FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0973.ptfa, 1202 aa vs ./tmplib.26680 library 1767815 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0960+/-0.00905; mu= -22.5291+/- 0.595 mean_var=476.0715+/-116.856, 0's: 0 Z-trim: 35 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0588 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0807 ( 1432 res) mbg07407 (1432) 3448 308 8.3e-84 mKIAA0561 ( 415 res) mtk01891 ( 415) 913 92 1.7e-19 mKIAA4165 ( 674 res) mfj42151 ( 674) 464 54 7e-08 mKIAA0623 ( 1056 res) mbg01004 (1056) 387 48 9.1e-06 mKIAA0722 ( 1004 res) mbg09316 (1004) 368 46 2.7e-05 mKIAA4207 ( 780 res) mph00550 ( 780) 331 43 0.00019 mKIAA4230 ( 408 res) mbg00138 ( 408) 313 42 0.00034 mKIAA1477 ( 771 res) mfj36325 ( 771) 297 40 0.0014 mKIAA4088 ( 652 res) mph00951 ( 652) 283 39 0.0028 mKIAA0137 ( 570 res) mia05011 ( 570) 280 39 0.003 mKIAA0965 ( 159 res) mia06062 ( 159) 257 36 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:.:.:::::::::::::::::.:::.:::.::: mKIAA0 SSNPSSRDSSPSRDFLPALGSLRPPIIIHRAGKKYGFTLRAIRVYMGDTDVYTVHHMVWH 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 VEEGGPAQEAGLCAGDLITHVNGEPVHGMVHPEVVELILKSGNKVAVTTTPFENTSIRIG ::.::::.:::: ::::::::::::::.:: :::::.:::::::...:::.:::::..: mKIAA0 VEDGGPASEAGLRQGDLITHVNGEPVHGLVHTEVVELVLKSGNKVSISTTPLENTSIKVG 780 790 800 810 820 830 750 760 770 780 mKIAA0 PARRSSYKAKMARRNKRPSAKDGQE---RSGAL-----------------SFGRSQSS-- :::..:::::::::.:: ..::::: ::. . :..:: :: mKIAA0 PARKGSYKAKMARRSKRSKGKDGQESRKRSSLFRKITKQASLLHTSRSLSSLNRSLSSGE 840 850 860 870 880 890 790 800 810 mKIAA0 --------------RT---------------GASSQSSSPASSTPNSPASSASHHIRPST :. : :::::::.::.:.:::.:. : :::. mKIAA0 SGPGSPTHSHSLSPRSPPQGYRVAPDAVHSGGNSSQSSSPSSSVPSSPAGSG--HTRPSS 900 910 920 930 940 950 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 LHGLSPKLHRQYRSARCKSAGNIPLSPLAHTPSP--TQASPPPLPGHTVGSSHTTQSFPA ::::.:::.::::: : ::::.:::::::::::: : ::: :. : : .::::. mKIAA0 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:::. :: ...:.: ::...:: :::: : :: :: ::::: mKIAA0 HGLAAKLGPPRHKSGRRKSTSSIPPSPLACPPVPTPPPRSPSPLPGHI------------ 270 280 290 300 310 880 890 900 910 920 mKIAA0 KLHSSPPVVRPRPKSAEPPRSPLLKRVQSAEKLG--ASLGADKKGALRKHSLEVG----- :. : ::: :.: :::.::: .: : :. : .. :. mKIAA0 ------PI---------PARSPRLRRGQSADKLGLGTSERLDGDGGRRARGAEAELVVMR 320 330 340 350 360 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 --HPDFRKD-FHGELALHSLAESDGETPPIEGPGATRQVAVRRLGRQESPLSLGADPLLP : . :.: :. . :.. .. .. :: : ..::. : . .: . : mKIAA0 RLHLSERRDSFKKQEAVQEVSFDEEPGPPRGVP----KIAVQ--GAEATPGTPGHARKD 370 380 390 400 410 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 DGVQRPMASSKEDSAGGTEACTPPRATTPGSRTLERDSGCTRHQSVQTEDGPGGVARALA >>mKIAA4165 ( 674 res) mfj42151 (674 aa) initn: 630 init1: 313 opt: 464 Z-score: 233.9 bits: 54.5 E(): 7e-08 Smith-Waterman score: 667; 34.309% identity (38.053% ungapped) in 376 aa overlap (33-391:310-665) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 GLSSRTVTHTHLLVDVVRLEEQDSGGSNTPEQDDTSEGRSSTSKAKKPPGESDFDTIKLI :. .. . : : .::.. : .::: ...: mKIAA4 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..:. : mKIAA0 NRYGASVPIPVPTQVHNYQRIEQNLQSPTQQQTARSSAI-RRSGSTSPLGFGRASPSPPS 380 390 400 410 420 430 540 550 560 570 mKIAA0 ATERS-----------HPGDLGP--------PSKDGDPSGPRATNDLVLRRARHQQLSGD :. . .: .: :: . :: :.... : : : :. mKIAA0 HTDGAMLARKLSLGGGRPYTPSPQVGTIPERPSWSRVPS-PQGADVRVGRSPR----PGS 440 450 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 LAVEKRPSRTG-GKVIKSA-SATALSVMIPAVDPHGGSPLASPMSPRSLSS---NPSSRD . :. : :: : ..:: . . . :. : . .::.. .:: . :. :. .. mKIAA0 SVPEHSPRTTGLGCRLHSAPNLSDFHVVRPKLPKPPTDPLGATFSPPQTSAPQPCPGLQS 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 mKIAA0 SSPSRDYSPAVSGL--RSPI-----TIQRSGKKYGF-------TLRAIRVYMGDSDVYSV : : :: . . :::. . ..: .. : .: .. . .: . mKIAA0 CRPLRG-SPKLPDFLQRSPLPPILGSPTKAGPSFDFPKTPSSQNLLTLLARQGVVMTPPR 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 HHIVWHVEEGGPAQEAGLCAG-DLITHVNGEPVHGMVHPEVVELILKS--GNKVAV--TT .. . . :..: . : .: . : ... ....:.::. :.... .: mKIAA0 NRTLPDLSEASPFHGQQLGSGLRPAEDTRGPFGRSFSTSRITDLLLKAAFGTQASDSGST 610 620 630 640 650 660 740 750 760 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