FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4223.ptfa, 1076 aa vs ./tmplib.26680 library 1767941 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7305+/-0.0052; mu= 14.0921+/- 0.347 mean_var=132.6843+/-30.814, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1113 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 ( 562) 223 48 5.5e-06 mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 ( 950) 206 45 5.1e-05 mKIAA0705 ( 1252 res) mbg00550 (1252) 191 43 0.00032 mKIAA1634 ( 1170 res) mbg16650 (1170) 168 39 0.004 mKIAA4129 ( 1125 res) mfj49110 (1125) 167 39 0.0043 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 168 40 0.005 >>mKIAA4187 ( 562 res) mpm05138 (562 aa) initn: 372 init1: 157 opt: 223 Z-score: 199.9 bits: 47.8 E(): 5.5e-06 Smith-Waterman score: 301; 22.921% identity (27.033% ungapped) in 493 aa overlap (24-510:68-491) 10 20 30 40 50 mKIAA4 RASEYAPEQAQGADTMPGWKKNIPICLQAEEQERDESPYTKSASQTKPPDGTL : :.. .: . .: : . : . mKIAA4 IERVINIFQSNLFQALIDIQEFYEVTLLDNPKCVDHSKQCEPVQPVTTWEIASLP---ST 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 AVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDV :: ...: . : :: .. . . : . .:.:.: : .. .. .. mKIAA4 AVTSETLPGSL--SPPVEKYRYQDEEV-LP-----PEHISPQVTNEVLGPELVHVSEKNL 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 GDYIKAVNGINLAKFRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSSVMFRTVEVTLHK .. :. :.: ... : :: .: :..... :. :.:... .. :.::.. mKIAA4 SE-IENVHG--FVSHSH---ISPIKANPPPVLVNTDSLETPTYVNGTDADYEYEEITLER 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 EGNTFGFVIRGGAHDDR-NKSRPVVITCVRPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTH .. .:: : ::. . . . . . :: . :: : ..: .. .: .: :. . .:: mKIAA4 GNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDSSIFITKIITGGAAAQDGRLRVNDCILRVNEADVRDVTH 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 AEAMSILKQCGQEATLLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTPGASLGVALTTSVCCNKQ ..:. ::. :. . : .. . ... . ... : : .:: ... .: :.. mKIAA4 SKAVEALKEAGSIVRLYVKRRKPASEKI------MEIKLIKGP-KGLGFSIAGGVG-NQH 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 mKIAA4 V-----IVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLE . : . :: .. : . : :..::..:..... .: : ::. : ::.: : :. mKIAA4 IPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNSVCLEEVTHEEAVTALKNTSDFVYLK 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 ILPHHQTRLALKGPDHAAMVPSSSPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLK . :..: :.. . : .: : : :: mKIAA4 VAK-----------------PTTSSQSVDNHVSPSSCLGQTPTSPARYSP---------- 380 390 400 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 KKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVTGFGIQLQGSVFATETLSSPPLIS :..: :. . . : .::: ::.:... :. : . .:: mKIAA4 ----------ISKAV-LGDDEITREPRKVVLHRGS-TGLGFNIVGGE-DGEGI----FIS 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 YIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEANQLLRDSSITSKVTLEIEFDVAES .: : .::. : :. :::....:.. . .. :.: :.... mKIAA4 FILAGGPADLSGELRKGDRIISVNSVDLRAASHEQAAAALKNAGQAVTIVAQYRPEEYSR 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 VIPSSGTFHVKLPKKHSVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLL mKIAA4 FEAKIHDLREQMMNSSVSSGSGSLRTSQKRSLYVSLEPSLIMTRLRTAGFPVKD 510 520 530 540 550 560 >>mKIAA1232 ( 950 res) mbg05359 (950 aa) initn: 388 init1: 168 opt: 206 Z-score: 182.5 bits: 45.3 E(): 5.1e-05 Smith-Waterman score: 337; 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