FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4053.ptfa, 1400 aa vs ./tmplib.26680 library 1767617 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6587+/-0.0047; mu= 20.6896+/- 0.314 mean_var=106.2210+/-24.489, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1244 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 6503 1180 0 mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 ( 609) 3298 604 3.8e-173 mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746) 1544 289 4.3e-78 mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207) 1279 241 7.4e-64 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 1119 212 1.1e-55 mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299) 928 179 7.2e-45 mKIAA1206 ( 1374 res) mbg00219 (1374) 852 165 9.5e-41 >>mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529 aa) initn: 6380 init1: 1605 opt: 6503 Z-score: 6306.5 bits: 1179.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 6503; 66.619% identity (67.097% ungapped) in 1405 aa 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>>mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 (609 aa) initn: 3298 init1: 3298 opt: 3298 Z-score: 3200.9 bits: 603.6 E(): 3.8e-173 Smith-Waterman score: 3298; 81.940% identity (81.940% ungapped) in 598 aa overlap (803-1400:12-609) 780 790 800 810 820 830 mKIAA4 RKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIPFLDYRTYA :::::::::.:::. .::. :::::::::: mKIAA4 FPKPDRPAACYAFAELQTDINELTNHMDGVQIPFLDYRTYA 10 20 30 40 840 850 860 870 880 890 mKIAA4 MRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGN .:::::::: ::::::... ::::.: :::::: .. ::::::.::::: ::::::::. mKIAA4 VRVLFPGIEAHPVLKELDTPPNVEKALRLFGQLLHSRAFLLTFIHTLEAQSSFSMRDRGT 50 60 70 80 90 100 900 910 920 930 940 950 mKIAA4 VASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFL :::: :.:::....::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 VASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFL 110 120 130 140 150 160 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA4 LYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCV :.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: mKIAA4 LHKFLKECAGEPLFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCV 170 180 190 200 210 220 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA4 NPEHENAPEVPVKGLNCDTVTQVKEKLLDAVYKGVPYSQRPKAGDMDLEWRQGRMARIIL :: :.. .:::: ::::..::.:.::::.::::.:::::::: :::::::::::::::: mKIAA4 CPESEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMARIIL 230 240 250 260 270 280 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA4 QDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLR ::::.::::. ::::.:.:::::::::: :::::::.::::..:: :::.:::::::.:: mKIAA4 QDEDITTKIECDWKRVNSLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLR 290 300 310 320 330 340 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA4 TASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKG .::::::::::.::.::: :.::::::::.:::: :.::::::::::::::::::::::: mKIAA4 AASSPDSLRSRAPMLTPDQEAGTKLWHLVRNHDHTDHREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKG 350 360 370 380 390 400 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA4 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. . :: :: .::: : :.:: ::.: mKIAA0 ----GAFSDVVTVNVSKEGR--SREQFSYVLPTVHSLEPSMGPKAGGTRITIHGSDLNVG 780 790 800 810 820 830 500 510 520 530 540 550 mKIAA4 SDVAVSIGGR-PCSFSWRNSREIRCLTPPGHTPGSAPIVININRAQLSNPEVKYNYTEDP : . : .. ::. :.. : : .: : :. .:. . .. . .. . : ..: mKIAA0 SMLQVLVNDTDPCTDLTRTATSITCTVPGGTLPSPVPVCVRFESRGCVHGNLTFWYMQNP 840 850 860 870 880 890 560 570 580 590 600 610 mKIAA4 TILRIDPEWSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKYGGIERENS-CMVYNDTTMVCRAP .: :.: : ::: .::.: . :.. . ... : :: . : : :.: ..: .: mKIAA0 VITAISPGRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIG--REPTFCKVLNSTLITCPSP 900 910 920 930 940 950 620 630 640 650 660 mKIAA4 SIDNPKRSPPEL---GE-RPDEIGF-IMDNVRTLLVLNSSSFL--YYPDPVLEPLSPTGL . . .: .. :. :: . ..: ... .: : : :.: . . mKIAA0 GALSNASAPVDFFINGRAYADEAAEELLDPAEAQ---RGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKW 960 970 980 990 1000 670 680 690 700 710 mKIAA4 LELKPSSPLIL---KGRNLLPPAPGNSRLNYTVLIGSTPC-ILTVSETQLLCEAPN---- .. .:. :: : : .. : : .: . ::.. : : .:. . : . . mKIAA0 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