FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0577.ptfa, 1048 aa vs ./tmplib.26680 library 1767969 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2330+/-0.00649; mu= 6.7174+/- 0.429 mean_var=257.0977+/-62.443, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 29 in 1/35 Lambda= 0.0800 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264) 1697 210 1.5e-54 mKIAA0224 ( 1224 res) mpg04132 (1224) 840 111 8.4e-25 mKIAA4209 ( 1417 res) mfj00137 (1417) 646 89 5e-18 mKIAA0134 ( 1167 res) mbh02208 (1167) 558 79 5.1e-15 mKIAA1488 ( 425 res) mpk03351 ( 425) 495 71 4.4e-13 mKIAA0890 ( 1057 res) mbg06494 (1057) 494 71 8.1e-13 mKIAA1517 ( 937 res) mbp07073 ( 937) 469 68 5.6e-12 >>mKIAA4096 ( 1264 res) mfj04296 (1264 aa) initn: 2495 init1: 1237 opt: 1697 Z-score: 1072.0 bits: 210.3 E(): 1.5e-54 Smith-Waterman score: 2425; 43.730% identity (48.144% ungapped) in 949 aa 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. : : .. : ...: . : : . :: ... . . .. mKIAA4 QAQREA---------EMDSIPMGLNKHWVDPLPDAE----GRQIAANMRG---IGMMPND 540 550 560 570 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 TIEFVRAAQLQGDEEPSGPPLSAQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIE :. . : . :.. : . . :: :.:::.. ..:.:. :. ..:.::. mKIAA4 IPEWKKHA-FGGNKASYGK------KTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVI 580 590 600 610 620 630 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 GETGSGKTTQIPQYLFEEGYTKKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSI ::::::::::: ::: : :::..: ::.::::::::::::: ::..:.: ::.::::.: mKIAA4 GETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRG-KIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTI 640 650 660 670 680 690 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 RFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVAR ::::::: .::..:::::::::: : .:::..:...:.:::::::.:::.::::.: ... mKIAA4 RFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQ 700 710 720 730 740 750 580 590 600 610 mKIAA0 FRPELKVLVASATLDTARFSAFFDDAPVFRIPGRR------------------------- : ..:..:.:::::...:: .: .::.: :::: mKIAA4 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