FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0184.ptfa, 1483 aa vs ./tmplib.26680 library 1767534 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0376+/- 0.005; mu= 12.7713+/- 0.334 mean_var=131.6450+/-31.253, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1118 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0934 ( 1179 res) mfj03019 (1179) 6692 1092 0 mKIAA1463 ( 961 res) mbg00760 ( 961) 5207 852 0 >>mKIAA0934 ( 1179 res) mfj03019 (1179 aa) initn: 6692 init1: 6692 opt: 6692 Z-score: 5834.1 bits: 1091.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 6692; 81.223% identity (81.223% ungapped) in 1177 aa overlap (307-1483:3-1179) 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 LTYGKLWSRSLKLAYTLLNKLTSKNEPLLNPGDRVALVFPNSDPVMFMVAFYGCLLAELV :::::::::::.::. ::::::::::::.: mKIAA0 VRPGDRVALVFPNNDPAAFMVAFYGCLLAEVV 10 20 30 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 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:::::::::::.:..:.:::.:::::::::::::::::::::::: mKIAA1 DDIVATGLAVESIKTVYRGRIAVFSVSVFYDERIVVVAEQRPDASEEDSFQWMSRVLQAI 220 230 240 250 260 270 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKAPLGGIHISETKQRFLEGTLHPCNVLMCPHTCVTNLPKP :::::::::::::::::::::.::::::::.::: ::::.:::::.:::::::::::::: mKIAA1 DSIHQVGVYCLALVPANTLPKTPLGGIHISQTKQLFLEGSLHPCNILMCPHTCVTNLPKP 280 290 300 310 320 330 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 RQKQPEVGPASMIVGNLVAGKRIAQASGRELAHLEDSDQARKFLFLADVLQWRAHTTPDH ::::: :::::..:::::::::::::.::.:...:..: .:: :::..:::::..:::: mKIAA1 RQKQPGVGPASVMVGNLVAGKRIAQAAGRDLGQIEENDLVRKHQFLAEILQWRAQATPDH 340 350 360 370 380 390 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 PLFLLLNAKGTVTSTATCIQLHKRAERVAAALMEKGRLDAGDHVALVYPPGVDLIAAFYG ::.:::::::.. ::.:.::::::::.:..: .::.:.:::.:.:.::::..::::::: mKIAA1 VLFMLLNAKGTTVCTASCLQLHKRAERIASVLGDKGHLNAGDNVVLLYPPGIELIAAFYG 400 410 420 430 440 450 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 CLYCGCVPVTVRPPHPQNLGTTLPTVKMIVEVSKSACVLSTQAITRLLKSKEAAAAVDVR ::: ::.:::::::: ::: .:::::.:.:.:::.::::.::.. :::::.::::::::. mKIAA1 CLYAGCIPVTVRPPHAQNLTATLPTVRMVVDVSKAACVLTTQTLMRLLKSREAAAAVDVK 460 470 480 490 500 510 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 TWPTILDTDDIPKKKVASIFRPPSPDVLAYLDFSVSTTGILAGVKMSHAATSALCRSIKL :::.:.::::.:.:.. ....::.:..::::::::::::.:.::::::.:..::::.::: mKIAA1 TWPAIIDTDDLPRKRLPQLYKPPTPEMLAYLDFSVSTTGMLTGVKMSHSAVNALCRAIKL 520 530 540 550 560 570 1100 1110 1120 1130 1140 1150 mKIAA0 QCELYPSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLVPPLELESNVSLWLSAVSQYKA ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.:. :::..:.::: mKIAA1 QCELYSSRQIAICLDPYCGLGFALWCLCSVYSGHQSVLIPPMELENNLFLWLATVNQYKI 580 590 600 610 620 630 1160 1170 1180 1190 1200 1210 mKIAA0 RVTFCSYSVMEMCTKGLGAQTGALRMKGVNLSCVRTCMVVAEERPRISLTQSFSKLFKDL : :::::::::.:::::: :. .:. .:.::::.:::.::::::::.:: :::::::::. mKIAA1 RDTFCSYSVMELCTKGLGNQVEVLKTRGINLSCIRTCVVVAEERPRVSLQQSFSKLFKDI 640 650 660 670 680 690 1220 1230 1240 1250 1260 1270 mKIAA0 GLPARAVSTTFGCRVNVAICLQGTTGPDPTTVYVDMRALRHDRVRLVERGSPHSLPLMES :: :::::::: 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