FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1221.ptfa, 1249 aa vs ./tmplib.26680 library 1767768 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4079+/-0.00541; mu= 18.0257+/- 0.360 mean_var=188.1573+/-44.909, 0's: 0 Z-trim: 19 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0935 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 236 46 7.7e-05 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 218 42 0.00021 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 214 42 0.00035 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 198 40 0.0013 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 201 41 0.0014 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 195 39 0.0018 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 194 39 0.0023 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 189 39 0.003 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 190 39 0.0036 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 187 38 0.0041 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 183 38 0.0057 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 184 38 0.0069 >>mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852 aa) initn: 134 init1: 103 opt: 236 Z-score: 179.2 bits: 45.9 E(): 7.7e-05 Smith-Waterman score: 236; 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