FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA0619.ptfa, 777 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768240 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2162+/-0.00794; mu= -3.9406+/- 0.523
 mean_var=452.1085+/-108.140, 0's: 0 Z-trim: 30  B-trim: 0 in 0/36
 Lambda= 0.0603

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
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>>mKIAA0866  ( 1984 res)   mtg01789                       (1984 aa)
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Smith-Waterman score: 395;  21.942% identity (24.746% ungapped) in 556 aa overlap (9-513:850-1393)

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        .  : .::  .   ...  ::  :::.:   :.:  :  .:.. .. . . ... :.. 
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       ::. .  .    :...  .. ..  .. : ..:..: ::.. .::..   . :: . . :
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       . :.   ... ..: :.. .:.: : .:: .. .: .:    .:  :..... . ..  :
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        ..:.:..   .: ..: .:: . ......  : ..:. ::. ::               
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        :  :  ..: : .     . .:.:. . .    .. ...:.:: .: ..: ..:: :: 
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       .. ..:  :.  :.. . :.:    :   .: ...::  .: :   ::::.      . :
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       .:.....:: .. :.::.:       :.:...: :  . ::. :...  ..   .:.   
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         :.... : :  :.... ..:. :   .: ..:. ..  . .....: .:   .. ...
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        .. . . : : .: :. :: . . .:.  ... . .. . ...::              
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Smith-Waterman score: 411;  23.386% identity (25.283% ungapped) in 573 aa overlap (2-541:285-847)

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        .:  :. :::.:.  ..   :..:::   . ::  ::...  :: :.. .:   .. ::
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       .. ::  :.  .  .:.:   .... : :::  ..:..: .:.. .:..:.   . :   
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       . :. .. . : .. ::  :    .:...    ..:.:. .. .  . ..    :.. :.
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        .  ::.: . : .. .. .. :.. ....::   :::. :    ... :.:..   .:.
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       :. : ..  :.. . :. .. :    ..  :. .:.:. .:..  ..: ...  :.: :.
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       . .... .: .   .: . :: . ... .:... . .   .   .  :.    : : .  
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       :.:                                                         
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Smith-Waterman score: 333;  22.257% identity (25.357% ungapped) in 638 aa overlap (2-590:419-1027)

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       :. .:   :    : :. .. .. :    : . :.::      :  :  :.::.. :. .
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          :..  :.: ......: .. :: .. .::.         :  ::.:: . ..:..::
mKIAA1 ATKQELLQLRMEKEEMEEELGEKMEVLQRDLEQARASTRDTHQVEELKKELRRTQGELKE
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mKIAA0 LQDQLEAEQYFSTLYKTQVRE-----LKEE-------NEEKTKLCKELQQKKQDLQDE-R
       :: . . .:  .  ...:: :     :.::       .... .: : ::: .:: ..  .
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mKIAA0 DSLAAQLEITLT---KADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMK-ELEIKE----------MM
        ..:.. :  .    .:  :   :   ::  .:  ...:.  : ..::          . 
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       :: .... . ..   .:::.  .   . .:::  :. :. .: ..:. :..: .:..   
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       :..  .:..  ....:. .     ::. ..:. ..:  :    : .:: ...  . :   
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       ..:  ::  :...    . ..:. ..   .     ..... . .:...:: :. ....:.
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              :. :  .  .::.: :   ..:. :.:   :   . :  .:.   ..: :.:.
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       ..  .. :                                                    
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       .  .::..:. :.::... ::   :.: .::.:.:.:  :. :  .  .: :   . .. 
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       . ::: :: :  :: : :..: .:.    ... .. :..:. ..: . . .: ..:.   
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       .  :.  . :.                ::.. .. :.    ..:... :. :. :   . 
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         ....:.:.::..   .  .: .. ...:. .  .: .::  :  :.:..  .    ::
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             :.:..:..:        .:.: ::  .  .::.:.  : ... .:.   .....
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       . ..:. .:.....:  :: . .:  :. . .   : :  .:.:..    : : .. :: 
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        .: .     : .  .  :.  ....: ::.. .. : ::. ... .:.:..   : .:.
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       ...:.:..:                                                   
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 initn: 193 init1:  75 opt: 291  Z-score: 158.3  bits: 40.6 E(): 0.0011
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                                     ..::  .. .. .: ..:.  . :  ..  
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mKIAA0 LQGRISGLEEDLKTGKALLAKVELEKRQLQEKLTDLEKEKSN-MEIDMTYQLKVIQQS--
        .  . .::   ::.. :.:.....   ::.   .:::. .. ::   :   .:.. :  
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          : :: .:      ::   :... :. ..  .:: ::....: : :.:..:. .:  :
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         ..  .  .   .:.:. . .: .:  .. .....  .:.:.       :::.:     
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        :. :..  . .: . .      .  . :::. ..::.     :: . .. ... :....
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         : ::.: . ::    .: ::: ::..:.   :.. :.:   :::. ...: ..  .. 
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mKIAA0 QKTEMTSLRIVSEQLQRSLDDCQHRLS-IKRGELESAQEQIKMLEQKLENLSHRMTVQSE
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       . .  .. :  ..:: . .:  . :...   .:: .: ::.. : ::.            
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>>mKIAA1561  ( 1106 res)   mej02373                       (1106 aa)
 initn: 223 init1: 114 opt: 288  Z-score: 156.9  bits: 40.3 E(): 0.0013
Smith-Waterman score: 332;  23.783% identity (26.458% ungapped) in 534 aa overlap (39-527:512-1036)

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mKIAA1 LLAENDKLTKNVSRLEAVFVAPEKHEKELMGLKSNIAELKKQLSELNKKCGEGQEKIRAL
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mKIAA0 EKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQEEAE-----HKTTKARLADKNKIYESIEE-AKSEAM
        .:.:...  .. :  :  .. :. .:      .::..: :  :... .. .: .: .  
mKIAA1 MSENSSLKKTLSSQY-VPAKTHEEVKASLNSTVEKTNRALLEAKKRFDDTSQEVSKLRDE
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mKIAA0 KEMEKKLLEERSLKQKVENLLLEAE-KRCSILDCDLKQSQQKLNELLKQKDVLNEDVRNL
       .:. .. ::. . ..:.. . :: . .: : .. .::..:.    .: ..   .:.. .:
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mKIAA0 TLKIEQETQKRCLMQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQIKQE----NNHLMEMKMNLEKQNTEL
         .:. . ..   .:. .:..   .  :.  :...:      ...: :.  . .... :.
mKIAA1 HAEIKAQKKELDTIQECIKLKYAPLARLEECERKFKATEKGLKEQLSEQTHKCRQRDEEV
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mKIAA0 RKERQDAD---GQMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVRELKEENEEKTKLCKELQQKKQDLQ
       .: .:. .   ...  :: .:. .. ..   .   : :. . .: .:  :.:.:: .:..
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mKIAA0 DERDSLAAQLEITLTKADSEQLA-RSIAEEQYSDLEK-EKIMKEL-----EIKEMMARHK
       .::..:. .     .:  :: :: ... ..:   ::. : . : :     ..:: . : :
mKIAA1 SEREKLVEEK----AKQASEILAAQNLLQKQPVPLEQVEALKKSLNGTIEQLKEEL-RSK
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mKIAA0 QELTEKDT-TIASLE---ETNRTLTSDVANLANEKEELNNK---LKDS---QEQLSKLKD
       :.  :..  :...:.   :.... .  .:.  . :: :...   .: :   .:. :. : 
mKIAA1 QRCLEREQQTVSQLQQLLENQKNSSVTLAEHLKLKEALEKEVGIMKASLREKEEESQKKT
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mKIAA0 EEMSAAAIKAQFEKQLLNERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRG----SD--TDVRRKEKE
       .:.:    ..:  :: :  ..:.:. :  ...    :. ..      .:  ... ::  .
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mKIAA0 NRKLHMELKSEREKL---TQQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRI-ELQMTLDSKDSDIEQ
         . ..  :.:.: :    .: :. :::  . .     : : :: :    ...::. : .
mKIAA1 ACEEKVSAKDEKELLHLSIEQEIRDQKERCDKSLTTIMELQQRIQESAKQIEAKDNKITE
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mKIAA0 LRSQL----QALHIGMDSSSIGSGPGDAEPDDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKY
       : ...    :::. :... . .::                                    
mKIAA1 LLNDVERLKQALN-GLSQLTYSSGSPTKRQSQLVDTLQQRVRDLQQQLADADRQHQEVIA
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 initn: 190 init1: 108 opt: 267  Z-score: 146.8  bits: 38.5 E(): 0.0049
Smith-Waterman score: 342;  22.570% identity (25.465% ungapped) in 607 aa overlap (3-584:335-897)

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mKIAA0                             AKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIIND
                                     .: :...  ::.  :. .. . .  ::...
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mKIAA0 LQGRISGLEEDLKTGKALLAKVELEKRQLQEKLTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQS---
       ..  ... . :..        .. .:..: :.: .:... .  . .  ..:.:...:   
mFLJ00 INKVVAAKDADFQC-------LNEKKEKLTEELQSLQRDIKAAQHSEDHHLQVLRESETL
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mKIAA0 LEQEEAEHKTTKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERSLKQKVENL-----LL
       :. ..:: .: :........    ..   ::  .. :. :: . :: :   .:     : 
mFLJ00 LQAKRAELETLKSQVTSQQQELAVLD---SELGHRREELLLLQDSLAQAKADLQEALTLG
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mKIAA0 EAE--KRCSILDCDLKQSQQKLNELLKQKDVLN----EDVRNLTLKIEQETQKRCLMQND
       :.:  ..::     ... .. :.::  ::  ::    :   .:.: :.:: .:.   ...
mFLJ00 ETEVAEKCS----HIREVKSLLEELSFQKGELNVHISEKKTQLAL-IQQEMEKE---EKN
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mKIAA0 LKMQTQQVNTLKMSEKQI----KQENNHLMEMKMNLEKQNTELRKERQDADGQMKELQDQ
       :..  ::..  :   :..    . :...:. .:.. ... .::.: . :.  .  ::.. 
mFLJ00 LQVVLQQLSRHKTELKNVADILQLETSELQGLKLQHDQKVVELEKAQVDVLEEKLELENL
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mKIAA0 LEAEQYFSTLYKTQVRELKEENEEKTKLCKELQQKKQD----LQDERDSLAAQLEITLTK
        .: :      . : :.: :.....:.  .  .:  :.    :. :...: .: :    :
mFLJ00 QQATQQQRRELERQ-RQLLERDRRETERVRAESQALQSCVECLSKEKEDLQGQCESWEKK
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mKIAA0 ADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMK-ELEIKEMMARHKQELTEKDTTIASLEETNRTLTS
       ..  : . . .::. . .:. .. : :: ....  . .:   .: .  . . :... : .
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mKIAA0 DVANLANEKEELNNKLKDSQEQLSKLKDEEMSAAAIKAQFEKQLLNERTLKTQAVNKLAE
           . . .:::..    .:..:.  :.. . ..  : : :  ::::.:   . ..:   
mFLJ00 KQEAINSLQEELDS----TQDHLDLAKQDLIHTT--KCQNE--LLNEQTQLQEDISKW--
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mKIAA0 IMNRKEPVKRGSDTDVRRKEKENRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQK--ELNEMQAQIAEE
        : : :  .. ..:    ::.. ..:. :..  . .: :: . .::  .  : . :  : 
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       ... .: :.    :.  . . .:.:. :   ....    :  . :      : :.:: : 
mFLJ00 GKVTLEQQQRQLEKE--LTDQKSRLKQLLTDVSAAEGRLGTLQEE------ERRIEG-LE
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mKIAA0 LPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYMVLDIDKLFHVRPVTQTDVYR
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>>mKIAA0336  ( 1693 res)   mbg01823                       (1693 aa)
 initn: 139 init1: 100 opt: 263  Z-score: 143.3  bits: 38.4 E(): 0.0077
Smith-Waterman score: 327;  22.202% identity (24.551% ungapped) in 554 aa overlap (2-515:735-1275)

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mKIAA0                              AKLKLE-KEFINLQSALESERRDRTH-GSEI
                                     ::.:  .:  .:.. ::.:. ...   ...
mKIAA0 SEKAQLSRDLEALQAQQDFAHKEHVAEFEKKLQLMVEERDDLNKLLENEQVQKSFVKTQL
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mKIAA0 INDL-QGRISGLEED-----LKTGKAL---LAKVELEKRQL----QEKLTDLEKEKSNME
        . : : : : :::.     .:  .:.   :.::. :...:    . .. .::.. . ..
mKIAA0 YEYLKQLRASILEENEEEDVVKLIQAVGESLVKVKEEEHNLVFEYDARVLELENKIKCLQ
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mKIAA0 IDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKTTKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERSLK
        : . : . ..  ... : :.   . .:   ..  :...    :  .  ::  ::...:.
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       ...:..  .  . ..  ::. :...... ..:.   : . :: ..:..:.   .::.   
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          :.: :         :.: : :  :  : ..:  :.:.  .. .....  ..:..   
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       ..: . :    :.  : ....  ... ..  ....    ..   :.: :.   :. : ..
mKIAA0 MKELNQKLTNKNSTIEDLEQEMKIQKEKQETLQEEITSLQSSVQHYEEKNT--KIKQLLV
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