FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0338.ptfa, 907 aa vs ./tmplib.26680 library 1768110 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2584+/-0.0063; mu= 7.4311+/- 0.422 mean_var=186.8276+/-43.954, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 43 in 1/35 Lambda= 0.0938 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4056 ( 844 res) mfj33372 ( 844) 1876 267 8.6e-72 mKIAA0987 ( 851 res) mfk00358 ( 851) 1536 221 6.2e-58 mKIAA1548 ( 789 res) mpm02067 ( 789) 959 143 1.9e-34 mKIAA1013 ( 989 res) mpg00833 ( 989) 222 43 0.00024 mKIAA1027 ( 2564 res) mia05043 (2564) 200 40 0.0036 >>mKIAA4056 ( 844 res) mfj33372 (844 aa) initn: 2040 init1: 1505 opt: 1876 Z-score: 1381.3 bits: 266.7 E(): 8.6e-72 Smith-Waterman score: 1947; 42.809% identity (55.298% ungapped) in 890 aa overlap (29-898:136-844) 10 20 30 40 50 mKIAA0 CGPGGAEGTGPRPAGPRWGPPGPGVLVTMTTETGPDSEVKKAQEETPQQP-EAATAVT .. : : . : .: . : :. : .... mKIAA4 EDLTKNKERTSESRGLSRLLSSFLKRPKSQVSEEEGREVESEKEKGEGGQKEIELGNSLD 110 120 130 140 150 160 60 70 80 90 100 mKIAA0 TPV---TPAGHSHPETNSNEK---H-LTQQDTRPAEQSLDMD-DKDYSEADGLSE----- . .: . .:: ... . : :.. .:.::.. : :.. .:..:. : mKIAA4 EDIILKAPIAAPEPELKTDPSLDLHSLSSIETQPAQEEHREDPDSETKEGEGIEECSGTE 170 180 190 200 210 220 110 120 130 140 150 mKIAA0 -RTTP-SKAQKSP---QKIAKKFKSAICRVTLLDASEYECEVEKHGRGQVLFDLVCEHLN . : :.:.. : :: ... .. :.:.::: . ::: ::::..:: :. :::::: mKIAA4 VKEDPESRAEREPEASQKPVRRHRNMHCKVSLLDDTVYECVVEKHAKGQDLLKRVCEHLN 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 LLEKDYFGLTFCDADSQKNWLDPSKEIKKQIRSSPWNFAFTVKFYPPDPAQLTEDITRYY :::.:::::.. :. ..:.::: .::::::.:. ::::.:.::::::::::::::::::: mKIAA4 LLEEDYFGLALWDSATSKTWLDSAKEIKKQVRGVPWNFTFNVKFYPPDPAQLTEDITRYY 290 300 310 320 330 340 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 LCLQLRADIITGRLPCSFVTHALLGSYAVQAELGDYDAEEHVGNYVSELRFAPNQTRELE :::::: ::..:::::::.: ::::::..:.:::::: : : .:::....:::::.::: mKIAA4 LCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDPELHGMDYVSDFKLAPNQTKELE 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 ERIMELHKTYRGMTPGEAEIHFLENAKKLSMYGVDLHHAKDSEGIDIMLGVCANGLLIYR :..:::::.::.:::..:...::::::::::::::::.::: ::.::.::::..:::.:. mKIAA4 EKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHKAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYK 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 DRLRINRFAWPKILKISYKRSNFYIKIRPGEYEQFESTIGFKLPNHRSAKRLWKVCIEHH :.:::::: :::.::::::::.:.::::::: :..:::::::::..:.::.:::::.::: mKIAA4 DKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEHYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHH 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 TFFRLVSPEPPPKG-FLVMGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPFFERSSSKRYTMSRS :::::.: . ::. ::..:::::::::::::::::::::::::: :::..::: ::: mKIAA4 TFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPHFERTASKR--ASRS 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 LDGAEFSRPASVSENHDAGPEGDKREDDAESGGRRSEAEEGEVRTPTKIKELKPEQETTP :::: ...:. : .: : .: . .. :.. :: mKIAA4 LDGA------AAAESTDRSP----RPTSAPAIAQ-SQVTEG------------------- 590 600 610 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 RHKQEFLDKPEDVLLKHQASINELKRTLKEPNSKLIHRDRDWDRERRLPSSPASPSPKGT :..: . .:: mKIAA4 ------------------------------------------------PGAPIKKTPK-E 620 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 PEKASERAGLREGSEEKVKPPRPRAPESDMGDEDQDQERDAVFLKDNHLAIERKCSSITV :. :. : :: ..: .:. : : :..::. .: .: mKIAA4 AVKVEEKRG-----EEPAEPAEPE-PTEAWKDLDKSQEE----IKKHH------------ 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 SSTSSLEAEVDFTVIGDYHGGAFEDFSRSLPELDRDKSDSETEGLVFAQDLKGPSSQEDE .: : :. ..: .:.:: .. :.. . ..: . mKIAA4 ASISELK----------------KNFMESVPEPRPSEWDKRL-------STHSPFRTLNI 670 680 690 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 SGGLEDSPDRGACSTPEMPQFESVKAETMTVSSLAIRKKIEPEAMLQSRVSAADSTQVDG .: . : : . : . ::..:.:.:. : ..:.. . : mKIAA4 NGQV---P------TGDGPPL--VKTQTVTISDTA--------NAVKSEIPTKDV----- 700 710 720 730 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 GTPMVKDFMTTPPCITTETISTTMENSLKSGKGAAAMIPGPQTVATEIRSLSPIIGKDVL : . ::: . :.: . .. . . . :: :: mKIAA4 ------------PIVHTETKTITYEAA-QTEDSNGDLDPG------------------VL 740 750 760 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 TSTYGATAETLSTSTTTHVTKTVKGGFSETRIEKRIIITGDEDVDQDQALALAIKEAKLQ .. :.:: :..:::..:::::::.:::::::::.:::: :.:.::.:. :::::: : mKIAA4 LTAQTITSETTSSTTTTQITKTVKGGISETRIEKRIVITGDADIDHDQVLVQAIKEAKEQ 770 780 790 800 810 820 880 890 900 mKIAA0 HPDMLVTKAVVYRETDPSPEERDKKPQES :::: :::.::..::. : : mKIAA4 HPDMSVTKVVVHQETEISEE 830 840 >>mKIAA0987 ( 851 res) mfk00358 (851 aa) initn: 1835 init1: 1490 opt: 1536 Z-score: 1132.5 bits: 220.7 E(): 6.2e-58 Smith-Waterman score: 1546; 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