FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA3018.ptfa, 732 aa vs ./tmplib.26680 library 1768285 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2636+/-0.00702; mu= -3.1613+/- 0.466 mean_var=273.7588+/-65.173, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0775 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00258 ( 663 res) mej01587 ( 663) 1445 175 2.3e-44 mKIAA1914 ( 835 res) mfj32047 ( 835) 667 88 4.2e-18 >>mFLJ00258 ( 663 res) mej01587 (663 aa) initn: 1690 init1: 654 opt: 1445 Z-score: 888.9 bits: 174.9 E(): 2.3e-44 Smith-Waterman score: 1898; 46.619% identity (53.377% ungapped) in 695 aa overlap (81-729:9-661) 60 70 80 90 100 110 mKIAA3 AQKAEANNLPAPPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYIT :::::.. :: :::::.::.:::.::::. mFLJ00 LRSAAADVPPPLPNKPPPEDYYEEALPLGPGKSPEYIS 10 20 30 120 130 mKIAA3 SNY----------------------------------DSDAMSSSYESYDEEEEDGKGKK :. :::::::::::::::::. ::.. mFLJ00 SHNGCSPAQSIVDGYYEDADNSYPTTRMNGELKNSYNDSDAMSSSYESYDEEEEEEKGRQ 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 mKIAA3 TRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTKLLCYKSSKDQQPQMEL .:::::::::: ::.: .::::::::::::::.: : :::. .:::::::::.::...: mFLJ00 PKHQWPSEEASMHLVRDCRICAFLLRKKRFGQWAKQLTVIKEEQLLCYKSSKDRQPHLRL 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 mKIAA3 PLQGCSITYIPRDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQGKEQAEQWLKVIKEAYSDCSGP-V :. :.. :.:.::..:.:::...: .:. ::::.:..::::.:::::.:. : : : mFLJ00 ALDVCTVIYVPKDSRHKRHELRFSQGATEVLVLALQSREQAEEWLKVIREV----SRPIV 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 mKIAA3 DPECSPPPSTSAPVNKAELEKKLSSERPSSDGEG-GVENGVTTCNGKE---QAKRKKPSK : : . . . ::. .:.::.:. .::... :.... .: . .: ..: :: : mFLJ00 GAEGLEVPRSPVILCKADQDKRLSQEKQNSDSDSLGMNDSGSTLGRREACEHGKGKKNSL 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 mKIAA3 SEAKGTVSKVTGKKITKIIGLGKKKP-STDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNSRWRERWCR .: ::..:...:.:::.::...::: : : :: :.:..:: ::::::: :. :.::::: mFLJ00 AELKGSMSRAAGRKITRIISFSKKKALSEDLQTFSSEDEVPCCGYLNVLVNQGWKERWCR 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 mKIAA3 VKDSKLILHKDRADLKTHLVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAVLEASSSED .. . : .::::.::.::. :: :::::: ::. .::..::.::: ::::.:::: ::: mFLJ00 LRCNTLYFHKDRTDLHTHVNSIALRGCEVAPGFGPRHPFAFRILRNRQEVAILEASCSED 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 mKIAA3 MGRWIGILLAETGSSTDPGALHYDYIDVEMSANVIQTAKQTFCFMNRRAVSTSPYLGSLS ::::.:.::.: ::.. : ::::::.::: ..........: : : . mFLJ00 MGRWLGLLLVEMGSKVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSFL-----------YAQSCQ 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 mKIAA3 NGYAHPSGTALHYDDVPCVNGSLKNKKPPASSNGVPVKGKAPSSQQK--KVETAGGVKRT . . .: ::.:: ......: . :. :: .: : ..: ... ::: mFLJ00 DQWPEPRI----YDEVP--YEKVQDEEPQRPT-GAQVKRHASSCSEKSHRADPQVKVKRH 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 mKIAA3 ASNAEQYKYGKNRVEADAKRLQSKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRK ::.:.::::::::.: ::.: ..:.: :.::..:..:. ::.:.:.:. ::. : : : mFLJ00 ASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKERLEKEKETIRTELTALRQEKKELKEAIRNNPGAK 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 mKIAA3 TQAALEDKLKRLEEECKQREAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPRS----G ..: ::. . :: .:. .: .:..:::.:. ::: :...:::: .:::.. .. mFLJ00 SKA-LEEAVATLEAQCRAKEEQRIDLELKLVAVKERLQQSLAGGPALGLSVSNKNKSQDT 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 720 mKIAA3 TSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDAEGPLPVNSAAVLKKSQPSSGSSPCRGHVLQKAK :..::: :.: : :::: .. :.: .:: .: .:.:::::: mFLJ00 TNKPQS---------NAP---------EQSLPVNCVSELRKRSPSIVTSN-QGRVLQKAK 620 630 640 650 730 mKIAA3 EWELKNGT :::.:. mFLJ00 EWEMKKT 660 >>mKIAA1914 ( 835 res) mfj32047 (835 aa) initn: 1312 init1: 516 opt: 667 Z-score: 417.4 bits: 88.0 E(): 4.2e-18 Smith-Waterman score: 1398; 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