FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1066.ptfa, 1328 aa vs ./tmplib.26680 library 1767689 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4229+/-0.00659; mu= 2.0990+/- 0.436 mean_var=265.4074+/-62.646, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 25 in 1/35 Lambda= 0.0787 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0516 ( 1195 res) mbg07952 (1195) 1821 221 8.7e-58 mKIAA0337 ( 1082 res) mbg04504 (1082) 456 66 3.8e-11 mKIAA1626 ( 1241 res) mpg00117 (1241) 382 58 1.4e-08 mKIAA0294 ( 1324 res) mbg02039 (1324) 328 52 1e-06 >>mKIAA0516 ( 1195 res) mbg07952 (1195 aa) initn: 3012 init1: 1287 opt: 1821 Z-score: 1129.8 bits: 221.2 E(): 8.7e-58 Smith-Waterman score: 3763; 54.910% identity (60.376% ungapped) in 1171 aa overlap (211-1323:68-1190) 190 200 210 220 230 mKIAA1 KEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGSGQTESSLPGRSRKERPTSLNVFPL--AD : ..:: ::::: ::..::: .: mKIAA0 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. : . . :. .....:. : .: :. : . :: :::::: mKIAA0 HVFTDPLGVQIPEDLS-PVFQSSNDSDVYKDQISVLPNEQDLAREEAQKMSSLLPTMWLG 800 810 820 830 840 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA1 AQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDL :::: :::::.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::::::::::::: :::::: mKIAA0 AQNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDL 850 860 870 880 890 900 1030 1040 1050 1060 1070 1080 mKIAA1 SNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQL :::::.:::.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:.::::::::::.::::::: mKIAA0 SNYHLLDLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQL 910 920 930 940 950 960 1090 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA1 AWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAG ::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::... mKIAA0 AWVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSC 970 980 990 1000 1010 1020 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA1 NRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGTRPGGIIHVYGDDSSDK :::::::::::.:::::::: 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