FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0289.ptfa, 1249 aa vs ./tmplib.26680 library 1767768 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7745+/-0.0044; mu= 12.9336+/- 0.293 mean_var=104.8415+/-23.680, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1253 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0634 ( 1485 res) mbg20639 (1485) 4386 804 0 >>mKIAA0634 ( 1485 res) mbg20639 (1485 aa) initn: 3775 init1: 868 opt: 4386 Z-score: 4279.7 bits: 804.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 4386; 50.922% identity (52.566% ungapped) in 1247 aa overlap (15-1247:262-1483) 10 20 30 40 mKIAA0 PFLRENDLSIMHSPSASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTEL .:.: .::. :::..::...: :::.:::: mKIAA0 AGAGAGTGAGAGAAAAAASAASPGSAGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAVQDDLDNTEL 240 250 260 270 280 290 50 60 70 80 90 100 mKIAA0 PYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEEL :.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: . : .::.. mKIAA0 PFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQEPSEIVEEQM 300 310 320 330 340 350 110 120 130 140 150 160 mKIAA0 RILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLI .:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:::::::::. mKIAA0 HILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHEIHYIPSVLL 360 370 380 390 400 170 180 190 200 210 220 mKIAA0 GGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGYEYDITDL----RHHLQRECMNGGEDFA : ..:::.:..:.: ::: . :::::::: :.:. . .:..:: ..:. mKIAA0 GPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDYEEEEEPPRRANHVSRE-----DEFG 410 420 430 440 450 460 230 240 250 260 270 mKIAA0 SQVTRTLDSL-QGCNEKSGMDLTPGSDNAKL---SLMNKYKDNIIATSPVDSNHQQATLL ::.:..:::: . .:: .. ... .. :::.:.:... :..::. .. : . mKIAA0 SQMTHALDSLGRPGEEKVEFEKKAAAEATQETVESLMQKFKESFRANTPVEIGQLQPASR 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 SHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSSTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGSPRSPV : ::...::: ::.:.: .: .: :..::... ::::::. ::::::. : .::: mKIAA0 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