FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0385.ptfa, 1377 aa vs ./tmplib.26680 library 1767640 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4800+/-0.00644; mu= -7.0608+/- 0.424 mean_var=346.5543+/-83.504, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0689 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0425 ( 1578 res) mpm06367 (1578) 651 80 5.1e-15 >>mKIAA0425 ( 1578 res) mpm06367 (1578 aa) initn: 2419 init1: 499 opt: 651 Z-score: 362.0 bits: 79.6 E(): 5.1e-15 Smith-Waterman score: 2850; 39.184% identity (45.977% ungapped) in 1225 aa overlap (316-1377:367-1573) 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 DFVPFRPRRSPRMSLRSSMAQRAGRSSMGTKMSCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSS ..::. :. :::::::::::: :::::. mKIAA0 LAPQLTTGFQPSLASPGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQLFCST 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 mKIAA0 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