FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0386.ptfa, 1135 aa vs ./tmplib.26680 library 1767882 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1022+/-0.00568; mu= 6.4444+/- 0.379 mean_var=158.0619+/-37.350, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1020 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1930 ( 1262 res) mbh03585 (1262) 1411 221 1.3e-57 >>mKIAA1930 ( 1262 res) mbh03585 (1262 aa) initn: 2065 init1: 889 opt: 1411 Z-score: 1126.8 bits: 220.5 E(): 1.3e-57 Smith-Waterman score: 1780; 34.165% identity (42.815% ungapped) in 1282 aa overlap (46-1115:9-1243) 20 30 40 50 60 70 mKIAA0 RALGPRLLPSDLSLLAGRNEHRCPRSRRCTAARGGAWVPRWYMPPGTKRLRALGAFSAGL :::.: .:: .: . .: mKIAA1 PAAATAAAAARAGRATPR--VPTARGPCSPAQPWS--- 10 20 30 80 90 100 110 120 130 mKIAA0 PTRLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENASALKKPQ--AK :.: .: .. . . ::::::: : .:: : . . . .:: .. mKIAA1 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