FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0927.ptfa, 713 aa vs ./tmplib.26680 library 1768304 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0678+/-0.00398; mu= 13.7654+/- 0.267 mean_var=80.1659+/-18.351, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1432 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4158 ( 761 res) mfj68139 ( 761) 2224 470 4.8e-133 mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806) 973 212 6e-55 mKIAA1894 ( 2796 res) mbf00006 (2796) 850 186 3.7e-47 mKIAA1890 ( 875 res) mbg14487 ( 875) 231 58 5.1e-09 mKIAA4159 ( 511 res) mid27006 ( 511) 166 44 3.8e-05 mKIAA0247 ( 324 res) mpm12222 ( 324) 133 37 0.0031 >>mKIAA4158 ( 761 res) mfj68139 (761 aa) initn: 2570 init1: 1261 opt: 2224 Z-score: 2481.0 bits: 469.7 E(): 4.8e-133 Smith-Waterman score: 2404; 47.043% identity (52.006% ungapped) in 744 aa overlap (32-704:8-751) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 NELTGSASEESQETTTSTIVTTTIITTEQAPALCGVSFSDPEGYIDSSDFPPQPYSSFLE :. :. .:: ::: .:: : .: . :. mKIAA4 PHVSSCLPGPCSWNFSGPEGSLDSPTAPSSPSDVGLD 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 CTYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSEGELLSIRGVDGPTLTVLANQTLLVEGQVIRSPTNTI : : ..:: :::::..:....:.::: ....:. :: ::::..:..::::::::. mKIAA4 CFYYISVYPGYGVEIKVENISLQEGETITVEGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQA 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 SVYFRTFQ-DDGLGTFQLHYQAFMLSCPFPRRPDAGEVTVMDLHSGGVAHFHCHLGYELQ .. :... : :::...:::..::: ::::: :.::: .:: :: ::::: ::.:. mKIAA4 ALRFQSLPLPAGPGTFHFRYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSLHPGGSAHFHCATGYQLK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 GAKTLTCINASKPHWSSQEPVCSAPCGGAVHNATIGRVLSPSFPGTANGSQLCVWTIEAP ::. :::.::..: :.:::::: : :::...::: ::..::.:::. ... : : .::: mKIAA4 GARFLTCLNATQPFWDSQEPVCIAACGGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAP 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 mKIAA0 EGQKLHLHLERLLLHEKD-RMIVYSGRTNTSALLYDSLRTESVPFEGLLSEGSSIRIEFT :.:.::::.:.. : : : :.:. .: . . .::: ..: .:.::::: : . .::. mKIAA4 ESQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGNNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGRHFFVEFS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 SDQGQAASAFNIRFEAFEKGHCYEPYIQNGNFTTSDPTYNIGTIVEFTCDPGHSLEQGPA .:.. ::... .:.:::..::::::... :::..: :.: .:: :::.::::..:::: mKIAA4 TDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSAPSYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSI 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 VIECVNVRDPYWNDTEPLCRAMCGGELSAVAGVVLSPNWPEPYAEGEDCVWKIHVGEEKR .::::...:: ::.::: :::.:.::.. :::::::::::::..:.::.: .:: :.:: mKIAA4 IIECVDLHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKR 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 IFLDIQFLNLSNSDILTIYDGDEVVPHVLGQYFGHSSPQKLYSSTPDLTIQFHSDPAGLI :.:::. : ....:.::.::::... .::::: : . ::..: :.::::.:::. mKIAA4 IMLDIRVLRIGSGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRGHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 FGKGQGFIMNYIEVSRNDSCSDLPEIQNGWKTTSHTELVRGARITYQCDPGYDIVGSDTL .: :::.....:: :::.: .:::: ::::. :. :::.:. .:::: :::..:::. : mKIAA4 LGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKNPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSIL 460 470 480 490 500 510 540 550 560 mKIAA0 TCQWDLSWSSDPPFCEKT---------EES----------------LACD---------- :::::::: : : :... :.: .:: mKIAA4 MCQWDLSWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHSRRLISSPKFPVGATVQYVCDQGFVLTGSAI 520 530 540 550 560 570 570 580 590 mKIAA0 ---------NP------------------GL--PENGYQILYKRLYLPGESLTFMCYEGF .: :: :::: . :::. : .. : : :. mKIAA4 LTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQFKPCHGLSAPENGARSPEKRLHPAGATIHFSCAPGY 580 590 600 610 620 630 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 ELMGEVTIRCILGQPSHWSGPLPICKVNQ-DSFEH--ALE-AEA-AAESSLEGGNMALAI : :...:.:. :.::::: : :::.. . :.: . .:. :.: :: :.:.....: :: mKIAA4 VLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASLDGFYNGRSLDVAKAPAASSALDAAHLAAAI 640 650 660 670 680 690 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 FIPVLLISLLLGGAYIYVTRCRQYSSLRLPLMYSHPYSQITVETEFDNPIYETGETREYE :.:.. . ::.::.:.: .: . : :.:: . .::..::::. :::: :::: mKIAA4 FLPLVAMVLLVGGVYLYFSRFQGKSPLQLPRTHPRPYNRITVESAFDNPTYETGSLSFAG 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VSI mKIAA4 DERI 760 >>mKIAA1884 ( 1806 res) mib34059 (1806 aa) initn: 621 init1: 244 opt: 973 Z-score: 1078.9 bits: 211.5 E(): 6e-55 Smith-Waterman score: 973; 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