FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0718.ptfa, 769 aa vs ./tmplib.26680 library 1768248 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7435+/-0.0049; mu= 18.6909+/- 0.329 mean_var=114.6905+/-26.569, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1198 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4131 ( 789 res) mid35078 ( 789) 2065 368 2e-102 mKIAA0145 ( 1039 res) mbg16251 (1039) 460 91 7e-19 mKIAA4165 ( 674 res) mfj42151 ( 674) 149 37 0.0082 >>mKIAA4131 ( 789 res) mid35078 (789 aa) initn: 2758 init1: 1427 opt: 2065 Z-score: 1931.2 bits: 368.1 E(): 2e-102 Smith-Waterman score: 3222; 60.050% identity (66.620% ungapped) in 801 aa overlap (2-769:35-789) 10 20 30 mKIAA0 EEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDFEGFK ::. .: : .:.: .. :... :: mKIAA4 EQWVSLSSEEFDQLQKYSEYSSKKIKDVLAEFNEGGSLRQYDP-------HKPISYDVFK 10 20 30 40 50 40 50 60 mKIAA0 LFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNK-------FPH-----SSPNVKS------------ :::...::..::. ...:::..::.: :. : :::.. mKIAA4 LFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQKPRQETPDHPKEGASSSEPNVSDYNSDNAAKADEA 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 mKIAA0 -KPALLSGGLRMNKGA----ITPPRSSP---ANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDK : : . . . . : .: :.. . :..:::.::::::.: :::.:: mKIAA4 CAPDTESKTTKTQAPSKELEAAAPWEDPGALASSSDAPVVYLKDVVCYLSLMETGRPQDK 120 130 140 150 160 170 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 LEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIIGQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDRDGT :::::::::.: ::.::..:...:..::.:::.::::: ::: :::.::.. .:::.:: mKIAA4 LEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDQIVSQMLHVAQYLEWDPTELRPILKEMLQGMDYDKDGF 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 VSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENN-VKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQG :::.:::.:::::::::::::.... : ::.:.: ::::.::.:::.: ::.:::::: mKIAA4 VSLQEWINGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTLKHFKKPTYCNFCRAMLMGVGKQG 240 250 260 270 280 290 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 LCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVKSKKNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQ ::: .::::::.:::... .:.:: :.:.. .::.: ::::: .:::.:::..:::: mKIAA4 LCCIYCKYTVHQRCVSKTIHGCVKTNSKAKRSGEVMQHAWVEGNSSVKCDRCHKSIKCYQ 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 GLTGLHCVWCQTTLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLTMPSAGASVPEERQ ..:. :::::. :.: :: .:. :: : :::::: ::.:::: mKIAA4 SVTARHCVWCRMTFHRKC--ELSTVCDGGELKDHILLPTSICPV---------------- 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 mKIAA0 STAKKEKSSSQQPNKATDKNKMQRANSVTMDGQGLQITPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGE :...: .: .: . ... ::. .: : ::::::::.:::::::.::: mKIAA4 -------SGDRQGGK-SDGSVAAKGELVTQ----YKIIPSPGTHPLLVLVNPKSGGRQGE 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 mKIAA0 RIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLHFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWILDCIEKANVV :: :::.:::::.::..:...:: :::.::.:.:::::::::::::::::::::.::: . mKIAA4 RILRKFHYLLNPEQVFNLDNGGPTPGLNFFHDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDKANFT 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 KHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIESSTEIMLDRWKFEVTPNDKDE ::::::.::::::::::::::::::::: .: ::::.::.: .::::: .:: : .. : mKIAA4 KHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKEIEQSPLVMLDRWYLEVMPREEVE 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 KGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATC .:: :::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::.::: mKIAA4 NGDQVPYNIMNNYFSIGVDASIAHRFHMMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATC 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 KKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKKRSHRRIEKKGSDK ::::. .:.:::::..:: :: ::::::::::::.::.:::::.::.:. : .. mKIAA4 KKLHDHIELECDGVEVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGETKKNRAVIR------ES 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 RPTLTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSSVVIRTSKS : ..:: :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: mKIAA4 RKSVTDPKELKCCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSSVTIRTNKL 690 700 710 720 730 740 720 730 740 750 760 mKIAA0 LPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLIKRTRNRSKE ::::.::::::: :::::::::::::.:::: :...: :: : ..:::. mKIAA4 LPMQVDGEPWMQPQCTIKITHKNQAPMMMGPPQKSSFF-SL--RRKSRSKD 750 760 770 780 >>mKIAA0145 ( 1039 res) mbg16251 (1039 aa) initn: 905 init1: 413 opt: 460 Z-score: 431.3 bits: 91.0 E(): 7e-19 Smith-Waterman score: 633; 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