FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
../query/mKIAA0463.ptfa, 1529 aa
vs ./tmplib.26680 library
1767488 residues in 2168 sequences
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Lambda= 0.1276
FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are: opt bits E(2168)
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:::.:.:.:::.:::::: :::.: ::.:
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:::::::.::..:::.: :.:: : .:::... ::..: :.: ..::. . : : .
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..:.:: :. :.: ..::.:. . ... : ::. ..: :. . : ..: :.::::
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:::: : .. :.:. : :.:. .::: :::::::.: : .. . .. :..:. .:. .
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. . : ...:::.:. .:: ::: :::: . : : .:.:::.::: .:.. : : :.
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:: :..::. . : .:. ....::.. . ....: .:: . ::.:::::.:: : :
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..: :::::::::: ::::::::::::::::::.:::..:::: ::::::::::.::::.
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: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::
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::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
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1230 1240 1250 1260 1270 1280
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::::::::.:::::::::::::::::.::.:::::::::::.::::::::.:::::::::
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: ..:: .:::.:::::..::..:.. :::.::::::::: :.:.....:.. :
mKIAA4 HLSQFNSMSALHEIYSYIAKYKDEILVALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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:::::::::::::. .: ::.:::::::
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:::.:::: :..::.::.::: .:::::.:::.::::.::::::::::::::::::::::
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.: .: ..::::::::.::.::: :.:.:.::::.:::: :..:::::::::::::::::
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:::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::...: : :::::::::
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::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::.::.:::::: ::::. .::::::.:::.:::::::..::.::::.:.: ::.::
mKIAA4 KDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHANDFNVLSALSELYFYVTKYR
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mKIAA0 EELIGALEQDEQARRQRLAYKVEHLINAMSIES
.:.. .:..: . :...: :.:..:. .: :
mKIAA4 QEILTSLDRDASCRKHKLRQKLEQIITLVSSSS
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:::.:::.::::::::::::::::::::::
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.:.::: :::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::::.: .:::
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mKIAA0 MLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEHLINAMSIES
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mKIAA1 TMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
160 170 180 190
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:: ...:: :... .. . ::
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.:: :.:..::.:: .:.: :: . :. ....: : :. . : :. ..
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:::.:. .:..:: : .:: ..:::.:....: .::::.:.. :. .. : . . . .
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... :.: .. : :. :.: :.. .. . .. :.:: .:: .:: ...:
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: . :. . :. . : .: :: .:...: : :. .::..: .:.::
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: : ::... . : :: . :. . . : :.. .: .::::..:. .:.:
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. : . . .... :: .... . . : : :.: :.: :. . . .
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