FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4091.ptfa, 874 aa vs ./tmplib.26680 library 1768143 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3019+/-0.00682; mu= 6.4094+/- 0.450 mean_var=305.6102+/-72.911, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0734 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335) 317 48 7.3e-06 mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984) 296 46 4.2e-05 mKIAA3005 ( 1833 res) mbg08806 (1833) 272 44 0.00024 mKIAA1074 ( 1043 res) mfj11296 (1043) 261 42 0.00039 mKIAA0216 ( 2048 res) mib13036 (2048) 258 42 0.0007 mKIAA0445 ( 1598 res) mbg06476 (1598) 236 40 0.0031 mKIAA2034 ( 1729 res) meh02376 (1729) 231 39 0.0046 mKIAA0378 ( 632 res) mbg02680 ( 632) 216 37 0.0081 >>mFLJ00279 ( 1335 res) mpg01084 (1335 aa) initn: 212 init1: 96 opt: 317 Z-score: 197.6 bits: 48.3 E(): 7.3e-06 Smith-Waterman score: 378; 23.815% identity (27.960% ungapped) in 823 aa overlap (83-851:225-979) 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 AANEELRAKLTDIQIELQQEKSKVSKVEREKSQELKQVREHEQRKHAVLVTELKTKLHEE : :: .::: :: :..: . : mFLJ00 LRLRNWQWWRLFTKVKPLLNSIRHEDELLAKEAELTKVRE----KH--LAAENRLTEMET 200 210 220 230 240 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 KMKELQAVREALLRQHEAELLRVIKIKDNENQRLQALLNTLRDGAPDKVKTVLLCEAKEE ...:.: . : .: .:: . .. . :: : . :.. : : : .:: mFLJ00 MQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRA-RLTAKKQELEEICHDLEARV---EEEEE 250 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 AKKGFEVEKVKMQQEISELKGAKKQVEEALTMVIQADKIKAAEIRSVYHLHQEEITRIKK . ...:: ::::.:.::. . . ::. . .: .:. ..: . . .:....: . mFLJ00 RCQYLQAEKKKMQQNIQELE-EQLEEEESARQKLQLEKV-TTEAK-LKKLEEDQIIMEDQ 310 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 mKIAA4 ECEREIRRLMEEIRFKDRAVFVLERELGVQAGHAQRLQLQKEA----LDEQLSQAKEAER .:. .. . : : . .. ..:.: .. .:. ..:: :.:.: . .. .. mFLJ00 NCKLAKEKKLLEDRVAEFTTNLMEEEE--KSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQ 370 380 390 400 410 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 HPGSPRRELPYASGAGDASDHSGSPEQQLDEKDARRFQL--KIAELSAIIRKLEDRNALL . . ::.: ::..: : . . . ..:: : ::.: . ..:.. : mFLJ00 ELEKTRRKLE-----GDSTDLSDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELQAALARVEEEAA-- 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 mKIAA4 SEERNELLKRLREAESQYKPLLD--KNKRLTR-----KNEDLSHTLRRIESKLKFV---T ..: ::..:: :.: . : . ...: .: ...::.. :. ....:. . : mFLJ00 --QKNMALKKIRELETQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDST 480 490 500 510 520 530 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 QENIEMRQRAGIIRRPSSLNDLDQS-QDEREIDFLKLQIVEQQN--LIDELSKTLETAGY . :.:.. : . .. : .. .:: . ..: ..:.. ..::. :: . mFLJ00 AAQQELRSK-----REQEVSILKKTLEDEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELADQLEQTKR 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 mKIAA4 VKSVLERDKLLRYRKQRKKMAKLPKPVVVETFFGYDE------EASLE------SDGSSI ::..::. : ...: ..:. : .. : .: ::.:. :.: . mFLJ00 VKATLEKAKQT-LENERGELANEVKALLQGK--GDSEHKRKKVEAQLQELQVKFSEGERV 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 550 mKIAA4 SYQTDRTDQ-TPCTPEDDLEEGMAKEETELRFRQLTMEYQAL----QRAYALLQEQVGGT .:. .:. : : : :. .. .. . .:: ...:: : . ::::. mFLJ00 --RTELADKVTKLQVELDSVTGLLSQ-SDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQK 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 mKIAA4 LDAEREVKT--------REQLQAEIQRAQTRVEDLEKALAEQGQDMKW--------IEEK :. ..: ::::. : ..:. .: .: : ::: .: mFLJ00 LSLSTKLKQMEDEKNSFREQLEEE-EEAKRNLEKQIATLHAQVTDMKKKMEDGVGCLETA 700 710 720 730 740 750 610 620 630 640 650 mKIAA4 QALYRRNQELVEKIKQMETEE--ARLKHEVQDAKDQNELLEFRILELEERERKSPAINFH . :: :. .: ..: :. : : : .. :.:: .. ...:...... .. . mFLJ00 EEAKRRLQKDLEGLSQRLEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDL-LVDLDHQRQSVSNLEKK 760 770 780 790 800 810 660 670 680 690 700 710 mKIAA4 HTPFVDGKSPLQVYCEAEGVTDILVTELMKKLDILGDNANLTNEEQVVVIQARTVLTLAE . : : :. : . .. . : . .:. ..: .. ::. : : mFLJ00 QKKF-D-----QLLAEEKTISAKYAEERDRA------EAEAREKETKALSLARA-LEEAM 820 830 840 850 860 720 730 740 750 760 770 mKIAA4 KWLQRIEETESALQRKMVDLESEKELFSKQKGYLDEELDYRKQALDQAHKHILELEAMLY . ..:. .. .. .: :: : :. .:. .::. :.::.: .. :....: mFLJ00 EQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSV----HELEKSKRALEQ---QVEEMKTQL- 870 880 890 900 910 780 790 800 810 820 830 mKIAA4 DALQQEAGAKVAELLSEEEREKLKVAVEQWKRQVMSELRERDAQILRERMELLQIAQQRI . :..: : .:. . .:.: .. : : .:. :: : ... .:.. .. mFLJ00 EELEDELQA------TEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVR----QV 920 930 940 950 960 840 850 860 870 mKIAA4 KELEERIETQKRQIKELEEKFLFLFLFFSLAFILWS .:.: ..: ...: mFLJ00 REMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDTANKNREEAIKQLRKLQAQMKDCM 970 980 990 1000 1010 1020 >>mKIAA0866 ( 1984 res) mtg01789 (1984 aa) initn: 173 init1: 87 opt: 296 Z-score: 183.9 bits: 46.3 E(): 4.2e-05 Smith-Waterman score: 402; 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