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCNKLTDQTLFFLRRIANVTLID 620 630 640 650 660 670 1270 1280 1290 1300 mKIAA3 LRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS :: :::.:...::.::...:.. . .:::.::.: mKIAA1 LRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS 680 690 700 >>mKIAA1111 ( 1005 res) mbg06704 (1005 aa) initn: 1030 init1: 644 opt: 644 Z-score: 394.9 bits: 85.0 E(): 7.5e-17 Smith-Waterman score: 972; 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