FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4061.ptfa, 1011 aa vs ./tmplib.26680 library 1768006 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0071+/-0.00644; mu= -6.0944+/- 0.424 mean_var=372.6109+/-88.218, 0's: 0 Z-trim: 24 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0664 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0376 ( 1135 res) mbg00975 (1135) 902 101 8.2e-22 mKIAA1364 ( 776 res) mbg16438 ( 776) 309 44 8.2e-05 mKIAA0903 ( 1242 res) mfj01081 (1242) 290 43 0.0004 mKIAA1668 ( 883 res) mpf01101 ( 883) 285 42 0.00044 mKIAA0750 ( 1106 res) mbp09208 (1106) 287 42 0.00045 mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290) 283 42 0.00065 mKIAA4046 ( 1319 res) mpm06238 (1319) 259 40 0.0032 mKIAA4151 ( 1916 res) mpf01376 (1916) 250 39 0.0076 >>mKIAA0376 ( 1135 res) mbg00975 (1135 aa) initn: 2009 init1: 689 opt: 902 Z-score: 484.0 bits: 101.3 E(): 8.2e-22 Smith-Waterman score: 2260; 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.:..:. : .:: :::...... ..: :. .....: mKIAA0 NARFEREQLLGVQQHLSNTLKMAEQDNKEAQEMIGALKERSHHMERIIESEQKGKAALAA 520 530 540 550 560 570 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 TLEECRVTLEGLKMENGSLKALLEADKQKAIEASSTVGQTAENFEVQEMLKVARAEKDQL :::: ..:. . ..: . ::: :: .:::. : : . ..... ..:..:. .: .:.. mKIAA0 TLEEYKATVASDQIEMNRLKAQLENEKQKVAELYS-IHNSGDKSDIQDLLESVRLDKEKA 580 590 600 610 620 630 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 QLSCTELRQELLKANGEIKHVSSLLAKMEKDYSYLKEVCDHQAEQLSRTSLKLQEKASES . . :...: .. .. ..... .::.: .: ..: .: :.:. : ::. . :. mKIAA0 ETLASSLQEDLAHTRNDANRLQDTIAKVEDEYRAFQEEAKKQIEDLNMTLEKLRSELEEK 640 650 660 670 680 690 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 DAEIKDMKETIFELEDQVEQHRAVKLHNNQLISELEGSVIKLEEQKSDLERQLKTLTKQI :.: .:::::::::::.::::::::::.: .::.::..: ::..:: :.::..::: ... mKIAA0 DTERSDMKETIFELEDEVEQHRAVKLHDNLIISDLENTVKKLQDQKHDMEREIKTLHRRL 700 710 720 730 740 750 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 KEETEEWRRFQADLQTAVVVANDIKCEAQQELRTVKRRLLEEEEKNARLQKELGDIQGHS .::. :::.::::::::::.::::: :::.:. .:::: : .::: .: ::: 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