FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0516.ptfa, 1195 aa vs ./tmplib.26680 library 1767822 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6474+/-0.00625; mu= 4.5468+/- 0.416 mean_var=189.7910+/-44.665, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0931 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1066 ( 1328 res) mbg07245 (1328) 1821 258 7.4e-69 mKIAA0337 ( 1082 res) mbg04504 (1082) 438 72 5.3e-13 mKIAA1626 ( 1241 res) mpg00117 (1241) 362 62 6.8e-10 mKIAA0294 ( 1324 res) mbg02039 (1324) 327 57 1.9e-08 >>mKIAA1066 ( 1328 res) mbg07245 (1328 aa) initn: 3012 init1: 1287 opt: 1821 Z-score: 1328.6 bits: 258.0 E(): 7.4e-69 Smith-Waterman score: 3763; 54.872% identity (60.225% ungapped) in 1170 aa overlap (68-1190:211-1323) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 FGFVGGAVVINSAILVSLSVLLLVHFSISTGVPALTQNLPRILRKERPISLGIFPLPAGD : ..:: ::::: ::..::: .: mKIAA1 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. . .:. .....:. : .: :. : . :: ::::::: mKIAA1 HVFTDPAPTP-SSSTQPASENGSESNGTIVQPQVEPSG-----ELSTTTSSAAPTMWLGA 920 930 940 950 960 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 QNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLS ::: :::::.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::::::::::::: ::::::: mKIAA1 QNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS 970 980 990 1000 1010 1020 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 NYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLA ::::.:::.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:.::::::::::.:::::::: mKIAA1 NYHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 WVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCN :.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::... : mKIAA1 WIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAGN 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1040 1050 1060 1070 mKIAA0 RLWVGTGNGVIISIPLTET-------------NKTSGTPG--NRPGSVIRVYGDENSDKV ::::::::::.:::::::: :::: : : 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.. : ..: : . :. : .. :. mKIAA0 LSPAGLC-QGHTGHVRFLAAVQLPEGFNLLCSTPPPPPDTGPEKLPSLDHRDSPRRRGPT 980 990 1000 1010 1020 1030 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA0 SQTPLKSMLVISGGEGYIDFRMGDEGG-ESELLGEDLPLEPSVTKAERSHLIVWQVMCGN : : .:::::::.: :::... :: :: .:.: .::..:.: mKIAA0 SARP--KMLVISGGDGSEDFRLSSGGGGSSETVGRD---------DSTNHLLLWRV 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA0 E >>mKIAA1626 ( 1241 res) mpg00117 (1241 aa) initn: 380 init1: 184 opt: 362 Z-score: 269.9 bits: 62.0 E(): 6.8e-10 Smith-Waterman score: 362; 28.854% identity (31.466% ungapped) in 253 aa overlap (826-1068:829-1070) 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 PLGVQIPEDLSPVFQSSNDSDVYKDQISVLPNEQDLAREEAQKMS----SLLPTMWLGAQ :.:. . ::.. . .. ::. :: : mKIAA1 EIFSLNRPSPRTIKSFPVAAPVLCIEYIPDPEEEAEGAEESRAATDPSVTVHPTVCLGLQ 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 NGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKL--KDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGV-DGQWD .: . ...:: .:: . : . .: . : .:..: ::::: . : : :: mKIAA1 DGSILLYGSVDTGTQCLATCKSPGPQPVLCLRHSPFYLLAGLQDGTLAAYPRTSGDIPWD 860 870 880 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