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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 mKIAA1221, 1249 aa
 vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library

2727779818 residues in 7921681 sequences
 statistics sampled from 60000 to 7909084 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2830+/-0.00019; mu= 14.2521+/- 0.011
 mean_var=88.8549+/-17.199, 0's: 34 Z-trim: 109  B-trim: 365 in 2/66
 Lambda= 0.136061

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width:  16
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gi|224057461|ref|XP_002194380.1| PREDICTED: zinc f ( 955) 2978 595.7 4.6e-167
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gi|34193425|gb|AAH50656.1| Zinc finger protein 644 ( 105)  641 136.0 1.2e-29
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gi|122891174|emb|CAM14345.1| novel protein similar (1169)  578 124.6 3.5e-25
gi|37696950|gb|AAR00499.1| putative zinc finger pr ( 212)  534 115.3 4.1e-23
gi|148688236|gb|EDL20183.1| zinc finger protein 64 (  80)  526 113.4   6e-23
gi|149521214|ref|XP_001516444.1| PREDICTED: simila ( 857)  444 98.2 2.3e-17
gi|194668246|ref|XP_615212.4| PREDICTED: similar t (1659)  421 94.0 8.5e-16
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gi|4389513|gb|AAD19818.1| Human homolog of Mus mus (1568)  400 89.8 1.4e-14
gi|146325818|sp|O95785.2|WIZ_HUMAN RecName: Full=P (1651)  400 89.8 1.5e-14
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gi|189516757|ref|XP_001341794.2| PREDICTED: simila (2022)  381 86.2 2.3e-13
gi|148708370|gb|EDL40317.1| mCG14253, isoform CRA_ (1656)  368 83.6 1.1e-12


>>gi|149709359|ref|XP_001493620.1| PREDICTED: similar to  (1328 aa)
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Smith-Waterman score: 7205;  85.407% identity (95.534% similar) in 1254 aa overlap (2-1249:76-1328)

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       ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.::::::.:::.:::..:.:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.
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mKIAA1 RNSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSG
       ::::.::.: :::::::::::::::::.:::::.:.:::::::::::.::::::::::::
gi|149 RNSAISPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLSEDSPLMYHPQKMDLTMHSALDCKQKKSRSRSG
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

        1170      1180      1190      1200      1210      1220     
mKIAA1 SKKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|149 SKKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEV
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

        1230      1240         
mKIAA1 TSLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
       ::::::::::::::::::::::::
gi|149 TSLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
         1310      1320        

>>gi|126717443|gb|AAI33354.1| ZNF644 protein [Bos taurus  (1327 aa)
 initn: 6004 init1: 2956 opt: 7163  Z-score: 7593.5  bits: 1417.3 E():    0
Smith-Waterman score: 7163;  84.278% identity (95.291% similar) in 1253 aa overlap (2-1249:76-1327)

                                            10        20        30 
mKIAA1                              TEELSEDQSEQALSGGQSALFLPASTPAVPT
                                     ::::.:.::.:::::::.::. :..:.: .
gi|126 NSFISDKESGVHKPKDCQASFQKNNTFTLPEELSKDKSEKALSGGQSTLFIHAGAPTVSS
          50        60        70        80        90       100     

              40        50        60        70        80        90 
mKIAA1 ENFPLTTAPVGKGPVSCSSSTKTSNMNEGSVSLTPGQPADQLAAESCSTLKAAADHQLST
       ::: :  . . .:::: :: :::::::.:::::: :::.:: ..:::: ::.::: ::::
gi|126 ENFILPKGAAVNGPVSHSSLTKTSNMNKGSVSLTTGQPVDQPTTESCSGLKVAADLQLST
         110       120       130       140       150       160     

             100       110       120       130       140       150 
mKIAA1 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKVPTSALVGCDVQNSVGNNMKSESTLLSQAEVG
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::: .:::.:::::...::.:::..:.:::
gi|126 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKLPTSASIGCDIQNSVGSGIKSDSTLINQVEVG
         170       180       190       200       210       220     

             160       170       180       190       200       210 
mKIAA1 QGDASTVVRDDCVSALAVISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTSEETVDKPPAHSKV
       . . . .:..::::.:. ::::::::::.:::::::::::::::.:...:::: :.::::
gi|126 EDSEDLLVKNDCVSTLTGISSGTDEFRSDNDTNWDPQKEFIQFLITNDDTVDKAPVHSKV
         230       240       250       260       270       280     

             220       230       240       250       260       270 
mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
        ::::::::::::::::::::::.:::. .:.:::.:.:::. :::..:::::..:.::.
gi|126 -GLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCVPNKSKMLEVDFMEQNEDVQAIDSRTYALSQ
          290       300       310       320       330       340    

             280       290       300       310       320       330 
mKIAA1 VKPESAGGDLESVDTFQHLVYNSDKCGEDNSPVHTRTLISNTLKKKCEESDPESPVAFST
       ::::::  :::::::::::..::::::::.::::: :..:::::::::::: ::::.:::
gi|126 VKPESADEDLESVDTFQHLIFNSDKCGEDSSPVHTSTFLSNTLKKKCEESDSESPVTFST
          350       360       370       380       390       400    

             340       350       360       370       380       390 
mKIAA1 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
          410       420       430       440       450       460    

             400       410       420       430       440       450 
mKIAA1 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
          470       480       490       500       510       520    

             460       470       480       490       500       510 
mKIAA1 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAAVKCPVVSSEVTQRKTQKKTSVKDSVIGSSKKPA
       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:::.:.::::.::. .:: ::::::: :
gi|126 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAVVKCPIVSSDVVQRKTHKKAFMKDPVIGSSKKSA
          530       540       550       560       570       580    

             520       530       540       550       560       570 
mKIAA1 TYLCKMCPFTTSARSILKKHTEYLHSSACVDSFGNPLGLDKRKNDSLEESVDVDSTKSLA
       ::.:::::::::..::.::: ::::::.:.::::.::::::::.: .:: .:.:: : :.
gi|126 TYICKMCPFTTSVKSIFKKHMEYLHSSSCIDSFGSPLGLDKRKSDIIEEPIDTDSPKPLT
          590       600       610       620       630       640    

             580       590       600       610       620       630 
mKIAA1 KQQPSTFPKNSALKQDAKRTFGSSSQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSIAQSGVNSCSQNKS
       ::: .:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:
gi|126 KQQSTTFPKNSALKQDVKRTFGSSSQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSIAQSGVNVCSQNSS
          650       660       670       680       690       700    

             640       650       660       670       680       690 
mKIAA1 PHKNVMVKSSTDQQPKYFHQAPREKPNARADSSYLYRHKYNNYRTIRKSGDSYPLPFKKE
       :::.::.::: ::.::::::. .:: ::.:.:.:::::::.::: :.:::.:::: ::::
gi|126 PHKTVMIKSSIDQKPKYFHQTAKEKSNAKANSNYLYRHKYENYRMIKKSGESYPLHFKKE
          710       720       730       740       750       760    

              700         710       720       730       740        
mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSSNSHN--FISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-E
        ..:::::::::::::::  :::::::.::::::. :::.:::::::.: ::::::.: :
gi|126 EASSLNSLHLFSSSNSHNNSFISDPHNSDTKRPEGFKDHRRVAVKRVVKESKKESSVGGE
          770       780       790       800       810       820    

       750       760        770       780       790       800      
mKIAA1 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLSQ
       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.::::::::::::::..:.:.: :..:
gi|126 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLNSTEKKDSYETEDESSWDNVELGDYTTQTIEDETYHDINQ
          830       840       850       860       870       880    

        810       820       830       840       850       860      
mKIAA1 EHVNLLPLFKSKIEGQGPGDSAALSYDQNDGFYFEYYEDGGTNSFLQDIHDPQHLENPET
       ::::..::::::.:::  :..:.::::::::::::::::::::.::..::::::::: ::
gi|126 EHVNIFPLFKSKVEGQQSGENATLSYDQNDGFYFEYYEDGGTNNFLHEIHDPQHLENAET
          890       900       910       920       930       940    

        870       880       890       900       910       920      
mKIAA1 PLSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 ALSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQI
          950       960       970       980       990      1000    

        930       940       950       960       970       980      
mKIAA1 ATSDKMQHFKRTGNGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRL
       :::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 ATSDKMQHFKRTGTGTPIKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRL
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

        990      1000      1010      1020      1030      1040      
mKIAA1 GKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNSRRIIPRPFVAQKLSSGDDFLSHNVLP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:
gi|126 GKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNSRRIIPRPFVAQKLASSDDFLSQNVIP
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

       1050      1060      1070      1080      1090      1100      
mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
       :. :.:::::::::::::::::: ::.:  : :::::::.::::::::::::..:.:::.
gi|126 LEAYRNGLKTEALSVSASEEEGLSFLNEYDETKPELPSGKKNQSLTLIELLKNKRMGEEK
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

       1110      1120      1130      1140      1150      1160      
mKIAA1 NSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSGS
       ::.:::.: :::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::.:::::::::::::
gi|126 NSSVSPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDFTMHSALDCKQKKSRSRSGS
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

       1170      1180      1190      1200      1210      1220      
mKIAA1 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|126 KKKLLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

       1230      1240         
mKIAA1 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
       :::::::::::::::::::::::
gi|126 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
         1310      1320       

>>gi|45946796|gb|AAH63683.2| ZNF644 protein [Homo sapien  (1319 aa)
 initn: 5812 init1: 2965 opt: 7159  Z-score: 7589.3  bits: 1416.5 E():    0
Smith-Waterman score: 7159;  84.517% identity (95.052% similar) in 1253 aa overlap (2-1249:68-1319)

                                            10        20        30 
mKIAA1                              TEELSEDQSEQALSGGQSALFLPASTPAVPT
                                     ::::.:.::.:::::::.::. :..:.: .
gi|459 NNFISDKESGVHKPKDCQTSFQKNNTLTLPEELSKDKSENALSGGQSSLFIHAGAPTVSS
        40        50        60        70        80        90       

              40        50        60        70        80        90 
mKIAA1 ENFPLTTAPVGKGPVSCSSSTKTSNMNEGSVSLTPGQPADQLAAESCSTLKAAADHQLST
       ::: :  . . .:::: :: :::::::.:::::: :::.:: ..:::::::.::: ::::
gi|459 ENFILPKGAAVNGPVSHSSLTKTSNMNKGSVSLTTGQPVDQPTTESCSTLKVAADLQLST
       100       110       120       130       140       150       

             100       110       120       130       140       150 
mKIAA1 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKVPTSALVGCDVQNSVGNNMKSESTLLSQAEVG
       ::::::::::::::::::::::::: ::.:::: ::::.:::::.:.::..::..:.:::
gi|459 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSNKKLPTSASVGCDIQNSVGSNIKSDGTLINQVEVG
       160       170       180       190       200       210       

             160       170       180       190       200       210 
mKIAA1 QGDASTVVRDDCVSALAVISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTSEETVDKPPAHSKV
       .   . .:.::::.... :::::: :::::::::::::::::::::.:::::: : :::.
gi|459 EDGEDLLVKDDCVNTVTGISSGTDGFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTNEETVDKAPPHSKI
       220       230       240       250       260       270       

             220       230       240       250       260       270 
mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
        ::::::::::::::::::::::.:::. .:.:::. .:::: ::::.::.:::.:.:::
gi|459 -GLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCVPNKSKMQEVDFLEQNEELQAVDSQKYALSK
        280       290       300       310       320       330      

             280       290       300       310       320       330 
mKIAA1 VKPESAGGDLESVDTFQHLVYNSDKCGEDNSPVHTRTLISNTLKKKCEESDPESPVAFST
       :::::.  ::::::.::::.:: :::::..::::: :..:::::::::::: :::..:::
gi|459 VKPESTDEDLESVDAFQHLIYNPDKCGEESSPVHTSTFLSNTLKKKCEESDSESPATFST
        340       350       360       370       380       390      

             340       350       360       370       380       390 
mKIAA1 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|459 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
        400       410       420       430       440       450      

             400       410       420       430       440       450 
mKIAA1 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|459 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
        460       470       480       490       500       510      

             460       470       480       490       500       510 
mKIAA1 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAAVKCPVVSSEVTQRKTQKKTSVKDSVIGSSKKPA
       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:...:::::::: .::::.::::: :
gi|459 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAVVKCPMVTSDIAQRKTQKKTFMKDSVVGSSKKSA
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mKIAA1 TYLCKMCPFTTSARSILKKHTEYLHSSACVDSFGNPLGLDKRKNDSLEESVDVDSTKSLA
       ::.::::::::::.:.:::::::::::.::::::.:::::::::: ::: :: ::::.:.
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mKIAA1 KQQPSTFPKNSALKQDAKRTFGSSSQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSIAQSGVNSCSQNKS
       ::: .:::::::::::.::::::.::::.:::.:::::::::::::::::::: :.::.:
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mKIAA1 PHKNVMVKSSTDQQPKYFHQAPREKPNARADSSYLYRHKYNNYRTIRKSGDSYPLPFKKE
       ::::: .:::.::.::::::: .:: ::.:.: :::::::.::: :.:::.:::. ::::
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mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSS-NSHN-FISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-E
        ..::::::::::: :::: ::::::. :.::::. :::.::::::: : ::::::.: :
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mKIAA1 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLSQ
       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.:::::::::::::::.:.:.:::..:
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mKIAA1 EHVNLLPLFKSKIEGQGPGDSAALSYDQNDGFYFEYYEDGGTNSFLQDIHDPQHLENPET
       :::::.::::::.::: ::..:.:::::::::::::::: :.:.::..::::::::. ..
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mKIAA1 PLSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.::.:
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mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
       :. :.::::::::::::::::::.::.:  : :::::::.::::::::::::..:.::::
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mKIAA1 NSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSGS
       :::.::.: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::
gi|459 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
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>>gi|56404958|sp|Q9H582.2|ZN644_HUMAN RecName: Full=Zinc  (1327 aa)
 initn: 5812 init1: 2965 opt: 7159  Z-score: 7589.3  bits: 1416.5 E():    0
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                                     ::::.:.::.:::::::.::. :..:.: .
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       ::: :  . . .:::: :: :::::::.:::::: :::.:: ..:::::::.::: ::::
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       ::::::::::::::::::::::::: ::.:::: ::::.:::::.:.::..::..:.:::
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       .   . .:.::::.... :::::: :::::::::::::::::::::.:::::: : :::.
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        ::::::::::::::::::::::.:::. .:.:::. .:::: ::::.::.:::.:.:::
gi|564 -GLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCVPNKSKMQEVDFLEQNEELQAVDSQKYALSK
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mKIAA1 VKPESAGGDLESVDTFQHLVYNSDKCGEDNSPVHTRTLISNTLKKKCEESDPESPVAFST
       :::::.  ::::::.::::.:: :::::..::::: :..:::::::::::: :::..:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:...:::::::: .::::.::::: :
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       ::.::::::::::.:.:::::::::::.::::::.:::::::::: ::: :: ::::.:.
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       ::: .:::::::::::.::::::.::::.:::.:::::::::::::::::::: :.::.:
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       ::::: .:::.::.::::::: .:: ::.:.: :::::::.::: :.:::.:::. ::::
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mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSS-NSHN-FISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-E
        ..::::::::::: :::: ::::::. :.::::. :::.::::::: : ::::::.: :
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mKIAA1 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLSQ
       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.:::::::::::::::.:.:.:::..:
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       :::::.::::::.::: ::..:.:::::::::::::::: :.:.::..::::::::. ..
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        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|564 ATSDKMQHFKRTGTGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRL
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.::.:
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mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
       :. :.::::::::::::::::::.::.:  : :::::::.::::::::::::..:.::::
gi|564 LEAYRNGLKTEALSVSASEEEGLNFLNEYDETKPELPSGKKNQSLTLIELLKNKRMGEER
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       :::.::.: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
gi|564 NSAISPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDLTMHSALDCKQKKSRSRSGS
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mKIAA1 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|564 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
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mKIAA1 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
       :::::::::::::::::::::::
gi|564 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
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>>gi|152012475|gb|AAI50178.1| ZNF644 protein [Homo sapie  (1326 aa)
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Smith-Waterman score: 7146;  84.517% identity (94.972% similar) in 1253 aa overlap (2-1249:76-1326)

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                                     ::::.:.::.:::::::.::. :..:.: .
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mKIAA1 ENFPLTTAPVGKGPVSCSSSTKTSNMNEGSVSLTPGQPADQLAAESCSTLKAAADHQLST
       ::: :  . . .:::: :: :::::::.:::::: :::.:: ..:::::::.::: ::::
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mKIAA1 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKVPTSALVGCDVQNSVGNNMKSESTLLSQAEVG
       ::::::::::::::::::::::::: ::.:::: ::::.:::::.:.::..::..:.:::
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mKIAA1 QGDASTVVRDDCVSALAVISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTSEETVDKPPAHSKV
       .   . .:.::::.... :::::: :::::::::::::::::::::.:::::: : :::.
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mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
        ::::::::::::::::::::::.:::. .:.::: .::::: ::::.::.:::.:.:::
gi|152 -GLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCVPNKSK-MQVDFLEQNEELQAVDSQKYALSK
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mKIAA1 VKPESAGGDLESVDTFQHLVYNSDKCGEDNSPVHTRTLISNTLKKKCEESDPESPVAFST
       :::::.  ::::::.::::.:: :::::..::::: :..:::::::::::: :::..:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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mKIAA1 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:...:::::::: .::::.::::: :
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       ::.::::::::::.:.:::::::::::.::::::.:::::::::: ::: :: ::::.:.
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mKIAA1 KQQPSTFPKNSALKQDAKRTFGSSSQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSIAQSGVNSCSQNKS
       ::: .:::::::::::.::::::.::::.:::.:::::::::::::::::::: :.::.:
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mKIAA1 PHKNVMVKSSTDQQPKYFHQAPREKPNARADSSYLYRHKYNNYRTIRKSGDSYPLPFKKE
       ::::: .:::.::.::::::: .:: ::.:.: :::::::.::: :.:::.:::. ::::
gi|152 PHKNVTIKSSVDQKPKYFHQAAKEKSNAKANSHYLYRHKYENYRMIKKSGESYPVHFKKE
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mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSS-NSHN-FISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-E
        ..::::::::::: :::: ::::::. :.::::. :::.::::::: : ::::::.: :
gi|152 EASSLNSLHLFSSSSNSHNNFISDPHKPDAKRPESFKDHRRVAVKRVIKESKKESSVGGE
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mKIAA1 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLSQ
       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.:::::::::::::::.:.:.:::..:
gi|152 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLNSAEKKDSYETEDESSWDNVELGDYTTQAIEDETYSDINQ
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mKIAA1 EHVNLLPLFKSKIEGQGPGDSAALSYDQNDGFYFEYYEDGGTNSFLQDIHDPQHLENPET
       :::::.::::::.::: ::..:.:::::::::::::::: :.:.::..::::::::. ..
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        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|152 SLSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQI
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.::.:
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mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
       :. :.::::::::::::::::::.::.:  : :::::::.::::::::::::..:.::::
gi|152 LEAYRNGLKTEALSVSASEEEGLNFLNEYDETKPELPSGKKNQSLTLIELLKNKRMGEER
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mKIAA1 NSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSGS
       :::.::.: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::
gi|152 NSAISPQKIHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDLTMHSALDCKQKKSRSRSGS
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mKIAA1 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|152 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
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mKIAA1 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
       : :::::::::::::::::::::
gi|152 SPLKKPASITETSFSLLMAEAAS
          1310      1320      

>>gi|73959578|ref|XP_853224.1| PREDICTED: similar to zin  (1327 aa)
 initn: 5554 init1: 2961 opt: 7129  Z-score: 7557.5  bits: 1410.6 E():    0
Smith-Waterman score: 7129;  84.609% identity (94.976% similar) in 1254 aa overlap (2-1249:76-1327)

                                            10        20        30 
mKIAA1                              TEELSEDQSEQALSGGQSALFLPASTPAVPT
                                     ::::.:.::.:::::::.::. :..:.: .
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       ::: :  . . .:::: :: .:::.::.:::::: :::.:: ..::::.::.: : ::::
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mKIAA1 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKVPTSALVGCDVQNSVGNNMKSESTLLSQAEVG
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.:::::...::.:::..:.:::
gi|739 PQKASQHQVLFLLSDVAHAKNPTHSIKKLPTSASVGCDIQNSVGSSIKSDSTLINQVEVG
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mKIAA1 QGDASTVVRDDCVSALAVISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTSEETVDKPPAHSKV
       . . . .:.::::..:. ::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :.::::
gi|739 EDSDDLLVKDDCVDTLTGISSGTDEFRSENDTNWDPQKEFIQFLMTNEDTVDKAPVHSKV
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mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
        ::::::::::::::::::::::.:::.  :.:::.:.:::: ::::.::::::.:.:::
gi|739 -GLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCFSDSNCIPNKSKMLEVDFLEQNEELQAIDSQKYALSK
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mKIAA1 VKPESAGGDLESVDTFQHLVYNSDKCGEDNSPVHTRTLISNTLKKKCEESDPESPVAFST
       :::::.  ::::::.::::.:: ::::: .::::: :..:::::::::::: :::..:::
gi|739 VKPESTDEDLESVDAFQHLIYNPDKCGEGSSPVHTSTFLSNTLKKKCEESDSESPATFST
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mKIAA1 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 EEPSFYPCTKCNVNFREKKHLHRHMMYHLDGNSHFRHLNVPRPYACRECGRTFRDRNSLL
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mKIAA1 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
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mKIAA1 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAAVKCPVVSSEVTQRKTQKKTSVKDSVIGSSKKPA
       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:.:.:::::::: .::::.::::: :
gi|739 YCCEECNFMAVTENELECHRGIAHGAVVKCPIVNSDVAQRKTQKKTFMKDSVVGSSKKSA
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mKIAA1 TYLCKMCPFTTSARSILKKHTEYLHSSACVDSFGNPLGLDKRKNDSLEESVDVDSTKSLA
       ::.::::::::::::::::: ::::::.::::::.::::::::.: ::: .:.:.:: : 
gi|739 TYICKMCPFTTSARSILKKHMEYLHSSSCVDSFGSPLGLDKRKSDILEEPIDIDGTKPLI
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mKIAA1 KQQPSTFPKNSALKQDAKRTFGSSSQSSNFSKFHKRPHRIQKARKSIAQSGVNSCSQNKS
       ::: .:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::.:
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mKIAA1 PHKNVMVKSSTDQQPKYFHQAPREKPNARADSSYLYRHKYNNYRTIRKSGDSYPLPFKKE
        ::.: .:::.::.::::::: .:: ::.:.:.:::::::.::: :.:::.:::: ::::
gi|739 -HKTVTIKSSSDQKPKYFHQAAKEKSNAKANSNYLYRHKYENYRMIKKSGESYPLHFKKE
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mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSS-NSHN--FISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-
        ..::::::::::: ::::  :::: .:.::::::. :.:.:::::::.: ::::::.: 
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mKIAA1 EDLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLS
       :::::::::::::::::::::.: .:::::::::.:::::::::::::::::.:.:.:..
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mKIAA1 QEHVNLLPLFKSKIEGQGPGDSAALSYDQNDGFYFEYYEDGGTNSFLQDIHDPQHLENPE
       ::::::.::::::.:.: ::..:.::::::::::::::::.:::.::.:::: ::::: :
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mKIAA1 TPLSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQ
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 IATSDKMQHFKRTGTGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.
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mKIAA1 PLDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEE
       ::. :.:::::::::::::::::: ::.:  : :::::::.::::::::::::..:.:::
gi|739 PLEAYRNGLKTEALSVSASEEEGLSFLNEYDETKPELPSGKKNQSLTLIELLKNKRMGEE
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mKIAA1 RNSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSG
       :::..::.: :::::::::::::::::.:::::.::::.::::::::.::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::
gi|739 TSLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
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>>gi|194035754|ref|XP_001927170.1| PREDICTED: similar to  (1381 aa)
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       ::  :  . . .:::: .: :::...:.:::::: :::.:: :.:::::::.:::  :: 
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       ::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.:::::...::::::. ..:::
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       .   . .:.:::::::. :::::::::::::.::::::::::::.:.:.:::  :.:::.
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mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
        ::::::::::::::::::::::.:::. .:::::. .:::. ::::.::::::.:..::
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       ::::::  :::::..::::.:. ::::::.::::: :..::.::::::::: :::..:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:::...:::::::: .:::::::::: :
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mKIAA1 TYLCKMCPFTTSARSILKKHTEYLHSSACVDSFGNPLGLDKRKNDSLEESVDVDSTKSLA
       .:.::::::::::::::::::::::::.: ::.:.::::::::.: ::: .:.:: : :.
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       :.: .:::::::::::.: :::.:::.::::::::::::.::::::::::::: :: :.:
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       :...: ...: ::.::::::: .:: ::.:.:.:::::::.::: :.:::.:::: ::::
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mKIAA1 -VNSLNSLHLFSSSNS--HNFISDPHNADTKRPENEKDHKRVAVKRVAKASKKESSAG-E
         .::::::::::::.  ..:::::::.::::::. :::.::::::::: ::::::.: :
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mKIAA1 DLDSYPDFLHKMTVVVLQKLHS-DKKDSYETEDDSSWDNVELGDYTTQAMEEEAYSDLSQ
       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.::::::::::::::..:.:.: :...
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       :::.:.::::.:.::: ::..:.::::::::::::::::.:.:.::..::::::::: ::
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mKIAA1 PLSKHSSVFHWTDLSLEKKSCPYCPATFETGVGLSNHVRGHLHRAGLSYEARHVVSPEQI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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mKIAA1 ATSDKMQHFKRTGNGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRL
       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|194 ATSDKMQHFKRTGTGTPVKRVRKAIEKSETTSEHTCQLCGGWFDTKIGLSNHVRGHLKRL
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mKIAA1 GKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNSRRIIPRPFVAQKLSSGDDFLSHNVLP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:
gi|194 GKTKWDAHKSPICVLNEMMQNEEKYEKILKALNSRRIIPRPFVAQKLASNDDFLSQNVIP
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mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
       :. :.:::::::::::::::::: ::.:  : :::::::.::::::::::::..:.::::
gi|194 LEAYRNGLKTEALSVSASEEEGLSFLNEYDETKPELPSGKKNQSLTLIELLKNKRMGEER
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mKIAA1 NSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSGS
       :..:::.: :.:::::::::::::::::::::.:::::::.:::::.:::::::::::::
gi|194 NTSVSPQKIHSQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLMYQPQKMDFTMHSALDCKQKKSRSRSGS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|194 KKKMLTLPHGADEVYILRCRFCGLVFRGPLSVQEDWIKHLQRHIVNANLPRTGAGMVEVT
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mKIAA1 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
       :::::::::::::::::::::::
gi|194 SLLKKPASITETSFSLLMAEAAS
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>>gi|50657087|dbj|BAD32777.1| Zinc finger motif Enhancer  (1232 aa)
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       .   . .:.::::.... :::::: :::::::::::::::::::::.:::::: : :::.
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        :::::::::: :::::::::::.:::. .:.:::. .:::: ::::.::.:::.:.:::
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       :::::.  ::::::.::::.:: :::::..::::: :..:::::::::::: :::..:::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:...:::::::: .::::.::::: :
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       ::.::::::::::.:.:::::::::::.::::::.:::::::::: ::: :: ::::.:.
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       ::: .:::::::::::.::::::.::::.:::.:::::::::::::::::::: :.::.:
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       ::::: .:::.::.::::::: .:: ::.:.: :::::::.::: :.:::.:::. ::::
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        ..::::::::::: :::: ::::::. :.::::. :::.::::::: : ::::::.: :
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       ::::::::::::::::::::.: .:::::::::.:::::::::::::::.:.:.:::..:
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        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:.::.:
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mKIAA1 LDEYHNGLKTEALSVSASEEEGLHFLSECGERKPELPSGRKNQSLTLIELLKSRRLGEER
        . :.::::::::::::::::::.::.:  : :::::::.::::::::::::..:.::::
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mKIAA1 NSAVSPHKTHNQTARKRFVQKCVLPLNEDSPLIYQPQKMDLTMHSAIDCKQKKSRSRSGS
       :::.::.: :::::::::::::::::::::::.::::::::::::..             
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mKIAA1                              TEELSEDQSEQALSGGQSALFLPASTPAVPT
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       . . . .:.::::..:. ::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :.::::
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mKIAA1 VGLEKKRKRKMDVSKITRYTEDCYSDSGRAPGKSKILQVDFLGQNEEMQAIDSQNYTLSK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
gi|739 KHMIIHQERRQKLMEEIRELKELQDEGRSARLQCPQCVFGTNCPKTFVQHAKTHEKDKRY
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       ::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:.:.:::::::: .::::.::::: :
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       ::.::::::::::::::::: ::::::.::::::.::::::::.: ::: .:.:.:: : 
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       ::: .:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::.:
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]