FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0619.ptfa, 777 aa vs ./tmplib.26680 library 1768240 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2162+/-0.00794; mu= -3.9406+/- 0.523 mean_var=452.1085+/-108.140, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0603 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 338 45 9.1e-05 mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 318 43 0.00025 mKIAA1319 ( 1240 res) mic06048 (1240) 314 43 0.0003 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 315 43 0.00035 mKIAA0635 ( 1125 res) mia28019 (1125) 291 41 0.0011 mKIAA1561 ( 1106 res) mej02373 (1106) 288 40 0.0013 mFLJ00150 ( 1174 res) mfj11357 (1174) 267 39 0.0049 mKIAA0336 ( 1693 res) mbg01823 (1693) 263 38 0.0077 >>mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984 aa) initn: 306 init1: 191 opt: 338 Z-score: 177.9 bits: 45.1 E(): 9.1e-05 Smith-Waterman score: 395; 21.942% identity (24.746% ungapped) in 556 aa overlap (9-513:850-1393) 10 20 30 mKIAA0 AKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGS--EIINDLQGR : ... :. :... . : .. .. : mKIAA0 KRQQQLTAMKVIQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVTRQEEEMQAKEEEMQKIKER 820 830 840 850 860 870 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 ISGLEEDLKTGKALLAKVELEKRQLQEKL---TDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSLEQE . : .:: . ... :: :::.: :.: : .:.. .. . . ... :.. mKIAA0 QQKAETELKELEQKHTQLAEEKTLLQEQLQAETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHEM 880 890 900 910 920 930 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 EAEHKTTKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKEMEKKLLEERSLKQKVENLLLEAEKRCSIL ::. . . :... .. .. .. : ..:..: ::.. .::.. . :: . . : mKIAA0 EARLEEEE----DRGQQLQAERKKMAQQMLDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVTAEAKIKKL 940 950 960 970 980 990 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 DCDLKQSQQKLNELLKQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLMQNDLKMQTQQVNTLKMSE . :. ... ..: :.. .:.: : .:: .. .: .: .: :..... . .. : mKIAA0 EDDILVMDDQNSKLSKERKLLEERVSDLTTNLAEEEEK---AKNLTKLKSKHESMISELE 1000 1010 1020 1030 1040 1050 220 230 240 250 mKIAA0 KQIKQENN---HLMEMKMNLEKQNTELRKERQDADGQMKELQDQL--------------- ..:.:.. .: ..: .:: . ...... : ..:. ::. :: mKIAA0 VRLKKEEKSRQELEKLKRKLEGDASDFHEQIADLQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARLD 1060 1070 1080 1090 1100 1110 260 270 280 290 300 mKIAA0 -EAEQYFSTLYKTQ-----VRELKEENEEKTKLCKELQQKKQDLQDERDSLAAQLEITLT : : ..: : . . .:.:. . . .. ...:.:: .: ..: ..:: :: mKIAA0 EEIAQKNNALKKIRELEGHISDLQEDLDSERAARNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 310 320 330 340 350 mKIAA0 KADSEQLARSIAEEQYSDLEK----EKIMKELEIKEMMARHKQ---ELTEK----DTTIA .. ..: :. :.. . :.: : .: ...:: .: : ::::. . : mKIAA0 STATQQELRAKREQEVTVLKKALDEETRSHEAQVQEMRQKHTQAVEELTEQLEQFKRAKA 1180 1190 1200 1210 1220 1230 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 SLEETNRTLTSDVANLANE-------KEELNNKLKDSQEQLSKLKDEEMSAAAIKAQFEK .:.....:: .. :.::.: :.:...: : . ::. :... .. .:. mKIAA0 NLDKSKQTLEKENADLAGELRVLGQAKQEVEHKKKKLEVQLQDLQSKCSDGERARAE--- 1240 1250 1260 1270 1280 420 430 440 450 460 mKIAA0 QLLNERTLKTQA-VNKLAEIMNRKE--PVKRGSDT-DVRRKEKENRKLHMELKSEREKLT :.... : : :.... ..:. : .: ..:. .. . .....: .: .. ... mKIAA0 --LSDKVHKLQNEVESVTGMLNEAEGKAIKLAKDVASLGSQLQDTQELLQEETRQKLNVS 1290 1300 1310 1320 1330 1340 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 QQMIKYQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRSQLQALHIGMDSSSIGSG .. . . : : .: :. :: . . .:. ... . .. . ...:: mKIAA0 TKLRQLEDERNSLQDQLDEEMEAKQNLERHVSTLNIQLSDSKKKLQDFASTIEVMEEGKK 1350 1360 1370 1380 1390 1400 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 PGDAEPDDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKKILFYDSEQDKEQSNPYM mKIAA0 RLQKEMEGLSQQYEEKAAAYDKLEKTKNRLQQELDDLVVDLDNQRQLVSNLEKKQKKFDQ 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 284 init1: 119 opt: 318 Z-score: 170.2 bits: 43.1 E(): 0.00025 Smith-Waterman score: 411; 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